ஹை-சி அடிப்படையிலான ஜீனோம் அசெம்பிளி
ஹை-சி என்பது குரோமோசோம் உள்ளமைவைப் பிடிக்க வடிவமைக்கப்பட்ட ஒரு முறையாகும். இந்த இடைவினைகளின் தீவிரம் குரோமோசோம்களில் உள்ள உடல் தூரத்துடன் எதிர்மறையாக தொடர்புடையதாக நம்பப்படுகிறது. எனவே, ஹை-சி தரவு ஒரு வரைவு மரபணுவில் கூடியிருந்த வரிசைகளின் கிளஸ்டரிங், வரிசைப்படுத்துதல் மற்றும் நோக்குநிலை ஆகியவற்றை வழிகாட்டவும், குறிப்பிட்ட எண்ணிக்கையிலான குரோமோசோம்களில் அவற்றைத் தொகுக்கவும் பயன்படுத்தப்படுகிறது. மக்கள்தொகை அடிப்படையிலான மரபணு வரைபடம் இல்லாத நிலையில், இந்த தொழில்நுட்பம் குரோமோசோம் அளவிலான மரபணு கூட்டத்தை மேம்படுத்துகிறது. ஒவ்வொரு மரபணுவிற்கும் ஹை-சி தேவை.
சேவை அம்சங்கள்
● PE150 உடன் Illumina NovaSeq இல் வரிசைப்படுத்துதல்.
● பிரித்தெடுக்கப்பட்ட நியூக்ளிக் அமிலங்களுக்குப் பதிலாக, ஃபார்மால்டிஹைடுடன் குறுக்கு இணைப்பு மற்றும் டிஎன்ஏ-புரத தொடர்புகளைப் பாதுகாக்க, திசு மாதிரிகள் தேவைப்படுகின்றன.
● ஹை-சி பரிசோதனையானது பயோட்டின் மூலம் ஒட்டும் முனைகளை கட்டுப்படுத்துதல் மற்றும் முடிவடைந்ததைச் சரிசெய்வதை உள்ளடக்கியது. டிஎன்ஏ ஸ்ட்ரெப்டாவிடின் மணிகளால் கீழே இழுக்கப்பட்டு, அடுத்தடுத்த நூலகத் தயாரிப்பிற்காக சுத்திகரிக்கப்படுகிறது.
சேவை நன்மைகள்
Hi-C இன் கண்ணோட்டம்
(லிபர்மேன்-ஐடன் இ மற்றும் பலர்.,அறிவியல், 2009)
●மரபணு மக்கள்தொகை தரவுக்கான தேவையை நீக்குதல்:ஹை-சி கான்டிக் ஆங்கரிங் செய்ய தேவையான அத்தியாவசிய தகவலை மாற்றுகிறது.
●உயர் குறிப்பான் அடர்த்தி:90% க்கு மேல் அதிக கான்டிக் ஆங்கரிங் விகிதத்திற்கு வழிவகுக்கிறது.
●விரிவான நிபுணத்துவம் மற்றும் வெளியீடு பதிவுகள்:1000 வெவ்வேறு இனங்கள் மற்றும் பல்வேறு காப்புரிமைகளில் இருந்து 2000 க்கும் மேற்பட்ட ஹை-சி ஜீனோம் அசெம்பிளி வழக்குகளுடன் BMKGene பரந்த அனுபவத்தைக் கொண்டுள்ளது. 200 க்கும் மேற்பட்ட வெளியிடப்பட்ட வழக்குகள் 2000 க்கும் அதிகமான தாக்கக் காரணியைக் கொண்டுள்ளன.
●மிகவும் திறமையான உயிர் தகவலியல் குழு:ஹை-சி சோதனைகள் மற்றும் தரவு பகுப்பாய்வுக்கான உள் காப்புரிமைகள் மற்றும் மென்பொருள் பதிப்புரிமைகளுடன், சுய-மேம்படுத்தப்பட்ட காட்சிப்படுத்தல் தரவு மென்பொருள் கையேடு பிளாக் நகர்த்துதல், மாற்றியமைத்தல், திரும்பப் பெறுதல் மற்றும் மீண்டும் செய்தல் ஆகியவற்றை செயல்படுத்துகிறது.
●விற்பனைக்கு பிந்தைய ஆதரவு:எங்கள் அர்ப்பணிப்பு 3 மாத விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைக் காலத்துடன் திட்ட நிறைவுக்கு அப்பால் நீண்டுள்ளது. இந்த நேரத்தில், முடிவுகள் தொடர்பான ஏதேனும் கேள்விகளுக்குத் தீர்வு காண திட்டப் பின்தொடர்தல், சரிசெய்தல் உதவி மற்றும் கேள்விபதில் அமர்வுகளை நாங்கள் வழங்குகிறோம்.
●விரிவான சிறுகுறிப்பு: அடையாளம் காணப்பட்ட மாறுபாடுகளுடன் மரபணுக்களை செயல்பாட்டு ரீதியாக சிறுகுறிப்பு செய்வதற்கும் அதனுடன் தொடர்புடைய செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வைச் செய்வதற்கும் பல தரவுத்தளங்களைப் பயன்படுத்துகிறோம்.
சேவை விவரக்குறிப்புகள்
| நூலக தயாரிப்பு | வரிசைப்படுத்துதல் உத்தி | பரிந்துரைக்கப்பட்ட தரவு வெளியீடு | தரக் கட்டுப்பாடு |
| ஹை-சி நூலகம் | Illumina NovaSeq PE150 | 100x | Q30 ≥ 85% |
மாதிரி தேவைகள்
| திசு | தேவையான அளவு |
| விலங்கு உள்ளுறுப்பு | ≥ 2 கிராம் |
| விலங்கு தசை | |
| பாலூட்டிகளின் இரத்தம் | ≥ 2 மி.லி |
| கோழி/மீன் இரத்தம் | |
| செடி - புதிய இலை | ≥ 3 கிராம் |
| வளர்ப்பு செல்கள் | ≥ 1x107 |
| பூச்சி | ≥ 2 கிராம் |
சேவை வேலை ஓட்டம்
சோதனை வடிவமைப்பு
மாதிரி விநியோகம்
நூலக கட்டுமானம்
வரிசைப்படுத்துதல்
தரவு பகுப்பாய்வு
விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைகள்
1) மூல தரவு QC
2) Hi-C நூலகம் QC: செல்லுபடியாகும் Hi-C தொடர்புகளின் மதிப்பீடு
3) ஹை-சி அசெம்பிளி: குழுக்களில் கான்டிஜ்களை கிளஸ்டரிங் செய்தல், அதைத் தொடர்ந்து ஒவ்வொரு குழுவிற்குள்ளும் வரிசைப்படுத்துதல் மற்றும் கான்டிஜ் நோக்குநிலையை ஒதுக்குதல்
4) ஹை-சி மதிப்பீடு
Hi-C நூலகம் QC - Hi-C செல்லுபடியாகும் தொடர்பு ஜோடிகளின் மதிப்பீடு
ஹை-சி சட்டசபை - புள்ளிவிவரங்கள்
பிந்தைய அசெம்பிளி மதிப்பீடு - தொட்டிகளுக்கு இடையே சமிக்ஞை தீவிரத்தின் வெப்ப வரைபடம்
BMKGene இன் Hi-C அசெம்பிளி சேவைகள் மூலம் மேம்படுத்தப்பட்ட வெளியீடுகளின் தொகுப்பின் மூலம் எளிதாக்கப்பட்ட முன்னேற்றங்களை ஆராயுங்கள்.
தியான், டி. மற்றும் பலர். (2023) 'ஜீனோம் அசெம்பிளி அண்ட் ஜெனெடிக் டிசெக்ஷன் ஆஃப் எ ப்ரமினென்ட் வறட்சி-எதிர்ப்பு மக்காச்சோள கிருமி', நேச்சர் ஜெனிடிக்ஸ் 2023 55:3, 55(3), பக். 496–506. doi: 10.1038/s41588-023-01297-y.
வாங், ZL மற்றும் பலர். (2020) 'ஏ க்ரோமோசோம்-ஸ்கேல் அசெம்பிளி ஆஃப் தி ஏசியன் ஹனிபீ அபிஸ் செரானா ஜீனோம்', ஃபிரான்டியர்ஸ் இன் ஜெனெடிக்ஸ், 11, ப. 524140. doi: 10.3389/FGENE.2020.00279/BIBTEX.
ஜாங், எஃப். மற்றும் பலர். (2023) 'சோலனேசி குடும்பத்தில் இரண்டு மரபணுக்களை பகுப்பாய்வு செய்வதன் மூலம் ட்ரோபேன் ஆல்கலாய்டு உயிரியக்கவியல் பரிணாமத்தை வெளிப்படுத்துதல்', நேச்சர் கம்யூனிகேஷன்ஸ் 2023 14:1, 14(1), பக். 1–18. doi: 10.1038/s41467-023-37133-4.
ஜாங், எக்ஸ். மற்றும் பலர். (2020) 'ஆலமரம் மற்றும் மகரந்தச் சேர்க்கை குளவியின் மரபணுக்கள் ஃபிக்-வாஸ்ப் கோவலுஷன் பற்றிய நுண்ணறிவுகளை வழங்குகின்றன', செல், 183(4), பக். 875-889.e17. doi: 10.1016/J.CELL.2020.09.043
