ஒப்பீட்டு மரபியல்
சேவை நன்மைகள்
●விரிவான நிபுணத்துவம் மற்றும் வெளியீடு பதிவுகள்: திரட்சியுடன், BMKGene 90 க்கும் மேற்பட்ட ஒப்பீட்டு மரபியல் திட்டங்களை நிறைவு செய்துள்ளது, ஒட்டுமொத்த தாக்கக் காரணி 900 ஐ எட்டியுள்ளது.
●விரிவான உயிர் தகவலியல் பகுப்பாய்வு: பகுப்பாய்வுத் தொகுப்பில் பொதுவாகத் தேவைப்படும் எட்டு பகுப்பாய்வுகள் உள்ளன, இது நன்கு வடிவமைக்கப்பட்ட, வெளியிடத் தயாராக இருக்கும் புள்ளிவிவரங்களை வழங்குகிறது மற்றும் முடிவுகளை எளிதாகப் புரிந்துகொள்ள அனுமதிக்கிறது.
●மிகவும் திறமையான உயிர் தகவலியல் குழு மற்றும் குறுகிய பகுப்பாய்வு சுழற்சி: ஒப்பீட்டு மரபியல் பகுப்பாய்வில் சிறந்த அனுபவத்துடன், BMKGene இன் குழு பல்வேறு தனிப்பயனாக்கப்பட்ட பகுப்பாய்வு கோரிக்கைகளை குறுகிய காலத்தில் நிறைவேற்றுகிறது.
●விற்பனைக்கு பிந்தைய ஆதரவு:எங்கள் அர்ப்பணிப்பு 3 மாத விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைக் காலத்துடன் திட்ட நிறைவுக்கு அப்பால் நீண்டுள்ளது. இந்த நேரத்தில், முடிவுகள் தொடர்பான ஏதேனும் கேள்விகளுக்குத் தீர்வு காண திட்டப் பின்தொடர்தல், சரிசெய்தல் உதவி மற்றும் கேள்விபதில் அமர்வுகளை நாங்கள் வழங்குகிறோம்.
சேவை விவரக்குறிப்புகள்
| மதிப்பிடப்பட்ட திருப்ப நேரம் | இனங்களின் எண்ணிக்கை | பகுப்பாய்வு செய்கிறது |
| 30 வேலை நாட்கள் | 6 - 12 | மரபணு குடும்ப கிளஸ்டரிங் மரபணு குடும்ப விரிவாக்கம் மற்றும் சுருக்கம் பைலோஜெனடிக் மரம் கட்டுமானம் மாறுபட்ட நேர மதிப்பீடு (புதைபடிவ அளவுத்திருத்தம் தேவை) LTR செருகும் நேரம் (தாவரங்களுக்கு) முழு மரபணு நகல் (தாவரங்களுக்கு) தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட அழுத்தம் ஒத்திசைவு பகுப்பாய்வு |
உயிர் தகவலியல் பகுப்பாய்வு
● மரபணு குடும்பம்
● பைலோஜெனெடிக்ஸ்
● வேறுபாடு நேரம்
● தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட அழுத்தம்
● ஒத்திசைவு பகுப்பாய்வு
மாதிரி தேவைகள் மற்றும் விநியோகம்
மாதிரி தேவைகள்:
மரபணு வரிசைப்படுத்தல் மற்றும் அசெம்பிளிக்கான திசு அல்லது டிஎன்ஏ
திசுக்களுக்கு
| இனங்கள் | திசு | சர்வே | PacBio CCS |
| விலங்கு | உள்ளுறுப்பு திசு | 0.5 ~ 1 கிராம் | ≥ 3.5 கிராம் |
| தசை திசு | |||
| ≥ 5.0 கிராம் | |||
| ≥ 5.0 மி.லி | |||
| பாலூட்டிகளின் இரத்தம் | |||
| ≥ 0.5 மி.லி | |||
| கோழி/மீன் இரத்தம் | |||
| ஆலை | புதிய இலை | 1 ~ 2 கிராம் | ≥ 5.0 கிராம் |
| இதழ்/தண்டு | 1 ~ 2 கிராம் | ≥ 10.0 கிராம் | |
| வேர்/விதை | 1 ~ 2 கிராம் | ≥ 20.0 கிராம் | |
| செல்கள் | வளர்ப்பு செல் | - | ≥ 1 x 108 |
தரவு
நெருங்கிய தொடர்புடைய இனங்களின் மரபணு வரிசை கோப்புகள்(.ஃபாஸ்டா) மற்றும் சிறுகுறிப்பு கோப்புகள் (.gff3)
சேவை வேலை ஓட்டம்
சோதனை வடிவமைப்பு
மாதிரி விநியோகம்
நூலக கட்டுமானம்
வரிசைப்படுத்துதல்
தரவு பகுப்பாய்வு
விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைகள்
*இங்கே காட்டப்பட்டுள்ள டெமோ முடிவுகள் அனைத்தும் பயோமார்க்கர் டெக்னாலஜிஸ் மூலம் வெளியிடப்பட்ட மரபணுக்களிலிருந்து வந்தவை
1.எல்டிஆர் செருகும் நேர மதிப்பீடு: மற்ற உயிரினங்களுடன் ஒப்பிடும்போது, வெய்னிங் கம்பு மரபணுவில் எல்டிஆர்-ஆர்டிகள் செருகும் நேரங்களின் தனித்துவமான இருவகைப் பரவலைப் படம் காட்டுகிறது. மிக சமீபத்திய சிகரம் சுமார் 0.5 மில்லியன் ஆண்டுகளுக்கு முன்பு தோன்றியது.
லி குவாங் மற்றும் பலர்.,இயற்கை மரபியல், 2021
2.சயோட் (Sechium edule) மீது பைலோஜெனி மற்றும் மரபணு குடும்ப பகுப்பாய்வு : சாயோட் மற்றும் மரபணு குடும்பத்தில் உள்ள மற்ற 13 தொடர்புடைய இனங்களை பகுப்பாய்வு செய்வதன் மூலம், சாயோட் பாம்பு சுண்டைக்காய் (ட்ரைகோசாந்தஸ் ஆங்குனா) உடன் மிக நெருங்கிய தொடர்புடையது என கண்டறியப்பட்டது. 27-45 மியாவில் பாம்பு பூசணியிலிருந்து பெறப்பட்ட சாயோட் மற்றும் முழு மரபணு நகல் (WGD) 25±4 மியாவில் சாயோட்டில் காணப்பட்டது, இது குகுபிடேசியில் மூன்றாவது WGD நிகழ்வாகும்.
ஃபூ ஏ மற்றும் பலர்.,தோட்டக்கலை ஆராய்ச்சி, 2021
3. சின்டெனி பகுப்பாய்வு: பழ வளர்ச்சியில் பைட்டோஹார்மோன்கள் தொடர்பான சில மரபணுக்கள் சாயோட், பாம்புக்காய் மற்றும் ஸ்குவாஷ் ஆகியவற்றில் காணப்பட்டன. சாயோட் மற்றும் ஸ்குவாஷ் இடையே உள்ள தொடர்பு சாயோட் மற்றும் பாம்பு பூசணிக்கு இடையே உள்ளதை விட சற்று அதிகமாக உள்ளது.
ஃபூ ஏ மற்றும் பலர்.,தோட்டக்கலை ஆராய்ச்சி, 2021
4.மரபணு குடும்ப பகுப்பாய்வு: G.thurberi மற்றும் G.davidsonii மரபணுக்களில் மரபணு குடும்ப விரிவாக்கம் மற்றும் சுருக்கம் மீதான KEGG செறிவூட்டல் ஸ்டீராய்டு உயிரியக்கவியல் மற்றும் பிராசினோஸ்டீராய்டு உயிரியக்கவியல் தொடர்பான மரபணுக்கள் விரிவாக்கப்பட்டதைக் காட்டுகிறது.
யாங் இசட் மற்றும் பலர்.,BMC உயிரியல், 2021
5.முழு மரபணு நகல் பகுப்பாய்வு: 4DTV மற்றும் Ks விநியோக பகுப்பாய்வு முழு மரபணு நகல் நிகழ்வைக் காட்டுகிறது. இன்ட்ராஸ்பெசிஸின் சிகரங்கள் நகல் நிகழ்வுகளைக் காட்டுகின்றன. இனவகை நிகழ்வுகளைக் காட்டியுள்ள இடையினங்களின் உச்சங்கள். மற்ற மூன்று நெருங்கிய தொடர்புடைய உயிரினங்களுடன் ஒப்பிடுகையில், O. யூரோபியா மிக சமீபத்தில் ஒரு பெரிய அளவிலான மரபணு நகல் மூலம் சென்றது என்று பகுப்பாய்வு சுட்டிக்காட்டியது.
ராவ் ஜி மற்றும் பலர்.தோட்டக்கலை ஆராய்ச்சி, 2021
BMK வழக்கு
முட்கள் இல்லாத ரோஜா: ஈரப்பதம் தழுவலுடன் இணைக்கப்பட்ட மரபணு நுண்ணறிவு
வெளியிடப்பட்டது: தேசிய அறிவியல் ஆய்வு, 2021
வரிசைப்படுத்தும் உத்தி:
'பஸ்யே'ஸ்முள்ளில்லாதது' (ஆர்.விச்சுரைனன்) மரபணு:
தோராயமாக 93 X PacBio + தோராயமாக. 90 X நானோபூர் + 267 X இல்லுமினா
முக்கிய முடிவுகள்
1.உயர்தரமான R.wichuraiana மரபணு நீண்ட-படிப்பு வரிசைமுறை நுட்பங்களைப் பயன்படுத்தி கட்டமைக்கப்பட்டது, இது 530.07 Mb இன் அசெம்பிளியை அளிக்கிறது (கணிக்கப்பட்ட மரபணு அளவு ஓட்டம் சைட்டோமெட்ரி மூலம் தோராயமாக 525.9 Mb மற்றும் மரபணு ஆய்வு மூலம் 525.5). BUSCO மதிப்பிடப்பட்ட மதிப்பெண் 93.9%. "Old blush" (haploOB) உடன் ஒப்பிடுகையில், இந்த மரபணுவின் தரம் மற்றும் முழுமை அடிப்படை ஒற்றை-அடிப்படை துல்லியம் மற்றும் LTR அசெம்பிளி இன்டெக்ஸ் (LAI=20.03) மூலம் உறுதிப்படுத்தப்பட்டது. R.wichurayana மரபணுவில் 32,674 புரத குறியீட்டு மரபணுக்கள் உள்ளன.
2. மல்டி-ஓமிக்ஸ் கூட்டு பகுப்பாய்வு, ஒப்பீட்டு மரபியல், டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக்ஸ், மரபணு மக்கள்தொகையின் QTL பகுப்பாய்வு ஆகியவற்றை உள்ளடக்கியது, ஆர். மேலும், QTL இல் தொடர்புடைய மரபணுக்களின் வெளிப்பாடு மாறுபாடு தண்டு முள் வடிவத்துடன் தொடர்புடையதாக இருக்கலாம்.
Basye;s Thornless மற்றும் Rosa chinensis ஆகியவற்றுக்கு இடையேயான ஒப்பீட்டு மரபியல் பகுப்பாய்வு, synteny analysis, gene family cluster, expansion and contraction analysis உட்பட, ரோஜாக்களில் உள்ள முக்கியமான பண்புகளுடன் தொடர்புடைய ஏராளமான மாறுபாடுகளை வெளிப்படுத்தியது. NAC மற்றும் FAR1/FRS மரபணு குடும்பத்தில் உள்ள தனித்துவமான விரிவாக்கம் கரும்புள்ளிக்கு எதிர்ப்புடன் தொடர்புடையதாக இருக்கலாம்.
BT மற்றும் haploOB மரபணுக்களுக்கு இடையிலான ஒப்பீட்டு மரபியல் பகுப்பாய்வு.
ஜாங், எம்., மற்றும் பலர். "முட்கள் இல்லாத ரோஜா: ஈரப்பதம் தழுவலுடன் இணைக்கப்பட்ட மரபணு நுண்ணறிவு"தேசிய அறிவியல் ஆய்வு, 2021;, nwab092.
