தககி மற்றும் பலர், தி பிளான்ட் ஜர்னல், 2013
● துல்லியமான உள்ளூர்மயமாக்கல்: பின்னணி இரைச்சலைக் குறைக்க 30+30 முதல் 200+200 நபர்களுடன் புலிகளை கலத்தல்; ஒத்திசைவற்ற பிறழ்வு அடிப்படையிலான வேட்பாளர் பிராந்திய கணிப்பு.
Analysis விரிவான பகுப்பாய்வு: என்ஆர், சுவிஸ்பிரோட், ஜிஓ, கெக், கோக், கோக் போன்ற ஆழமான வேட்பாளர் மரபணு செயல்பாடு சிறுகுறிப்பு.
Turn வேகமான திருப்புமுனை நேரம்: 45 வேலை நாட்களுக்குள் விரைவான மரபணு உள்ளூர்மயமாக்கல்.
● விரிவான அனுபவம்: பயிர்கள், நீர்வாழ் பொருட்கள், காடு, பூக்கள், பழங்கள் போன்ற பல்வேறு உயிரினங்களை உள்ளடக்கிய ஆயிரக்கணக்கான பண்புகளில் உள்ளூர்மயமாக்கல், பி.எம்.கே பங்களித்தது.
மக்கள் தொகை:
எதிரெதிர் பினோடைப்களுடன் பெற்றோரின் சந்ததியினரைப் பிரித்தல்.
எ.கா. எஃப் 2 வம்சாவளி, பேக் கிராசிங் (கி.மு), மறுசீரமைப்பு இன்பிரெட் லைன் (ஆர்ஐஎல்)
கலக்கும் குளம்
தரமான பண்புகளுக்கு: 30 முதல் 50 நபர்கள் (குறைந்தபட்சம் 20)/மொத்தமாக
அளவு டிராடிஸுக்கு: முழு மக்கள்தொகையிலும் தீவிர பினோடைப்களைக் கொண்ட முதல் 5% முதல் 10% நபர்கள் (குறைந்தபட்சம் 30+30).
பரிந்துரைக்கப்பட்ட தொடர்ச்சியான ஆழம்
குறைந்தது 20x/பெற்றோர் மற்றும் 1x/சந்ததி தனிநபர் (எ.கா. 30+30 தனிநபரின் சந்ததி கலவை குளத்திற்கு, வரிசைப்படுத்தும் ஆழம் மொத்தத்திற்கு 30x ஆக இருக்கும்)
Genelan முழு மரபணு ஒத்திசைவு
Saction தரவு செயலாக்கம்
● எஸ்.என்.பி/இன்டெல் அழைப்பு
● வேட்பாளர் பிராந்திய ஸ்கிரீனிங்
● வேட்பாளர் மரபணு செயல்பாடு சிறுகுறிப்பு
நியூக்ளியோடைடுகள்:
ஜி.டி.என்.ஏ மாதிரி | திசு மாதிரி |
செறிவு: ≥30 ng/μl | தாவரங்கள்: 1-2 கிராம் |
தொகை: ≥2 μg (Volumn ≥15 μl) | விலங்குகள்: 0.5-1 கிராம் |
தூய்மை: OD260/280 = 1.6-2.5 | முழு இரத்தம்: 1.5 மில்லி |
1. வேட்பாளர் பிராந்தியத்தை அடையாளம் காண யூக்ளிடியன் தூரம் (ED) மீது அசோசியேஷன் பகுப்பாய்வு அடிப்படை. பின்வரும் படத்தில்
எக்ஸ்-அச்சு: குரோமோசோம் எண்; ஒவ்வொரு புள்ளியும் ஒரு SNP இன் ED மதிப்பைக் குறிக்கிறது. கருப்பு வரி பொருத்தப்பட்ட ED மதிப்புக்கு ஒத்திருக்கும். அதிக ED மதிப்பு தளத்திற்கும் பினோடைப்பிற்கும் இடையில் மிகவும் குறிப்பிடத்தக்க தொடர்பைக் குறிக்கிறது. சிவப்பு கோடு கோடு குறிப்பிடத்தக்க சங்கத்தின் வாசலைக் குறிக்கிறது.
2. அசோசியேஷன் பகுப்பாய்வு NO SNP-INDEX ஐ அடிப்படையாகக் கொண்டது
எக்ஸ்-அச்சு: குரோமோசோம் எண்; ஒவ்வொரு புள்ளியும் SNP-Index மதிப்பைக் குறிக்கிறது. பிளாக் லைன் பொருத்தப்பட்ட எஸ்.என்.பி-இன்டெக்ஸ் மதிப்பைக் குறிக்கிறது. பெரிய மதிப்பு, சங்கம் மிகவும் குறிப்பிடத்தக்கதாகும்.
பி.எம்.கே வழக்கு
முக்கிய விளைவு அளவு பண்பு லோகஸ் fnl7.1 வெள்ளரிக்காயில் பழக் கழுத்து நீளத்துடன் தொடர்புடைய தாமதமான கருவளையங்கள் ஏராளமான புரதத்தை குறியீடாக்குகிறது
வெளியிடப்பட்டது: தாவர பயோடெக்னாலஜி ஜர்னல், 2020
வரிசைப்படுத்துதல் உத்தி:
பெற்றோர் (JIN5-508, YN): 34 × மற்றும் 20 for க்கு முழு மரபணு ஒத்திசைவு.
டி.என்.ஏ குளங்கள் (50 நீண்ட கழுத்து மற்றும் 50 குறுகிய கழுத்து): 61 × மற்றும் 52 fre க்கு மறுமொழி
முக்கிய முடிவுகள்
இந்த ஆய்வில், மக்கள்தொகை (எஃப் 2 மற்றும் எஃப் 2: 3) நீண்ட கழுத்து வெள்ளரி வரி ஜின் 5-508 மற்றும் குறுகிய கழுத்து ஒய்.என் ஆகியவற்றைக் கடப்பதன் மூலம் உருவாக்கப்பட்டது. இரண்டு டி.என்.ஏ குளங்கள் 50 தீவிர நீண்ட கழுத்து நபர்கள் மற்றும் 50 தீவிர குறுகிய கழுத்து நபர்களால் கட்டப்பட்டன. BSA பகுப்பாய்வு மற்றும் பாரம்பரிய QTL மேப்பிங் மூலம் CHR07 இல் முக்கிய விளைவு QTL அடையாளம் காணப்பட்டது. வேட்பாளர் பகுதி நன்றாக-மேப்பிங், மரபணு வெளிப்பாடு அளவீடு மற்றும் டிரான்ஸ்ஜெனிக் சோதனைகள் மூலம் மேலும் குறைக்கப்பட்டது, இது கழுத்து நீளத்தைக் கட்டுப்படுத்துவதில் முக்கிய மரபணுவை வெளிப்படுத்தியது, CSFNL7.1. கூடுதலாக, CSFNL7.1 ஊக்குவிப்பு பிராந்தியத்தில் பாலிமார்பிசம் தொடர்புடைய வெளிப்பாட்டுடன் தொடர்புடையது என்று கண்டறியப்பட்டது. மேலும் பைலோஜெனடிக் பகுப்பாய்வு FNL7.1 லோகஸ் இந்தியாவில் இருந்து தோன்றியிருக்க வாய்ப்புள்ளது.
![]() வெள்ளரி கழுத்து நீளத்துடன் தொடர்புடைய வேட்பாளர் பகுதியை அடையாளம் காண பிஎஸ்ஏ பகுப்பாய்வில் க்யூடிஎல்-மேப்பிங் | ![]() Chr07 இல் அடையாளம் காணப்பட்ட வெள்ளரி கழுத்து நீள QTL இன் LOD சுயவிவரங்கள் |
சூ, எக்ஸ்., மற்றும் பலர். "முக்கிய விளைவு அளவு பண்பு லோகஸ் FNL7.1 வெள்ளரிக்காயில் பழக் கழுத்து நீளத்துடன் தொடர்புடைய தாமதமான கருவளையங்கள் ஏராளமான புரதத்தை குறியீடாக்குகிறது." தாவர பயோடெக்னாலஜி ஜர்னல் 18.7 (2020).