Exclusive Agency for Korea

தயாரிப்புகள்

BMKMANU S1000 ஸ்பேஷியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம்

ஸ்பேஷியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக்ஸ் அறிவியல் கண்டுபிடிப்புகளில் முன்னணியில் நிற்கிறது, அவற்றின் இடஞ்சார்ந்த சூழலைப் பாதுகாக்கும் போது திசுக்களுக்குள் உள்ள சிக்கலான மரபணு வெளிப்பாடு வடிவங்களை ஆராய ஆராய்ச்சியாளர்களுக்கு அதிகாரம் அளிக்கிறது. பல்வேறு தளங்களுக்கு மத்தியில், BMKGene BMKManu S1000 ஸ்பேஷியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் சிப்பை உருவாக்கியுள்ளதுமேம்படுத்தப்பட்ட தீர்மானம்5µM, துணை செல்லுலார் வரம்பை அடைந்து, செயல்படுத்துகிறதுபல நிலை தெளிவுத்திறன் அமைப்புகள். S1000 சிப், ஏறக்குறைய 2 மில்லியன் புள்ளிகளைக் கொண்டுள்ளது. ஸ்பேஷியல் பார்கோடுகளால் செறிவூட்டப்பட்ட ஒரு cDNA நூலகம், S1000 சிப்பில் இருந்து தயாரிக்கப்பட்டு, பின்னர் Illumina NovaSeq இயங்குதளத்தில் வரிசைப்படுத்தப்படுகிறது. இடஞ்சார்ந்த பார்கோடு செய்யப்பட்ட மாதிரிகள் மற்றும் UMIகளின் கலவையானது உருவாக்கப்பட்ட தரவின் துல்லியம் மற்றும் தனித்துவத்தை உறுதி செய்கிறது. BMKManu S1000 சிப்பின் தனித்துவமான பண்பு அதன் பன்முகத்தன்மையில் உள்ளது, இது பல நிலை தெளிவுத்திறன் அமைப்புகளை வழங்குகிறது, அவை வெவ்வேறு திசுக்கள் மற்றும் விவரங்களின் நிலைகளுக்கு நன்றாக டியூன் செய்யப்படலாம். இந்த ஏற்புத்திறன் சிப்பை பல்வேறு இடவியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக்ஸ் ஆய்வுகளுக்கு ஒரு சிறந்த தேர்வாக நிலைநிறுத்துகிறது, குறைந்த சத்தத்துடன் துல்லியமான இடஞ்சார்ந்த கிளஸ்டரிங்கை உறுதி செய்கிறது.

BMKManu S1000 சிப் மற்றும் பிற இடஞ்சார்ந்த டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக்ஸ் தொழில்நுட்பங்களைப் பயன்படுத்தி, உயிரணுக்களின் இடஞ்சார்ந்த அமைப்பு மற்றும் திசுக்களுக்குள் நிகழும் சிக்கலான மூலக்கூறு இடைவினைகள் ஆகியவற்றை ஆராய்ச்சியாளர்கள் நன்கு புரிந்து கொள்ள முடியும். புற்றுநோயியல், நரம்பியல், வளர்ச்சி உயிரியல், நோயெதிர்ப்பு மற்றும் தாவரவியல் ஆய்வுகள்.

இயங்குதளம்: BMKManu S1000 சிப் மற்றும் Illumina NovaSeq

எங்களை தொடர்பு கொள்ளவும்

சேவை விவரங்கள்

உயிர் தகவலியல்

டெமோ முடிவுகள்

சிறப்பு வெளியீடுகள்

BMKMANU S1000 ஸ்பேஷியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் டெக்னிக்கல் ஸ்கீம்

அம்சங்கள்

● தீர்மானம்: 5 µM

● ஸ்பாட் விட்டம்: 2.5 µM

● இடங்களின் எண்ணிக்கை: தோராயமாக 2 மில்லியன்

● 3 சாத்தியமான பிடிப்பு பகுதி வடிவங்கள்: 6.8 மிமீ * 6.8 மிமீ, 11 மிமீ * 11 மிமீ அல்லது 15 மிமீ * 20 மிமீ

● ஒவ்வொரு பார்கோடு செய்யப்பட்ட மணிகளிலும் 4 பிரிவுகளைக் கொண்ட ப்ரைமர்கள் ஏற்றப்படுகின்றன:

mRNA ப்ரைமிங் மற்றும் cDNA தொகுப்புக்கான பாலி(dT) வால்

பெருக்க சார்புகளை சரிசெய்ய தனித்த மூலக்கூறு அடையாளங்காட்டி (UMI).

இடஞ்சார்ந்த பார்கோடு

பகுதி வாசிப்பு 1 சீக்வென்சிங் ப்ரைமரின் பிணைப்பு வரிசை

● H&E மற்றும் பிரிவுகளின் ஃப்ளோரசன்ட் கறை

● பயன்படுத்த சாத்தியம்செல் பிரிவு தொழில்நுட்பம்: H&E ஸ்டைனிங், ஃப்ளோரசன்ட் ஸ்டைனிங் மற்றும் ஆர்என்ஏ சீக்வென்சிங் ஆகியவற்றின் ஒருங்கிணைப்பு ஒவ்வொரு கலத்தின் எல்லைகளையும் தீர்மானிக்கவும், ஒவ்வொரு கலத்திற்கும் மரபணு வெளிப்பாட்டை சரியாக ஒதுக்கவும்.

BMKMANU S1000 இன் நன்மைகள்

●துணை செல்லுலார் தீர்மானம்: ஒவ்வொரு பிடிப்புப் பகுதியிலும் > 2 மில்லியன் ஸ்பேஷியல் பார்கோடு இடங்கள் 2.5 µm விட்டம் மற்றும் ஸ்பாட் சென்டர்களுக்கு இடையே 5 µm இடைவெளி உள்ளது, இது துணை செல்லுலார் தெளிவுத்திறனுடன் (5 µm) இடஞ்சார்ந்த டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் பகுப்பாய்வை செயல்படுத்துகிறது.

●பல நிலை தெளிவுத்திறன் பகுப்பாய்வு:பல்வேறு திசு அம்சங்களை உகந்த தெளிவுத்திறனில் தீர்க்க 100 μm முதல் 5 μm வரையிலான நெகிழ்வான பல-நிலை பகுப்பாய்வு.

●“ஒரு ஸ்லைடில் மூன்று” செல் பிரிவு தொழில்நுட்பத்தைப் பயன்படுத்துவதற்கான சாத்தியம்:ஒரே ஸ்லைடில் ஃப்ளோரசன்ஸ் ஸ்டைனிங், எச்&இ ஸ்டைனிங் மற்றும் ஆர்என்ஏ சீக்வென்சிங் ஆகியவற்றை இணைத்து, எங்களின் "த்ரீ-இன்-ஒன்" பகுப்பாய்வு அல்காரிதம், அடுத்தடுத்த செல் அடிப்படையிலான டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக்ஸிற்கான செல் எல்லைகளை அடையாளம் காண உதவுகிறது.

●பல வரிசைமுறை இயங்குதளங்களுடன் இணக்கமானது: NGS மற்றும் நீண்ட வாசிப்பு வரிசைமுறை இரண்டும் கிடைக்கும்.

●1-8 ஆக்டிவ் கேப்சர் ஏரியாவின் நெகிழ்வான வடிவமைப்பு: கைப்பற்றும் பகுதியின் அளவு நெகிழ்வானது, 3 வடிவங்களைப் பயன்படுத்த முடியும் (6.8 மிமீ * 6.8 மிமீ., 11 மிமீ * 11 மிமீ மற்றும் 15 மிமீ * 20 மிமீ)

●ஒரு நிறுத்த சேவை: இது கிரையோ-பிரிவு, ஸ்டைனிங், டிஷ்யூ ஆப்டிமைசேஷன், ஸ்பேஷியல் பார்கோடிங், லைப்ரரி தயாரிப்பு, சீக்வென்சிங் மற்றும் பயோ-இன்ஃபர்மேடிக்ஸ் உள்ளிட்ட அனைத்து அனுபவம் மற்றும் திறன் சார்ந்த படிகளை ஒருங்கிணைக்கிறது.

●விரிவான பயோ-இன்ஃபர்மேடிக்ஸ் மற்றும் முடிவுகளின் பயனர் நட்பு காட்சிப்படுத்தல்:தொகுப்பில் 29 பகுப்பாய்வுகள் மற்றும் 100+ உயர்தர புள்ளிவிவரங்கள் உள்ளன, மேலும் செல் பிளவு மற்றும் ஸ்பாட் க்ளஸ்டரிங் காட்சிப்படுத்த மற்றும் தனிப்பயனாக்க உள்நாட்டில் உருவாக்கப்பட்ட மென்பொருளைப் பயன்படுத்துகிறது.

●தனிப்பயனாக்கப்பட்ட தரவு பகுப்பாய்வு மற்றும் காட்சிப்படுத்தல்: பல்வேறு ஆராய்ச்சி கோரிக்கைகளுக்கு கிடைக்கும்

●மிகவும் திறமையான தொழில்நுட்பக் குழு: மனித, சுட்டி, பாலூட்டி, மீன் மற்றும் தாவரங்கள் உட்பட 250 க்கும் மேற்பட்ட திசு வகைகள் மற்றும் 100+ இனங்களில் அனுபவம் கொண்டவர்.

●முழு திட்டத்திற்கான நிகழ்நேர புதுப்பிப்புகள்: சோதனை முன்னேற்றத்தின் முழு கட்டுப்பாட்டுடன்.

●ஒற்றை செல் எம்ஆர்என்ஏ வரிசைமுறையுடன் கூடிய விருப்ப கூட்டு பகுப்பாய்வு

சேவை விவரக்குறிப்புகள்

மாதிரி

தேவைகள்

நூலகம்

வரிசைப்படுத்தும் உத்தி

தரவு பரிந்துரைக்கப்படுகிறது

தரக் கட்டுப்பாடு

OCT-உட்பொதிக்கப்பட்ட கிரையோ மாதிரிகள், ஒரு மாதிரிக்கு 3 தொகுதிகள்

S1000 cDNA நூலகம்

இல்லுமினா PE150 (பிற இயங்குதளங்கள் உள்ளன)

100 uMக்கு 100K PE படிக்கிறது

(60-150 ஜிபி)

RIN>7

மாதிரி தயாரிப்பு வழிகாட்டுதல் மற்றும் சேவை பணிப்பாய்வு பற்றிய கூடுதல் விவரங்களுக்கு, தயவு செய்து தயங்காமல் பேசவும்BMKGENE நிபுணர்

சேவை வேலை ஓட்டம்

மாதிரி தயாரிப்பு கட்டத்தில், உயர்தர ஆர்என்ஏவைப் பெறுவதை உறுதி செய்வதற்காக ஆரம்ப மொத்த ஆர்என்ஏ பிரித்தெடுத்தல் சோதனை செய்யப்படுகிறது. திசு உகப்பாக்கம் கட்டத்தில், பிரிவுகள் படிந்து காட்சிப்படுத்தப்படுகின்றன மற்றும் திசுக்களில் இருந்து எம்ஆர்என்ஏ வெளியீட்டிற்கான ஊடுருவல் நிலைகள் உகந்ததாக இருக்கும். மேம்படுத்தப்பட்ட நெறிமுறை நூலகக் கட்டுமானத்தின் போது பயன்படுத்தப்படுகிறது, அதைத் தொடர்ந்து வரிசைப்படுத்துதல் மற்றும் தரவு பகுப்பாய்வு.

முழுமையான சேவை பணிப்பாய்வு நிகழ்நேர புதுப்பிப்புகள் மற்றும் வாடிக்கையாளர் உறுதிப்படுத்தல்களை உள்ளடக்கியது, இது ஒரு பதிலளிக்கக்கூடிய பின்னூட்ட வளையத்தை பராமரிக்கிறது, இது சுமூகமான திட்டத்தை செயல்படுத்துவதை உறுதி செய்கிறது.

முந்தைய: 10x ஜெனோமிக்ஸ் விசியம் ஸ்பேஷியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம்

அடுத்து: தாவர/விலங்கு முழு ஜீனோம் வரிசைமுறை

BMKMANU S1000 ஆல் உருவாக்கப்பட்ட தரவு "BSTMatrix" மென்பொருளைப் பயன்படுத்தி பகுப்பாய்வு செய்யப்படுகிறது, இது BMKGENE ஆல் சுயாதீனமாக வடிவமைக்கப்பட்டு, ஒரு மரபணு வெளிப்பாடு மேட்ரிக்ஸை உருவாக்குகிறது. அங்கிருந்து, தரவு தரக் கட்டுப்பாடு, உள்-மாதிரி பகுப்பாய்வு மற்றும் இடை-குழு பகுப்பாய்வு ஆகியவற்றை உள்ளடக்கிய ஒரு நிலையான அறிக்கை உருவாக்கப்படுகிறது.

● தரவு தரக் கட்டுப்பாடு:
தரவு வெளியீடு மற்றும் தரமான மதிப்பெண் விநியோகம்
ஒரு இடத்திற்கு மரபணு கண்டறிதல்
திசு கவரேஜ்
● உள்-மாதிரி பகுப்பாய்வு:
மரபணு வளம்
குறைக்கப்பட்ட பரிமாண பகுப்பாய்வு உட்பட ஸ்பாட் கிளஸ்டரிங்
க்ளஸ்டர்களுக்கிடையேயான வேறுபாடு வெளிப்பாடு பகுப்பாய்வு: மார்க்கர் மரபணுக்களின் அடையாளம்
மார்க்கர் மரபணுக்களின் செயல்பாட்டு சிறுகுறிப்பு மற்றும் செறிவூட்டல்
● குழுக்களுக்கு இடையேயான பகுப்பாய்வு:
இரண்டு மாதிரிகள் (எ.கா. நோயுற்ற மற்றும் கட்டுப்பாடு) மற்றும் மறு கொத்து ஆகியவற்றிலிருந்து புள்ளிகளை மீண்டும் இணைத்தல்
ஒவ்வொரு கிளஸ்டருக்கான மார்க்கர் மரபணுக்களின் அடையாளம்
மார்க்கர் மரபணுக்களின் செயல்பாட்டு சிறுகுறிப்பு மற்றும் செறிவூட்டல்
குழுக்களிடையே ஒரே கிளஸ்டரின் மாறுபட்ட வெளிப்பாடு
கூடுதலாக, BMKGENE உருவாக்கிய “BSTViewer” என்பது பயனர் நட்புக் கருவியாகும், இது பயனருக்கு மரபணு வெளிப்பாட்டைக் காட்சிப்படுத்தவும் வெவ்வேறு தீர்மானங்களில் ஸ்பாட் க்ளஸ்டரிங் செய்யவும் உதவுகிறது.

BMKGene பயனர் நட்பு காட்சிப்படுத்தலுக்கான மென்பொருளை உருவாக்கியது

பல நிலை தெளிவுத்திறனில் BSTViewer ஸ்பாட் கிளஸ்டரிங்

BSTCellViewer: தானியங்கி மற்றும் கைமுறை செல் பிரித்தல்

உள்-மாதிரி பகுப்பாய்வு

ஸ்பாட் கிளஸ்டரிங்:

குறிப்பான் மரபணுக்கள் அடையாளம் மற்றும் இடஞ்சார்ந்த விநியோகம்:

குழுக்களுக்கு இடையேயான பகுப்பாய்வு

இரண்டு குழுக்களின் தரவு சேர்க்கை மற்றும் மறு கிளஸ்டர்:

புதிய கிளஸ்டர்களின் மார்க்கர் மரபணுக்கள்:

இந்த பிரத்யேக வெளியீட்டில் BMKManu S1000 தொழில்நுட்பத்துடன் BMKGene இன் ஸ்பேஷியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக்ஸ் சேவைகளால் எளிதாக்கப்பட்ட முன்னேற்றங்களை ஆராயுங்கள்:

பாடல், X. மற்றும் பலர். (2023) 'ஸ்பேஷியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக்ஸ், தக்காளி காலஸில் துளிர் மீளுருவாக்கம் செய்வதில் ஈடுபட்டுள்ள ஒளி-தூண்டப்பட்ட குளோரென்கிமா செல்களை வெளிப்படுத்துகிறது',அமெரிக்காவின் தேசிய அறிவியல் அகாடமியின் செயல்முறைகள், 120(38), ப. e2310163120. doi: 10.1073/pnas.2310163120

நீங்கள், ஒய். மற்றும் பலர். (2023) 'வரிசைமுறை அடிப்படையிலான இடஞ்சார்ந்த டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக் முறைகளின் முறையான ஒப்பீடு',bioRxiv, ப. 2023.12.03.569744. doi: 10.1101/2023.12.03.569744.