ஆம்ப்ளிகான் சீக்வென்சிங்(16S/18S/ITS)

ஆம்ப்ளிகான் (16S/18S/ITS) இல்லுமினாவுடன் வரிசைப்படுத்துதல் என்பது நுண்ணுயிர்களின் பன்முகத்தன்மையை பகுப்பாய்வு செய்யும் முறையாகும், இது நுண்ணுயிர் சுயவிவரங்களை அவற்றின் வரிசைகளின்படி அடையாளம் கண்டு, பின்னர் ஒவ்வொரு மாதிரியிலும் மாதிரிகளுக்கு இடையேயும் சமூக செழுமையையும் பன்முகத்தன்மையையும் புரிந்துகொள்ள முயற்சிக்கிறது. BMKCloud ஆம்ப்ளிகான் (NGS) பைப்லைன் 16S, 18S, ITS மற்றும் பல செயல்பாட்டு மரபணுக்களை பகுப்பாய்வு செய்ய அனுமதிக்கிறது. இது ரீட் டிரிம்மிங், ஜோடி-எண்ட் ரீட் அசெம்பிளி மற்றும் தர மதிப்பீட்டில் தொடங்குகிறது, அதைத் தொடர்ந்து ஆறு வெவ்வேறு பகுப்பாய்வு பிரிவுகளில் பயன்படுத்தப்படும் செயல்பாட்டு வகைபிரித்தல் அலகுகளை (OTUs) உருவாக்க ஒத்த வாசிப்புகளின் கிளஸ்டரிங். வகைபிரித்தல் சிறுகுறிப்பு ஒவ்வொரு மாதிரியின் ஒப்பீட்டு மிகுதி மற்றும் கலவை பற்றிய தகவல்களை வழங்குகிறது, அதே நேரத்தில் ஆல்பா மற்றும் பீட்டா பன்முகத்தன்மை பகுப்பாய்வுகள் முறையே மாதிரிகளுக்குள் மற்றும் இடையில் நுண்ணுயிர் பன்முகத்தன்மையில் கவனம் செலுத்துகின்றன. குழுக்களுக்கு இடையேயான வேறுபட்ட பகுப்பாய்வு அளவுரு மற்றும் அளவுரு அல்லாத சோதனைகளைப் பயன்படுத்தி வேறுபடும் OTU களைக் கண்டறிகிறது, அதே நேரத்தில் தொடர்பு பகுப்பாய்வு இந்த வேறுபாடுகளை சுற்றுச்சூழல் காரணிகளுடன் தொடர்புபடுத்துகிறது. இறுதியாக, செயல்பாட்டு மரபணு மிகுதியானது மார்க்கர் மரபணு மிகுதியின் அடிப்படையில் கணிக்கப்படுகிறது, இது ஒவ்வொரு மாதிரியிலும் செயல்பாடு மற்றும் சூழலியல் பற்றிய நுண்ணறிவை வழங்குகிறது.