16S/18S/ITS ஆம்ப்ளிகான் சீக்வென்சிங்-PacBio
சேவை அம்சங்கள்
● வரிசைப்படுத்தும் தளம்: PacBio Revio
● வரிசைமுறை முறை: CCS (HiFi படிக்கிறது)
● ஹைஃபை SMRT மணி நூலகம் தயாரிப்பதற்கு முன், இலக்குப் பகுதியின் பெருக்கம், அதைத் தொடர்ந்து ஆம்பிளிகான்களை இணைத்தல்
சேவை நன்மைகள்
●உயர் வகைபிரித்தல் தீர்மானம்: டிஹான் குறுகிய-ஆம்பிளிகான் வரிசைமுறை,இனங்கள் மட்டத்தில் அதிக OTU வகைப்பாடு விகிதங்களை செயல்படுத்துகிறது.
●மிகவும் துல்லியமான அடிப்படை அழைப்பு: PacBio CCS பயன்முறை வரிசைப்படுத்தல் (HiFi படிக்கிறது).
●தனிமைப்படுத்தல் இல்லாதது: சுற்றுச்சூழல் மாதிரிகளில் நுண்ணுயிர் கலவையின் விரைவான அடையாளம்.
●பரவலாக பொருந்தும்: பல்வேறு நுண்ணுயிர் சமூக ஆய்வுகள்.
●விரிவான உயிர் தகவல் பகுப்பாய்வு: சமீபத்திய QIIME2 தொகுப்பு (நுண்ணுயிர் சூழலியல் பற்றிய அளவு நுண்ணறிவு) தரவுத்தளம், சிறுகுறிப்பு, OTU/ASV ஆகியவற்றின் அடிப்படையில் பல்வேறு பகுப்பாய்வுகளுடன்.
●விரிவான நிபுணத்துவம்: ஆண்டுதோறும் நடத்தப்படும் ஆயிரக்கணக்கான ஆம்ப்ளிகான் சீக்வென்சிங் திட்டங்களுடன், BMKGENE ஒரு தசாப்தத்திற்கும் மேலான அனுபவம், மிகவும் திறமையான பகுப்பாய்வுக் குழு, விரிவான உள்ளடக்கம் மற்றும் சிறந்த விற்பனைக்குப் பிந்தைய ஆதரவைக் கொண்டுவருகிறது.
சேவை விவரக்குறிப்புகள்
| நூலகம் | வரிசைப்படுத்துதல் உத்தி | தரவு பரிந்துரைக்கப்படுகிறது |
| ஆம்ப்ளிகான் | PacBio Revio | 10/30/50 K குறிச்சொற்கள் (CCS) |
மாதிரி தேவைகள்
| செறிவு (ng/µL) | மொத்த தொகை (µg) | தொகுதி (µL) |
| ≥5 | ≥0.3 | ≥20 |
பரிந்துரைக்கப்பட்ட மாதிரி விநியோகம்
மாதிரிகளை திரவ நைட்ரஜனில் 3-4 மணி நேரம் உறைய வைத்து, திரவ நைட்ரஜனில் அல்லது -80 டிகிரி வரை நீண்ட கால இட ஒதுக்கீட்டில் சேமிக்கவும். உலர்-பனியுடன் கூடிய மாதிரி கப்பல் தேவை.
சேவை வேலை ஓட்டம்
மாதிரி விநியோகம்
நூலக கட்டுமானம்
வரிசைப்படுத்துதல்
தரவு பகுப்பாய்வு
விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைகள்
பின்வரும் பகுப்பாய்வு அடங்கும்:
●மூல தரவு தரக் கட்டுப்பாடு
●OTU கிளஸ்டரிங்/டி-இரைச்சல்(ASV)
●OTU சிறுகுறிப்பு
●ஆல்ஃபா பன்முகத்தன்மை பகுப்பாய்வு: ஷானன், சிம்ப்சன் மற்றும் ஏசிஇ உட்பட பல குறியீடுகள்.
●பீட்டா பன்முகத்தன்மை பகுப்பாய்வு
●குழுக்களுக்கு இடையேயான பகுப்பாய்வு
●தொடர்பு பகுப்பாய்வு: சுற்றுச்சூழல் காரணிகள் மற்றும் வெளிப்புற கலவை மற்றும் பன்முகத்தன்மை ஆகியவற்றுக்கு இடையே
●16S செயல்பாட்டு மரபணு கணிப்பு
வகைபிரித்தல் பரவலின் வரலாற்று வரைபடம்
சமூக விநியோகம் பைலோஜெனடிக் மரம்
ஆல்பா பன்முகத்தன்மை பகுப்பாய்வு: ACE
குறியீட்டு
பீட்டா பன்முகத்தன்மை பகுப்பாய்வு: பிசிஓஏ
இடைக்குழு பகுப்பாய்வு: ANOVA
BMKGene இன் ஆம்ப்ளிகான் சீக்வென்சிங் சேவைகள் PacBio மூலம் மேம்படுத்தப்பட்ட வெளியீடுகளின் தொகுப்பின் மூலம் எளிதாக்கப்பட்ட முன்னேற்றங்களை ஆராயுங்கள்.
காவோ, எக்ஸ். மற்றும் வாங், எச். (2023) 'ஆல்பைன் புல்வெளியில் இரண்டு வளரும் நிலைகளைக் கொண்ட அல்பைன் மெரினோ செம்மறியில் வெவ்வேறு பினாலஜிக்கு (ரெக்ரீன் வெர்சஸ். கிராஸி) தழுவலின் போது ரூமென் பாக்டீரியா சுயவிவரங்கள் மற்றும் செயல்பாடுகளின் ஒப்பீட்டு பகுப்பாய்வு', நொதித்தல், 9( 1), ப. 16. doi: 10.3390/FERMENTATION9010016/S1.
லி, எஸ். மற்றும் பலர். (2023) 'கலாச்சார அடிப்படையிலான மெட்டஜெனோமிக்ஸ் மற்றும் உயர்-தெளிவு பகுப்பாய்வுகளைப் பயன்படுத்தி பாலைவன மண்ணில் உள்ள நுண்ணுயிர் கருமைப் பொருளைப் பிடிப்பது', npj Biofilms மற்றும் Microbiomes 2023 9:1, 9(1), pp. 1–14. doi: 10.1038/s41522-023-00439-8.
மு, எல். மற்றும் பலர். (2022) 'கொழுப்பு அமில உப்புகள் நொதித்தல் பண்புகள், பாக்டீரியா பன்முகத்தன்மை மற்றும் அல்ஃப்ல்ஃபா, அரிசி வைக்கோல் மற்றும் கோதுமை தவிடு ஆகியவற்றுடன் தயாரிக்கப்பட்ட கலப்பு சிலேஜின் ஏரோபிக் நிலைத்தன்மை', உணவு மற்றும் விவசாய அறிவியல் இதழ், 102(4), பக். 1475– 1487. doi: 10.1002/JSFA.11482.
யாங், ஜே. மற்றும் பலர். (2023) 'ஆக்ஸிடேடிவ் ஸ்ட்ரெஸ் பயோமார்க்ஸர்களுக்கும் குட் மைக்ரோபயோட்டாவிற்கும் இடையிலான தொடர்பு, சோன்சஸ் பிராச்சியோடஸ் டிசியிலிருந்து எடுக்கப்பட்ட ஆக்ஸிஜனேற்ற விளைவுகளில். வயதுவந்த ஜீப்ராஃபிஷில் ஆக்சசோலோன் தூண்டப்பட்ட குடல் ஆக்ஸிஜனேற்ற அழுத்தத்தில், ஆக்ஸிஜனேற்றிகள் 2023, தொகுதி. 12, பக்கம் 192, 12(1), ப. 192. doi: 10.3390/ANTIOX12010192.
