16S/18S/ITS ஆம்ப்ளிகான் சீக்வென்சிங்-NGS
சேவை அம்சங்கள்
● வரிசைப்படுத்தல் தளம்: இல்லுமினா நோவாசெக்.
● 16S, 18S மற்றும் ITS இன் குறுகிய பகுதிகளின் பெருக்கம், மற்ற பெருக்க இலக்குகளில்.
● ஆம்ப்ளிகானின் நெகிழ்வான தேர்வுகள்.
● பல பெருக்க இலக்குகளுடன் முந்தைய திட்ட அனுபவம்.
சேவை நன்மைகள்
●தனிமைப்படுத்தல் இல்லாதது:சுற்றுச்சூழல் மாதிரிகளில் நுண்ணுயிர் கலவையின் விரைவான அடையாளம்.
●உயர் தெளிவுத்திறன்: சுற்றுச்சூழல் மாதிரிகளில் குறைந்த மிகுதியான கூறுகளில்.
●பரவலாக பொருந்தும்: பல்வேறு நுண்ணுயிர் சமூக ஆய்வுகள்.
●விரிவான உயிர் தகவலியல் பகுப்பாய்வு: சமீபத்திய QIIME2 தொகுப்பு (நுண்ணுயிர் சூழலியல் பற்றிய அளவு நுண்ணறிவு) தரவுத்தளம், சிறுகுறிப்பு, OTU/ASV ஆகியவற்றின் அடிப்படையில் பல்வேறு பகுப்பாய்வுகளுடன்.
●விரிவான நிபுணத்துவம்: ஆண்டுதோறும் நடத்தப்படும் 150 ஆயிரம் ஆம்ப்ளிகான் சீக்வென்சிங் திட்டங்களுடன், BMKGENE ஒரு தசாப்தத்திற்கும் மேலான அனுபவம், மிகவும் திறமையான பகுப்பாய்வுக் குழு, விரிவான உள்ளடக்கம் மற்றும் சிறந்த விற்பனைக்குப் பிந்தைய ஆதரவைக் கொண்டுவருகிறது.
சேவை விவரக்குறிப்புகள்
| நூலகம் | வரிசைப்படுத்துதல் உத்தி | தரவு பரிந்துரைக்கப்படுகிறது |
| ஆம்ப்ளிகான் | இல்லுமினா PE250 | 50/100/300K குறிச்சொற்கள் (சோடிகளைப் படிக்கவும்) |
சேவை தேவைகள்
| செறிவு (ng/µL) | மொத்த தொகை (என்ஜி) | தொகுதி (µL) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● மண்/சேறு: 1-2 கிராம்
● குடல் உள்ளடக்கம்-விலங்கு: 0.5-2 கிராம்
● குடல் உள்ளடக்கங்கள்-பூச்சி: 0.1-0.25 கிராம்
● தாவர மேற்பரப்பு (செறிவூட்டப்பட்ட வண்டல்): 0.1-0.5 கிராம்
● நொதித்தல் குழம்பு செறிவூட்டப்பட்ட வண்டல்: 0.1-0.5 கிராம்
● மலம் (பெரிய விலங்குகள்): 0.5-2 கிராம்
● மலம் (சுட்டி): 3-5 தானியங்கள்
● நுரையீரல் அல்வியோலர் லாவேஜ் திரவம்: வடிகட்டி காகிதம்
● பிறப்புறுப்பு ஸ்வாப்: 5-6 ஸ்வாப்ஸ்
● தோல் / பிறப்புறுப்பு துடைப்பான் / உமிழ்நீர் / வாய்வழி மென்மையான திசு / குரல்வளை ஸ்வாப் / மலக்குடல் ஸ்வாப்: 2-3 ஸ்வாப்
● மேற்பரப்பு நுண்ணுயிரிகள்: வடிகட்டி காகிதம்
● நீர்நிலை/காற்று/பயோஃபிலிம்: வடிகட்டி காகிதம்
● எண்டோபைட்டுகள்: 1-2 கிராம்
● பல் தகடு: 0.5-1 கிராம்
சேவை வேலை ஓட்டம்
மாதிரி விநியோகம்
நூலக கட்டுமானம்
வரிசைப்படுத்துதல்
தரவு பகுப்பாய்வு
விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைகள்
பின்வரும் பகுப்பாய்வு அடங்கும்:
- மூல தரவு தரக் கட்டுப்பாடு
- OTU கிளஸ்டரிங் /டி-இரைச்சல்(ASV)
- OTU சிறுகுறிப்பு
- ஆல்பா பன்முகத்தன்மை பகுப்பாய்வு: ஷானன், சிம்ப்சன் மற்றும் ஏசிஇ உட்பட பல குறியீடுகள்.
- பீட்டா பன்முகத்தன்மை பகுப்பாய்வு
- குழுக்களுக்கு இடையேயான பகுப்பாய்வு
- தொடர்பு பகுப்பாய்வு: சுற்றுச்சூழல் காரணிகள் மற்றும் OUT கலவை மற்றும் பன்முகத்தன்மைக்கு இடையே
- 16S செயல்பாட்டு மரபணு கணிப்பு
வகைபிரித்தல் பரவலின் வரலாற்று வரைபடம்
வகைபிரித்தல் மிகுதியான கிளஸ்டரிங் வெப்ப வரைபடம்
ஆல்பா பன்முகத்தன்மை பகுப்பாய்வு: அரிதான வளைவு
பீட்டா பன்முகத்தன்மை பகுப்பாய்வு: என்எம்டிஎஸ்
இன்டர்குரூப் பகுப்பாய்வு: LEFSE பயோமார்க்கர் கண்டுபிடிப்பு
BMKGene இன் ஆம்ப்ளிகான் சீக்வென்சிங் சேவைகள் இல்லுமினாவுடன் இணைந்து வெளியிடப்பட்ட வெளியீடுகளின் மூலம் மேம்படுத்தப்பட்ட முன்னேற்றங்களை ஆராயுங்கள்.
டோங், சி. மற்றும் பலர். (2022) 'அசெம்பிளி, கோர் மைக்ரோபயோட்டா, அண்ட் ஃபங்க்ஷன் ஆஃப் தி ரைசோஸ்பியர் சோயில் அண்ட் பார்க் மைக்ரோபயோட்டா இன் யூகோமியா உல்மாய்ட்ஸ்', ஃபிரான்டியர்ஸ் இன் மைக்ரோபயாலஜி, 13. doi: 10.3389/FMICB.2022.855317/FMICB.
லி, ஒய். மற்றும் பலர். (2023) 'எலிகளில் கார்ட்னெரெல்லா வஜினலிஸ் தூண்டப்பட்ட பாக்டீரியா வஜினோசிஸ் சிகிச்சைக்கான செயற்கை பாக்டீரியா கூட்டமைப்பு மாற்று சிகிச்சை', மைக்ரோபயோம், 11(1), பக். 1–14. doi: 10.1186/s40168-023-01497-y
யாங், ஜே., ஃபூ, ஒய். மற்றும் லியு, எச். (2022) 'நில அடிப்படையிலான மூடிய உயிர் மறுஉருவாக்கம் வாழ்க்கை ஆதரவு பரிசோதனையின் போது சேகரிக்கப்பட்ட காற்று தூசியின் நுண்ணுயிரிகள் "லூனார் பேலஸ் 365"', சுற்றுச்சூழல் நுண்ணுயிரிகள், 17(1), பக். 1-20. doi: 10.1186/S40793-022-00399-0/FIGURES/8.
யின், எஸ். மற்றும் பலர். (2022) 'நைட்ரஜன் மாற்றம் தொடர்பான செயல்பாட்டு மரபணுக்களின் ஃபீட்ஸ்டாக் சார்ந்த ஏராளமாக, உரம் தயாரிப்பில் நைட்ரஜன் இழப்பைக் கட்டுப்படுத்துகிறது', பயோரிசோர்ஸ் டெக்னாலஜி, 361, ப. 127678. doi: 10.1016/J.BIORTECH.2022.127678.
