10x ஜெனோமிக்ஸ் விசியம் ஸ்பேஷியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம்
தொழில்நுட்ப திட்டம்
அம்சங்கள்
● தீர்மானம்: 100 µM
● ஸ்பாட் விட்டம்: 55 µM
● இடங்களின் எண்ணிக்கை: 4992
● பிடிப்பு பகுதி: 6.5 x 6.5 மிமீ
● ஒவ்வொரு பார்கோடு இடமும் 4 பிரிவுகளைக் கொண்ட ப்ரைமர்களால் ஏற்றப்படுகிறது:
- mRNA ப்ரைமிங் மற்றும் cDNA தொகுப்புக்கான பாலி(dT) வால்
- பெருக்க சார்புகளை சரிசெய்ய தனித்த மூலக்கூறு அடையாளங்காட்டி (UMI).
- இடஞ்சார்ந்த பார்கோடு
- பகுதி வாசிப்பு 1 சீக்வென்சிங் ப்ரைமரின் பிணைப்பு வரிசை
● பிரிவுகளின் H&E கறை
நன்மைகள்
●ஒரு நிறுத்த சேவை: கிரையோ-பிரிவு, ஸ்டைனிங், டிஷ்யூ ஆப்டிமைசேஷன், ஸ்பேஷியல் பார்கோடிங், லைப்ரரி தயாரிப்பு, சீக்வென்சிங் மற்றும் பயோ-இன்ஃபர்மேடிக்ஸ் உள்ளிட்ட அனைத்து அனுபவம் மற்றும் திறன் சார்ந்த படிகளை ஒருங்கிணைக்கிறது.
● அதிக திறன் கொண்ட தொழில்நுட்பக் குழு: மனித, சுட்டி, பாலூட்டி, மீன் மற்றும் தாவரங்கள் உட்பட 250 க்கும் மேற்பட்ட திசு வகைகள் மற்றும் 100+ இனங்களில் அனுபவம் கொண்டவர்.
●முழு திட்டத்திலும் நிகழ்நேர புதுப்பிப்பு: சோதனை முன்னேற்றத்தின் முழு கட்டுப்பாட்டுடன்.
●விரிவான தரநிலை உயிர் தகவலியல்:தொகுப்பில் 29 பகுப்பாய்வுகள் மற்றும் 100+ உயர்தர புள்ளிவிவரங்கள் உள்ளன.
●தனிப்பயனாக்கப்பட்ட தரவு பகுப்பாய்வு மற்றும் காட்சிப்படுத்தல்: பல்வேறு ஆராய்ச்சி கோரிக்கைகளுக்கு கிடைக்கும்.
●ஒற்றை செல் எம்ஆர்என்ஏ வரிசைமுறையுடன் கூடிய விருப்ப கூட்டு பகுப்பாய்வு
விவரக்குறிப்புகள்
| மாதிரி தேவைகள் | நூலகம் | வரிசைப்படுத்துதல் உத்தி | தரவு பரிந்துரைக்கப்படுகிறது | தரக் கட்டுப்பாடு |
| OCT-உட்பொதிக்கப்பட்ட கிரையோ மாதிரிகள் (உகந்த விட்டம்: தோராயமாக. 6x6x6 மிமீ³) ஒரு மாதிரிக்கு 2 தொகுதிகள் | 10X Visium cDNA நூலகம் | இல்லுமினா PE150 | ஒரு இடத்திற்கு 50K PE படிக்கிறது (60ஜிபி) | RIN > 7 |
மாதிரி தயாரிப்பு வழிகாட்டுதல் மற்றும் சேவை பணிப்பாய்வு பற்றிய கூடுதல் விவரங்களுக்கு, தயவு செய்து தயங்காமல் பேசவும்BMKGENE நிபுணர்
சேவை பணிப்பாய்வு
மாதிரி தயாரிப்பு கட்டத்தில், உயர்தர ஆர்என்ஏவைப் பெறுவதை உறுதி செய்வதற்காக ஆரம்ப மொத்த ஆர்என்ஏ பிரித்தெடுத்தல் சோதனை செய்யப்படுகிறது. திசு உகப்பாக்கம் கட்டத்தில், பிரிவுகள் படிந்து காட்சிப்படுத்தப்படுகின்றன மற்றும் திசுக்களில் இருந்து எம்ஆர்என்ஏ வெளியீட்டிற்கான ஊடுருவல் நிலைகள் உகந்ததாக இருக்கும். மேம்படுத்தப்பட்ட நெறிமுறை நூலகக் கட்டுமானத்தின் போது பயன்படுத்தப்படுகிறது, அதைத் தொடர்ந்து வரிசைப்படுத்துதல் மற்றும் தரவு பகுப்பாய்வு.
முழுமையான சேவை பணிப்பாய்வு நிகழ்நேர புதுப்பிப்புகள் மற்றும் வாடிக்கையாளர் உறுதிப்படுத்தல்களை உள்ளடக்கியது, இது ஒரு பதிலளிக்கக்கூடிய பின்னூட்ட வளையத்தை பராமரிக்கிறது, இது சுமூகமான திட்டத்தை செயல்படுத்துவதை உறுதி செய்கிறது.
பின்வரும் பகுப்பாய்வு அடங்கும்:
தரவு தரக் கட்டுப்பாடு:
o தரவு வெளியீடு மற்றும் தரமான மதிப்பெண் விநியோகம்
ஒவ்வொரு இடத்திற்கும் மரபணு கண்டறிதல்
o திசு கவரேஜ்
உள் மாதிரி பகுப்பாய்வு:
o மரபணு வளம்
o ஸ்பாட் கிளஸ்டரிங், குறைக்கப்பட்ட பரிமாண பகுப்பாய்வு உட்பட
கொத்துகளுக்கு இடையிலான வேறுபாடு வெளிப்பாடு பகுப்பாய்வு: மார்க்கர் மரபணுக்களின் அடையாளம்
குறிப்பான் மரபணுக்களின் செயல்பாட்டு சிறுகுறிப்பு மற்றும் செறிவூட்டல்
குழுக்களுக்கு இடையேயான பகுப்பாய்வு
இரண்டு மாதிரிகள் (எ.கா. நோயுற்ற மற்றும் கட்டுப்பாடு) மற்றும் மறு கொத்து ஆகியவற்றிலிருந்து புள்ளிகளை மீண்டும் இணைத்தல்
ஒவ்வொரு கிளஸ்டருக்கும் மார்க்கர் மரபணுக்களை அடையாளம் காணுதல்
குறிப்பான் மரபணுக்களின் செயல்பாட்டு சிறுகுறிப்பு மற்றும் செறிவூட்டல்
o குழுக்களிடையே ஒரே கிளஸ்டரின் மாறுபட்ட வெளிப்பாடு
உள்-மாதிரி பகுப்பாய்வு
ஸ்பாட் கிளஸ்டரிங்
மார்க்கர் மரபணுக்கள் அடையாளம் மற்றும் இடஞ்சார்ந்த விநியோகம்
குழுக்களுக்கு இடையேயான பகுப்பாய்வு
இரண்டு குழுக்களின் தரவு கலவை மற்றும் மறு கிளஸ்டர்
புதிய கிளஸ்டர்களின் மார்க்கர் மரபணுக்கள்
10X Visium மூலம் BMKGene இன் ஸ்பேஷியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக்ஸ் சேவையால் எளிதாக்கப்பட்ட முன்னேற்றங்களை இந்த பிரத்யேக வெளியீடுகளில் ஆராயுங்கள்:
சென், டி. மற்றும் பலர். (2023) 'mthl1, பாலூட்டிகளின் ஒட்டுதல் GPCRகளின் சாத்தியமான ட்ரோசோபிலா ஹோமோலாக், ஈக்களில் செலுத்தப்படும் புற்றுநோயியல் செல்களுக்கு ஆன்டிடூமர் எதிர்வினைகளில் ஈடுபட்டுள்ளது',அமெரிக்காவின் தேசிய அறிவியல் அகாடமியின் செயல்முறைகள், 120(30), ப. e2303462120. doi: /10.1073/pnas.2303462120
சென், ஒய். மற்றும் பலர். (2023) 'ஸ்டீல் ஸ்பேடியோடெம்போரல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக் தரவின் உயர்-தெளிவு விளக்கத்தை செயல்படுத்துகிறது',பயோ இன்ஃபர்மேட்டிக்ஸ் பற்றிய சுருக்கங்கள், 24(2), பக். 1–10. doi: 10.1093/BIB/BBAD068.
லியு, சி. மற்றும் பலர். (2022) 'ஆர்கிட் பூக்களின் வளர்ச்சியில் ஆர்கனோஜெனீசிஸின் ஸ்பேடியோடெம்போரல் அட்லஸ்',நியூக்ளிக் அமிலங்கள் ஆராய்ச்சி, 50(17), பக். 9724–9737. doi: 10.1093/NAR/GKAC773.
வாங், ஜே. மற்றும் பலர். (2023) 'ஸ்பேஷியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக்ஸ் மற்றும் சிங்கிள் நியூக்ளியஸ் ஆர்என்ஏ சீக்வென்சிங் ஆகியவற்றை ஒருங்கிணைத்தல் கருப்பை லியோமியோமாவுக்கான சாத்தியமான சிகிச்சை உத்திகளை வெளிப்படுத்துகிறது',உயிரியல் அறிவியல் சர்வதேச இதழ், 19(8), பக். 2515–2530. doi: 10.7150/IJBS.83510.
