RNA ndogo ya mpangilio-illumina
Vipengee
● Maandalizi ya maktaba ni pamoja na hatua ya uteuzi wa ukubwa
● Uchambuzi wa bioinformatic ulizingatia utabiri wa miRNA na malengo yao
Faida za huduma
●Uchambuzi kamili wa bioinformatics:Kuwezesha kitambulisho cha miRNA zote zinazojulikana na riwaya, kitambulisho cha malengo ya miRNA, na ufafanuzi wa kazi unaofanana na utajiri na hifadhidata nyingi (KEGG, GO)
●Udhibiti wa ubora wa hali ya juu: Tunatumia vidokezo vya udhibiti wa msingi katika hatua zote, kutoka kwa sampuli na maandalizi ya maktaba hadi mpangilio na bioinformatics. Ufuatiliaji huu wa kina inahakikisha utoaji wa matokeo ya hali ya juu.
●Msaada wa baada ya mauzo: Kujitolea kwetu kunaenea zaidi ya kukamilika kwa mradi na kipindi cha huduma ya baada ya miezi 3. Wakati huu, tunatoa ufuatiliaji wa mradi, msaada wa utatuzi, na vikao vya Q&A kushughulikia maswali yoyote yanayohusiana na matokeo.
●Utaalam mkubwa: Na rekodi ya kufanikiwa kufunga miradi mingi ya SRNA inayofunika zaidi ya spishi 300 katika vikoa mbali mbali vya utafiti, timu yetu inaleta utajiri wa uzoefu kwa kila mradi.
Mahitaji ya sampuli na utoaji
| Maktaba | Jukwaa | Data iliyopendekezwa | Takwimu QC |
| Saizi iliyochaguliwa | Illumina SE50 | 10m-20m inasoma | Q30≥85% |
Mahitaji ya mfano:
Nyuklia:
| Conc. (Ng/μl) | Kiasi (μg) | Usafi | Uadilifu |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 Protini ndogo au hakuna uchafu au uchafu wa DNA ulioonyeshwa kwenye gel. | Rin≥6.0; 5.0≥28s/18s≥1.0; mwinuko mdogo au hakuna msingi |
● Mimea:
Mizizi, shina au petal: 450 mg
Jani au mbegu: 300 mg
Matunda: 1.2 g
● Mnyama:
Moyo au utumbo: 450 mg
Viscera au ubongo: 240 mg
Misuli: 600 mg
Mifupa, nywele au ngozi: 1.5g
● Arthropods:
Wadudu: 9g
Crustacea: 450 mg
● Damu nzima: 2 zilizopo
● Seli: 106 seli
● Serum na plasma:6 ml
Uwasilishaji wa mfano uliopendekezwa
Chombo: 2 ml centrifuge tube (foil ya bati haifai)
Uandishi wa sampuli: Kundi+replicate EG A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Usafirishaji:
1. Ice-barafu: Sampuli zinahitaji kubeba kwenye mifuko na kuzikwa kwenye barafu kavu.
2. Mizizi inayoweza kusongeshwa: Sampuli za RNA zinaweza kukaushwa kwenye bomba la utulivu wa RNA (kwa mfano rNast ®) na kusafirishwa kwa joto la kawaida.
Mtiririko wa kazi ya huduma
Ubunifu wa majaribio
Uwasilishaji wa mfano
Uchimbaji wa RNA
Ujenzi wa maktaba
Mpangilio
Uchambuzi wa data
Huduma za baada ya kuuza
Bioinformatics
● Udhibiti wa ubora wa data mbichi
● Uainishaji wa SRNA
● Alignment kwa genome ya kumbukumbu
● Utambulisho wa miRNA inayojulikana na riwaya
● Tofauti ya uchambuzi wa kujieleza kwa miRNA
● Maelezo ya kazi ya malengo ya miRNA
Utambulisho wa miRNA: muundo na kina
Tofauti ya kujieleza ya miRNA - nguzo ya hiectical
Kazi ya ufafanuzi wa lengo la miRNA zilizoonyeshwa tofauti
Chunguza maendeleo ya utafiti yaliyowezeshwa na huduma za mpangilio wa BMKGENE 'SRNA kupitia mkusanyiko wa machapisho.
Chen, H. et al. . 108038. Doi: 10.1016/j.plaphy.2023.108038.
Li, H. et al. . Doi: 10.15252/imb.202255037/appr_file/emb202255037-sup-0004-sdatafig4.tif.
Yu, J. et al. . . 5726. Doi: 10.3390/ijms24065726/s1.
Zhang, M. et al. . Doi: 10.1159/000489649.
