RNA ndogo ni aina ya RNA fupi isiyo ya kuweka alama na urefu wa wastani wa 18-30 nt, pamoja na miRNA, siRNA na piRNA. RNA hizi ndogo zimeripotiwa sana kuhusika katika michakato mbali mbali ya kibaolojia kama uharibifu wa mRNA, kizuizi cha tafsiri, malezi ya heterochromatin, nk. Jukwaa la uchambuzi wa mpangilio lina uchambuzi wa kawaida na madini ya data ya hali ya juu. Kwa msingi wa data ya RNA-seq, uchambuzi wa kawaida unaweza kufikia kitambulisho cha miRNA na utabiri, utabiri wa jeni la miRNA, maelezo na uchambuzi wa kujieleza. Mchanganuo wa hali ya juu huwezesha utaftaji na uchimbaji wa miRNA, kizazi cha mchoro wa Venn, miRNA na jengo la mtandao wa jeni.
