-
Vifaa vya zana
BMKCloud ni jukwaa linaloongoza la habari za kibiolojia linalotoa suluhisho la wakati mmoja kwa programu za jeni, ambalo linaaminiwa sana na watafiti katika nyanja mbalimbali ikiwa ni pamoja na matibabu, kilimo, mazingira, n.k. BMKCloud imejitolea kutoa huduma jumuishi, za kuaminika na za ufanisi ikiwa ni pamoja na majukwaa ya uchambuzi wa bioinformatic na zana. , rasilimali za kompyuta, hifadhidata ya umma, kozi za mtandaoni za kibayolojia, n.k. BMKCloud ina zana mbalimbali za kibayolojia zinazotumiwa mara kwa mara za kujumuisha maelezo ya jeni, zana za mageuzi za kijeni, ncRNA, udhibiti wa ubora wa data, kusanyiko, upatanishi, uchimbaji wa data, mabadiliko, takwimu, jenereta ya takwimu, uchanganuzi wa mfuatano, n.k.
-
Mkutano wa Genome wa Bakteria mpya
Tunatoa huduma kamili ya mkusanyiko wa jenomu ya bakteria, na kuhakikisha mapengo 0. Hili linawezekana kwa kuunganisha teknolojia za kupanga mpangilio zilizosomwa kwa muda mrefu, kama vile Nanopore na PacBio kwa mkusanyiko na mfuatano wa kusoma kwa muda mfupi na Illumina kwa uthibitishaji wa mkusanyiko na urekebishaji wa makosa ya usomaji wa ONT. Huduma yetu hutoa mtiririko kamili wa habari za kibiolojia kutoka kwa mkusanyiko, ufafanuzi wa utendaji, na uchanganuzi wa hali ya juu wa kibayolojia, kutimiza malengo mahususi ya utafiti. Huduma hii huwezesha uundaji wa jenomu sahihi za marejeleo kwa tafiti mbalimbali za kijeni na jenomiki. Zaidi ya hayo, huunda msingi wa matumizi kama vile uboreshaji wa matatizo, uhandisi jeni, na ukuzaji wa teknolojia ya viumbe vidogo, kuhakikisha data ya jeni ya kuaminika na isiyo na pengo ni muhimu kwa kuendeleza maarifa ya kisayansi na uvumbuzi wa kibayoteknolojia.
-
RNA ndogo
RNA ndogo ni aina ya RNA fupi isiyo na misimbo yenye urefu wa wastani wa 18-30 nt, ikiwa ni pamoja na miRNA, siRNA na piRNA. RNA hizi ndogo zimeripotiwa kuhusika kwa kiasi kikubwa katika michakato mbalimbali ya kibiolojia kama vile uharibifu wa mRNA, uzuiaji wa tafsiri, uundaji wa heterokromatini, n.k. Uchambuzi wa mpangilio wa SmallRNA umetumika sana katika tafiti kuhusu ukuzaji wa wanyama/mimea, magonjwa, virusi, n.k. Ndogo ya RNA. jukwaa la uchambuzi wa mpangilio lina uchanganuzi wa kawaida na uchimbaji wa data wa hali ya juu. Kwa msingi wa data ya RNA-seq, uchanganuzi wa kawaida unaweza kufikia kitambulisho na ubashiri wa miRNA, utabiri wa jeni lengwa wa miRNA, ufafanuzi na uchanganuzi wa usemi. Uchanganuzi wa hali ya juu huwezesha utaftaji na uchimbaji wa miRNA uliobinafsishwa, utengenezaji wa mchoro wa Venn, miRNA na ujenzi wa mtandao wa jeni.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS ni jukwaa zima la uchanganuzi wa kupanga upya jenomu, ambalo limetengenezwa kwa msingi wa tajiriba katika Biomarker Technologies. Jukwaa hili la urahisi wa kutumia huruhusu uwasilishaji wa haraka wa utendakazi jumuishi wa uchanganuzi kwa kuweka tu vigezo vichache vya msingi, ambavyo vinatoshea data ya upangaji wa DNA inayozalishwa kutoka kwa jukwaa la Illumina na jukwaa la mpangilio la BGI. Mfumo huu umewekwa kwenye seva ya utendakazi wa hali ya juu, ambayo huwezesha uchanganuzi wa data wenye ufanisi zaidi katika muda mfupi sana. Uchimbaji data uliobinafsishwa unapatikana kwa msingi wa uchanganuzi wa kawaida, ikijumuisha hoja ya jeni iliyobadilishwa, muundo wa msingi wa PCR, n.k.
-
mRNA(Rejea)
Transcriptome ni kiungo kati ya taarifa za kijenetiki za jeni na proteome ya utendaji kazi wa kibiolojia. Udhibiti wa kiwango cha uandishi ndio njia muhimu zaidi na iliyosomwa sana ya udhibiti wa viumbe. Mfuatano wa nukuu unaweza kupanga nakala wakati wowote kwa wakati au chini ya hali yoyote, kwa azimio sahihi kwa nukleotidi moja. Inaweza kuakisi kwa kiwango kikubwa kiwango cha unukuzi wa jeni, kutambua wakati huo huo na kuhesabu nakala adimu na za kawaida, na kutoa maelezo ya muundo wa sampuli za nakala maalum.
Kwa sasa, teknolojia ya mpangilio wa nukuu imekuwa ikitumika sana katika agronomia, dawa na nyanja zingine za utafiti, ikijumuisha udhibiti wa ukuzaji wa wanyama na mimea, urekebishaji wa mazingira, mwingiliano wa kinga, ujanibishaji wa jeni, mabadiliko ya jeni na utambuzi wa tumor na ugonjwa wa kijeni.
-
Metagenomics (NGS)
Jukwaa hili la uchanganuzi limeundwa kwa uchanganuzi wa data ya shotgun kwa msingi wa uzoefu wa miaka. Inajumuisha utendakazi uliounganishwa unaojumuisha uchanganuzi mbalimbali wa metagenomics zinazohitajika kwa kawaida ikiwa ni pamoja na usindikaji wa data, tafiti za kiwango cha spishi, tafiti za kiwango cha utendaji wa jeni, uwekaji wa data kwenye metagenome, n.k. Zaidi ya hayo, zana za uchimbaji data zilizobinafsishwa zinapatikana wakati wa uchanganuzi wa kawaida, ikijumuisha swala la jeni na spishi. , mpangilio wa kigezo, utengenezaji wa takwimu za kibinafsi, n.k.
-
LncRNA
RNA ndefu zisizo na msimbo (lncRNA) ni aina ya nakala zenye urefu wa zaidi ya nt 200, ambazo haziwezi kuweka msimbo wa protini. Ushahidi limbikizi unapendekeza kuwa nyingi ya lncRNAs zina uwezekano mkubwa wa kufanya kazi. Teknolojia za upangaji matokeo ya hali ya juu na zana za kuchanganua habari za kibayolojia hutuwezesha kufichua mfuatano wa lncRNA na kuweka maelezo kwa ufanisi zaidi na kutuongoza kugundua lncRNA zilizo na kazi muhimu za udhibiti. BMKCloud inajivunia kuwapa wateja wetu jukwaa la uchambuzi wa mpangilio wa lncRNA ili kufikia uchanganuzi wa haraka, wa kuaminika na rahisi wa lncRNA.
-
GWAS
Utafiti wa shirika pana la genome (GWAS) unalenga kutambua vibadala vya kijenetiki (genotype) vinavyohusishwa na sifa maalum (fenotipu). Tafiti za GWA huchunguza viashirio vya kijenetiki vinavyovuka jenomu nzima ya idadi kubwa ya watu na kutabiri uhusiano wa genotype-phenotype kwa uchanganuzi wa takwimu katika kiwango cha idadi ya watu. Ufuataji wa jenomu nzima unaweza kugundua aina zote za kijeni. Ikiunganishwa na data ya phenotypic, GWAS inaweza kuchakatwa ili kutambua SNPs zinazohusiana na phenotipi, QTL na jeni tegemezi, ambayo inaunga mkono kwa nguvu ufugaji wa kisasa wa wanyama/mimea. SLAF ni mkakati uliorahisishwa wa kupanga mpangilio wa jenomu, ambao hugundua vialamisho vilivyosambazwa kwa upana wa genome, SNP. SNP hizi, kama viashirio vya kijenetiki vya molekuli, zinaweza kuchakatwa kwa ajili ya tafiti zinazohusiana na sifa zinazolengwa. Ni mkakati wa gharama nafuu katika kutambua sifa changamano zinazohusiana na tofauti za kijeni.
-
Nanopore Nakala za urefu kamili
Isoforms mbadala tata na zinazobadilika katika viumbe ni njia muhimu za kijeni za kudhibiti usemi wa jeni na utofauti wa protini. Utambulisho sahihi wa miundo ya nakala ndio msingi wa uchunguzi wa kina wa mifumo ya udhibiti wa usemi wa jeni. Jukwaa la ufuataji la Nanopore limefaulu kuleta utafiti wa maandishi kwenye kiwango cha isoform. Jukwaa hili la uchanganuzi limeundwa kuchanganua data ya RNA-Seq inayotolewa kwenye jukwaa la Nanopore kwa misingi ya jenomu ya marejeleo, ambayo hufanikisha uchanganuzi wa ubora na kiasi katika kiwango cha jeni na kiwango cha nakala.
-
mduara-RNA
Mviringo RNA(circRNA) ni aina ya RNA isiyoweka misimbo, ambayo hivi majuzi ilionekana kuwa na jukumu muhimu katika mitandao ya udhibiti inayohusika katika kuendeleza, upinzani wa mazingira, nk. Tofauti na molekuli za mstari za RNA, kwa mfano mRNA, lncRNA, 3′ na 5′. ncha za circRNA zimeunganishwa pamoja na kuunda muundo wa duara, ambao huwaokoa kutoka kwa usagaji wa exonuclease na ni thabiti zaidi kuliko sehemu nyingi za RNA ya mstari. CircRNA imepatikana kuwa na utendaji tofauti katika kudhibiti usemi wa jeni. CircRNA inaweza kufanya kama ceRNA, ambayo hufunga miRNA kwa ushindani, inayojulikana kama sponji ya miRNA. Jukwaa la uchambuzi wa mpangilio wa CircRNA huwezesha muundo wa circRNA na uchanganuzi wa usemi, utabiri wa lengo na uchambuzi wa pamoja na aina zingine za molekuli za RNA.
-
BSA
Jukwaa la Uchanganuzi wa Uchanganuzi Uliotengwa lina uchanganuzi wa kiwango cha hatua moja na uchanganuzi wa hali ya juu na mpangilio maalum wa kigezo. BSA ni mbinu inayotumika kutambua kwa haraka viashirio vya kijenetiki vinavyohusiana na phenotype. Mtiririko mkuu wa BSA una: 1. kuchagua vikundi viwili vya watu walio na phenotypes zinazopingana sana; 2. kuunganisha DNA, RNA au SLAF-seq(Imeandaliwa na Biomarker) ya watu wote ili kuunda wingi wa DNA; 3. kutambua mpangilio tofauti dhidi ya jenomu ya marejeleo au kati, 4. kutabiri maeneo yaliyounganishwa na ED na SNP-index; 5. Uchanganuzi wa kiutendaji na uboreshaji wa jeni katika maeneo yanayotarajiwa, n.k. Uchimbaji wa hali ya juu zaidi katika data ikijumuisha uchunguzi wa alama za kijenetiki na muundo wa kianzilishi pia unapatikana.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Jukwaa la Amplicon (16S/18S/ITS) limetengenezwa kwa uzoefu wa miaka mingi katika uchanganuzi wa mradi wa anuwai ya vijidudu, ambao una uchanganuzi sanifu wa kimsingi na uchanganuzi wa kibinafsi: uchambuzi wa kimsingi unashughulikia uchanganuzi mkuu wa utafiti wa sasa wa vijiumbe, maudhui ya uchanganuzi ni tajiri na ya kina, na matokeo ya uchambuzi yanawasilishwa kwa namna ya ripoti za mradi; Maudhui ya uchambuzi wa kibinafsi ni tofauti. Sampuli zinaweza kuchaguliwa na vigezo vinaweza kuwekwa kwa urahisi kulingana na ripoti ya msingi ya uchanganuzi na madhumuni ya utafiti, ili kufikia mahitaji ya kibinafsi. Mfumo wa uendeshaji wa Windows, rahisi na wa haraka.
-
Jenetiki ya Mageuzi
Jenetiki ya Mageuzi ni huduma ya kina ya mpangilio iliyoundwa ili kutoa ufafanuzi wa kina wa mageuzi ndani ya kundi kubwa la watu binafsi, kulingana na tofauti za kijeni, ikiwa ni pamoja na SNP, InDels, SVs, na CNVs. Huduma hii inajumuisha uchanganuzi wote muhimu unaohitajika ili kufafanua mabadiliko ya mabadiliko na sifa za kijeni za idadi ya watu, ikiwa ni pamoja na tathmini ya muundo wa idadi ya watu, uanuwai wa kijeni, na uhusiano wa filojenetiki. Zaidi ya hayo, inaangazia tafiti juu ya mtiririko wa jeni, kuwezesha makadirio ya saizi ya idadi ya watu na wakati wa tofauti. Masomo ya mabadiliko ya kijenetiki yanatoa maarifa muhimu kuhusu asili na urekebishaji wa spishi.
Katika BMKGENE, tunatoa njia mbili za kufanya tafiti za mabadiliko ya jenetiki kwa makundi makubwa: kutumia mpangilio wa jenomu nzima (WGS) au kuchagua mbinu iliyopunguzwa ya mpangilio wa jenomu ya uwakilishi, Kipande Kilichokuzwa cha Mahali Mahususi (SLAF). Ingawa WGS inafaa jenomu ndogo, SLAF inaibuka kama njia mbadala ya gharama nafuu ya kusoma idadi kubwa ya watu walio na jenomu refu, kwa ufanisi kupunguza gharama za mfuatano.
