Transcriptome ya urefu kamili

Pacbio kamili ya mpangilio wa maandishi, isoseq, inawezesha utambulisho sahihi wa isoforms ya maandishi, kumwaga taa kwenye polyadenylation mbadala na splicing, na kusababisha uchambuzi sahihi zaidi wa kujieleza kwa jeni. Bomba la maandishi ya BMKCloud Pacbio kamili ya maandishi imeundwa kuchambua maktaba za cDNA zilizowekwa katika hali ya makubaliano ya makubaliano (CCS) na kubaini mlolongo kamili usio wa chimeric (FLNC), ambao kisha huunganishwa katika maandishi yasiyokuwa ya redundant. Mchanganuo wa baadaye wa BUSCO unakagua ukamilifu wa mkutano wa maandishi. Kutoka kwa maandishi yaliyokusanyika, uchambuzi mwingi unafanywa: splicing mbadala, kurudia kwa mlolongo rahisi (SSR), utabiri wa lncRNA na jeni inayolingana, utabiri wa jeni la riwaya, uchambuzi wa familia ya jeni, uchambuzi wa sababu ya maandishi, na ufafanuzi wa maandishi.