Mkutano wa genome wa T2T, genome ya bure ya pengo
1stGenomes mbili za mchele1
Kichwa: Mkutano na Uthibitisho wa genomes mbili za kumbukumbu zisizo na pengo kwa mchele wa Xian/Indica unaonyesha ufahamu katika usanifu wa mimea ya Centromere
Doi:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
Wakati uliotumwa: Januari 01, 2021.
Taasisi: Chuo Kikuu cha Kilimo cha Huazhong, Uchina
Vifaa
O. sativa xian/indicaAina za mchele 'Zhenshan 97 (ZS97)' na 'Minghui 63 (MH63)
Mkakati wa mpangilio
NGS inasoma + hifi inasoma + CLR inasoma + bionano + hi-c
Takwimu:
ZS97: 8.34 GB （~ 23x） HIFI inasoma + 48.39 GB (~ 131x) CLR inasoma + 25 GB (~ 69x) NGS + 2 Bionano IRYS Seli
MH63: 37.88 GB (~ 103x) HIFI inasoma + 48.97 GB (~ 132x) CLR inasoma + 28 GB (~ 76x) Ngs + 2 Bionano IRYS Seli
Kielelezo 1 genomes mbili za bure za mchele (MH63 na ZS97)
2ndNdizi genome2
Kichwa: Telomere-to-telomere chromosomes isiyo na pengo ya ndizi kwa kutumia mpangilio wa nanopore
Doi:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
Wakati uliotumwa: Aprili 17, 2021.
Taasisi: Université Paris-Saclay, Ufaransa
Vifaa
Mara mbili haploidMusa AcuminatasppMalaccensis((DH-Pahang)
Mkakati wa Kuweka na Takwimu:
HISEQ2500 PE250 mode+ Minion/ Promethion (93GB, ~ 200X)+ Ramani ya macho (DLE-1+ BSPQ1)
Jedwali 1 Ulinganisho wa Acuminata ya Musa Acuminata (DH-Pahang)
Kielelezo 2 Ulinganisho wa Usanifu wa Musa
3rdPhaeodactylum tricornutum genome3
Kichwa: Mkutano wa genome wa Telomere-to-telomere waP
Haeodactylum tricornutum
Doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
Wakati uliotumwa: Mei 04, 2021
Taasisi: Chuo Kikuu cha Magharibi, Canada
Vifaa
Phaeodactylum tricornutum(Mkusanyiko wa Utamaduni wa mwani na Protozoa CCAP 1055/1)
Mkakati wa Kuweka na Takwimu:
1 Oxford Nanopore Minion Flow Cell + A 2 × 75 Paired-End Mid-OutsetSeq 550 Run Run Run Run Run Run
Kielelezo 3 cha kufanya kazi kwa mkutano wa telomere-to-telomere genome
4thBinadamu CHM13 genome4
Kichwa: Mlolongo kamili wa genome la mwanadamu
Doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
Wakati uliotumwa: Mei 27, 2021
Taasisi: Taasisi za Kitaifa za Afya (NIH), USA
Vifaa: Line ya seli CHM13
Mkakati wa Kuweka na Takwimu:
30 × Pacbio Circular makubaliano ya mpangilio (HIFI), 120 × Oxford Nanopore Ultra-Long Soma mpangilio, 100 × Illumina PCR-bure mpangilio (ILMN), 70 × Illumina / Arima genomics Hi-C (Hi-C), ramani za macho za bionano, ramani za macho, ramani za macho, ramani za macho, ramani za macho, ramani za macho, ramani za macho, ramani za macho, ramani za macho, ramani za macho, ramani za macho, ramani za macho, ramani za macho, ramani za macho, ramani za macho, bionano macho, ramani, 70 × Illumina / ARIMA genomics HI-C (Hi na Strand-Seq
Jedwali 2 Ulinganisho wa GRCH38 na T2T-CHM13 Mkusanyiko wa Binadamu wa Binadamu
Kumbukumbu
1.Sergey Nurk et al. Mlolongo kamili wa genome ya mwanadamu. BIORXIV 2021.05.26.445798; doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
2.Caroline Belser et al. Telomere-to-telomere chromosomes isiyo na pengo ya ndizi kwa kutumia mpangilio wa nanopore. BIORXIV 2021.04.16.440017; doi:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
3.Daniel J. Giguere et al. Telomere-to-telomere genome mkutano wa phaeodactylum tricornutum. BIORXIV 2021.05.04.442596; doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
4.Jia-Ming Wimbo et al. Mkutano na uthibitisho wa genomes mbili za kumbukumbu zisizo na pengo kwa mchele wa Xian/indica unaonyesha ufahamu katika usanifu wa mimea ya centromere. BIORXIV 2020.12.24.424073; doi:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
Wakati wa chapisho: Jan-06-2022