●Utaalam wa kina na rekodi za uchapishajiPamoja na uzoefu uliokusanywa katika GWAS, BMKGENE imekamilisha mamia ya miradi ya spishi katika utafiti wa GWAS ya idadi ya watu, ilisaidia watafiti kuchapisha nakala zaidi ya 100, na sababu ya athari ya jumla ilifikia 500.
● Uchambuzi kamili wa bioinformatics: Utiririshaji wa kazi ni pamoja na uchambuzi wa ushirika wa SNP, kutoa seti ya jeni la mgombea na maelezo yao ya kazi yanayolingana.
●Timu ya bioinformatics yenye ujuzi sana na mzunguko mfupi wa uchambuzi: Pamoja na uzoefu mzuri katika uchambuzi wa hali ya juu wa genomics, timu ya BMKGENE inatoa uchambuzi kamili na wakati wa kubadilika haraka.
●Msaada wa baada ya mauzo:Kujitolea kwetu kunaenea zaidi ya kukamilika kwa mradi na kipindi cha huduma ya baada ya miezi 3. Wakati huu, tunatoa ufuatiliaji wa mradi, msaada wa utatuzi, na vikao vya Q&A kushughulikia maswali yoyote yanayohusiana na matokeo.
Aina ya mpangilio | Kiwango cha Idadi ya Idadi ya Watu | Mkakati wa mpangilio | Mahitaji ya nucleotide |
Utaratibu mzima wa genome | Sampuli 200 | 10x | Mkusanyiko: ≥ 1 ng/ µl Jumla ya kiwango cha 30ng Uharibifu mdogo au hakuna |
Sehemu maalum ya kupandishwa (SLAF) (SLAF) | Kina cha tag: 10x Idadi ya vitambulisho: <400 MB: WGS inapendekezwa <1GB: vitambulisho 100k 1GB > 2GB: vitambulisho 300K Max 500k vitambulisho | Mkusanyiko ≥ 5 ng/µl Jumla ya ≥ 80 ng NanoDrop OD260/280 = 1.6-2.5 Gel ya Agarose: Hakuna au uharibifu mdogo au uchafu
|
Aina tofauti, subspecies, maeneo ya ardhi/genebanks/familia zilizochanganywa/rasilimali za porini
Aina tofauti, subspecies, maeneo ya ardhi
Familia ya nusu-sib/familia kamili/rasilimali za porini
Ni pamoja na uchambuzi ufuatao:
Uchambuzi wa Chama cha SNP-Trait-njama ya Manhattan
Uchambuzi wa Chama cha SNP-Trait-njama ya QQ
Chunguza maendeleo yaliyowezeshwa na huduma za BMKGENE'S DE GWAS kupitia mkusanyiko wa machapisho:
LV, L. et al. .Kilimo cha majini, 569, p. 739351. Doi: 10.1016/j.aquaculture.2023.739351.
Li, X. et al. .Mmea wa Masi, 15 (8), Uk. 1367-1383. Doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. .Frontiers katika Sayansi ya Mimea, 13, p. 924892. Doi: 10.3389/fpls.2022.924892/bibtex.
Zhao, X. et al. .Panda, Kiini na Mazingira, 44 (8), Uk. 2777-2792. Doi: 10.1111/pce.14066.