Eukaryotic mRNA mpangilio-NGS
Vipengee
● Kukamata kwa aina nyingi za mRNA kabla ya utayarishaji wa maktaba
● Hiari Maandalizi ya Maktaba ya mwelekeo wa mRNA ili kuwezesha kupata data maalum ya mpangilio
● Uchambuzi wa bioinformatic ya usemi wa jeni na muundo wa maandishi
Faida
●Utaalam mkubwaTimu yetu imesindika zaidi ya sampuli 600,000 huko BMKGENE, ikichukua aina tofauti za mfano kama tamaduni za seli, tishu, na maji ya mwili. Tunaleta uzoefu mwingi wa uzoefu kwa kila mradi na tumefanikiwa kumaliza miradi zaidi ya 100,000 ya mRNA-seq katika vikoa mbali mbali vya utafiti.
●Udhibiti wa ubora wa hali ya juu: Tunatumia vidokezo vya udhibiti wa msingi katika hatua zote, kutoka kwa sampuli na maandalizi ya maktaba hadi mpangilio na bioinformatics. Ufuatiliaji huu wa kina inahakikisha uwasilishaji wa matokeo ya hali ya juu, kukuhakikishia kuwa mradi wako uko katika mikono ya kuaminika.
●Maelezo kamili: Tunatumia hifadhidata nyingi ili kufafanua kazi za jeni zilizoonyeshwa tofauti (DEGs) na kufanya uchambuzi wa uboreshaji unaofanana. Njia hii kamili inatoa ufahamu katika michakato ya seli na Masi iliyo chini ya majibu ya maandishi, kuhakikisha kuwa umefahamishwa kikamilifu juu ya matokeo ya mradi wako.
●Msaada wa baada ya mauzo: Kujitolea kwetu kunaenea zaidi ya kukamilika kwa mradi na kipindi cha huduma ya baada ya miezi 3. Wakati huu, tunatoa ufuatiliaji wa mradi, msaada wa utatuzi, na vikao vya Q&A kushughulikia maswali yoyote yanayohusiana na matokeo.
Mahitaji ya sampuli na utoaji
| Maktaba | Mkakati wa mpangilio | Takwimu zilizopendekezwa | Udhibiti wa ubora |
| Poly utajiri | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6 -10 GB | Q30≥85% |
Mahitaji ya mfano:
Nyuklia:
| Conc. (Ng/μl) | Kiasi (μg) | Usafi | Uadilifu | |
| Maktaba ya kawaida | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 Protini ndogo au hakuna uchafu au uchafu wa DNA ulioonyeshwa kwenye gel. | Kwa mimea: rin≥4.0; Kwa wanyama: rin≥4.5; 5.0≥28s/18s≥1.0; mwinuko mdogo au hakuna msingi |
| Maktaba ya mwelekeo | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 Protini ndogo au hakuna uchafu au uchafu wa DNA ulioonyeshwa kwenye gel. | Kwa mimea: rin≥4.0; Kwa wanyama: rin≥4.5; 5.0≥28s/18s≥1.0; mwinuko mdogo au hakuna msingi |
● Mimea:
Mizizi, shina au petal: 450 mg
Jani au mbegu: 300 mg
Matunda: 1.2 g
●Mnyama:
Moyo au utumbo: 300 mg
Viscera au ubongo: 240 mg
Misuli: 450 mg
Mifupa, nywele au ngozi: 1g
● Arthropods:
Wadudu: 6g
Crustacea: 300 mg
● Damu nzima: 1 Tube
● Seli: 106 seli
Uwasilishaji wa mfano uliopendekezwa
Chombo: 2 ml centrifuge tube (foil ya bati haifai)
Uandishi wa sampuli: Kundi+replicate EG A1, A2, A3; B1, B2, B3 ... ...
Usafirishaji:
1. Ice-barafu: Sampuli zinahitaji kubeba kwenye mifuko na kuzikwa kwenye barafu kavu.
2. Vipu vya meza ya RNAs: Sampuli za RNA zinaweza kukaushwa kwenye bomba la utulivu wa RNA (kwa mfano rNast ®) na kusafirishwa kwa joto la kawaida.
Mtiririko wa kazi ya huduma
Ubunifu wa majaribio
Uwasilishaji wa mfano
Uchimbaji wa RNA
Ujenzi wa maktaba
Mpangilio
Uchambuzi wa data
Huduma za baada ya kuuza
Bioinformatics
Eukaryotic MFANO WA MFIDUO WA MFIDUO WA MFIDUO
Bioinformatics
ØUdhibiti wa ubora wa data mbichi
ØKumbukumbu ya upatanishi wa genome
ØUchambuzi wa muundo wa maandishi
ØUtaratibu wa kuonyesha
ØUchambuzi wa kujieleza tofauti
ØKazi ya ufafanuzi na utajiri
Kumbukumbu ya upatanishi wa genome
Kueneza data
Uunganisho wa mfano na tathmini ya nakala za kibaolojia
Jeni zilizoonyeshwa tofauti (DEGs)
Kazi ya ufafanuzi wa DEGs
Uboreshaji wa kazi wa DEGs
Chunguza maendeleo yaliyowezeshwa na huduma za mpangilio wa BMKGENE's Eukaryotic NGS mRNA kupitia mkusanyiko wa machapisho.
Huang, L. et al. . 119736. Doi: 10.1016/j.watres.2023.119736.
Jia, LJ et al. . Doi: 10.1016/j.chom.2023.02.002.
Jin, K. et al. . 884443. Doi: 10.3389/fpls.2022.884443/bibtex.
Wen, X. et al. .
Zhang, Yujie et al. . 101798. Doi: 10.1016/j.nantod.2023.101798.
