●Jukwaa:MGI-DNBSEQ-T7
●Njia za mpangilio:PE150
●Uhamisho wa maktaba za Illumina kwendaMGI:kuwezesha mpangilio wa kiasi cha juu cha data kwa gharama ya chini.
●Udhibiti wa ubora wa maktaba kabla ya mpangilio.
●Mpangilio wa data ya QC na uwasilishaji:utoaji wa ripoti ya QC na data mbichi katika umbizo la fastq baada ya kutenganisha na kuchuja usomaji wa Q30.
●Usawa wa huduma za mpangilio:mteja anaweza kuchagua kufululiza kwa njia au kiasi cha data.
●Matokeo ya juu ya data:1500 Gb / njia
●Uwasilishaji wa ripoti ya mpangilio wa QC:na vipimo vya ubora, usahihi wa data na utendaji wa jumla wa mradi wa mpangilio.
●Mchakato wa mpangilio wa watu wazima:na muda mfupi wa kuzunguka.
●Udhibiti Madhubuti wa Ubora: tunatekeleza mahitaji madhubuti ya QC ili kuhakikisha utoaji wa matokeo ya ubora wa juu mfululizo.
Kiasi cha data (X) | Kuzingatia (qPCR/nM) | Kiasi | |
Njia ya Sehemu
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1nM | ≥ 25 μl |
Gb 10 < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
Gb 50 < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ||
Njia Moja | Kwa Lane | ≥ 1.5 nM / bwawa la maktaba | ≥ 25 μl / bwawa la maktaba |
Mbali na mkusanyiko na kiasi cha jumla, muundo unaofaa wa kilele pia unahitajika.
Kumbuka: Mpangilio wa njia wa maktaba za anuwai ya chini unahitaji kuongeza kasi ya PhiX ili kuhakikisha upigaji simu wa msingi thabiti.
Tunapendekeza uwasilishe maktaba zilizokusanywa mapema kama sampuli. Ikiwa unahitaji BMKGENE kutekeleza mkusanyiko wa maktaba, tafadhali rejelea
mahitaji ya maktaba kwa mpangilio wa sehemu ya njia.
Kilele kikuu kinapaswa kuwa ndani ya 300-450 bp.
Maktaba zinapaswa kuwa na kilele kikuu kimoja, hakuna uchafuzi wa adapta na hakuna vipima vya kwanza.
Ripoti juu ya ubora wa maktaba hutolewa kabla ya kupanga, kutathmini kiasi cha maktaba, na kugawanyika.
Jedwali 1. Takwimu za mpangilio wa data.
Kitambulisho cha mfano | BMKID | Inasoma ghafi | Data Ghafi (bp) | Usomaji safi (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Kielelezo 1. Usambazaji wa ubora pamoja na usomaji katika kila sampuli
Kielelezo 2. Usambazaji wa maudhui ya msingi
Kielelezo 3. Usambazaji wa yaliyomo katika mlolongo wa data