Exclusive Agency for Korea

BMKCloud ingia

Bidhaa

Maktaba za Illumina zilizotengenezwa hapo awali

Maktaba za Illumina zilizotengenezwa mapema

Teknolojia ya mpangilio wa Illumina, kulingana na mpangilio wa Synthesis (SBS), ni uvumbuzi wa kimataifa wa NGS, kuwajibika kwa kutoa zaidi ya 90% ya data ya mpangilio wa ulimwengu. Kanuni ya SBS inajumuisha kufikiria vituo vya kubadilika vyenye kubadilika kama kila DNTP imeongezwa, na baadaye ikasafishwa ili kuruhusu kuingizwa kwa msingi unaofuata. Pamoja na DNTPs zote nne zinazoweza kubadilishwa zilizopo katika kila mzunguko wa mpangilio, ushindani wa asili hupunguza upendeleo wa kuingizwa. Teknolojia hii inayoweza kusaidia inasaidia maktaba za kusoma moja na za paired, zinazohudumia matumizi anuwai ya genomic. Uwezo wa juu wa njia ya juu ya Illumina na msimamo wa usahihi ni kama msingi katika utafiti wa genomics, kuwawezesha wanasayansi kufunua ugumu wa genomes na maelezo yasiyolingana na ufanisi.

Huduma yetu ya mpangilio wa maktaba iliyotengenezwa kabla inawawezesha wateja kuandaa maktaba za mpangilio kutoka kwa vyanzo anuwai (mRNA, genome nzima, amplicon, maktaba 10x, kati ya zingine). Baadaye, maktaba hizi zinaweza kusafirishwa kwa vituo vyetu vya mpangilio kwa udhibiti wa ubora na mpangilio katika majukwaa ya Illumina.

Wasiliana nasi

Maelezo ya huduma

Matokeo ya demo

Vipengee

●Majukwaa:Illumina Novaseq 6000 na Novaseq X Plus

●Njia za kufuata:PE150 na PE250

●Udhibiti wa ubora wa maktaba kabla ya mpangilio

●Kuweka data QC na Uwasilishaji:Uwasilishaji wa Ripoti ya QC na Takwimu Mbichi katika Fomati ya Fastq Baada ya DeMultiplexing na Kuchuja Q30 inasoma

Faida za huduma

●Uwezo wa huduma za mpangilio:Mteja anaweza kuchagua mlolongo kwa njia, kiini cha mtiririko, au kwa idadi ya data inayohitajika (sehemu ya njia ya njia).

●Uzoefu mkubwa kwenye jukwaa la mpangilio wa Illumina:na maelfu ya miradi iliyofungwa na spishi anuwai.

●Uwasilishaji wa mpangilio wa Ripoti ya QC:Na metriki bora, usahihi wa data na utendaji wa jumla wa mradi wa mpangilio.

●Mchakato wa mpangilio wa kukomaa:na wakati mfupi wa kugeuka.

●Udhibiti wa ubora wa hali ya juu: Tunatumia mahitaji madhubuti ya QC ili kuhakikisha utoaji wa matokeo ya hali ya juu.

Mitindo ya sampuli

Jukwaa	Kiini cha mtiririko	Njia ya kufuata	Sehemu	Pato linalokadiriwa
Novaseq x	10b (vichochoro 8)	PE150	Njia moja Njia ya sehemu	375gb / njia
Novaseq x	25b (vichochoro 8)	PE150	Njia moja Njia ya sehemu	1000 GB/njia
Novaseq 6000	Kiini cha mtiririko wa SP (vichochoro 2)	PE250	Kiini cha mtiririko Njia moja Njia ya sehemu	325-400 m inasoma / njia
Novaseq 6000	Kiini cha mtiririko wa S4 (vichochoro 4)	PE150	Kiini cha mtiririko Njia moja Njia ya sehemu	~ 800 GB / Lane

Mahitaji ya mfano

	Kiasi cha data (x)	Mkusanyiko (qPCR/nM)	Kiasi
Utaratibu wa njia ya sehemu	X ≤ 10 GB	≥ 1 nm	≥ 25 μl
	10 GB <x ≤ 50 GB	≥ 2 nm	≥ 25 μl
	50 GB <x ≤ 100 GB	≥ 3 nm	≥ 25 μl
	X> 100 GB	≥ 4 nm	≥ 25 μl
Njia ya Njia	Kwa njia	≥ 1.5 nm / dimbwi la maktaba	≥ 25 μl / dimbwi la maktaba

Mbali na mkusanyiko na jumla, muundo mzuri wa kilele pia unahitajika.

Kumbuka: Njia ya mpangilio wa maktaba za utofauti wa chini inahitaji Spike-in ili kuhakikisha wito wa msingi wa nguvu.

Tunapendekeza kuwasilisha maktaba zilizowekwa kabla kama sampuli. Ikiwa unahitaji BMKGENE kufanya maktaba ya maktaba, tafadhali rejelea

Mahitaji ya maktaba ya mpangilio wa njia ya sehemu.

Saizi ya maktaba (ramani ya kilele)

Peak kuu inapaswa kuwa ndani ya 300-450 bp.
Maktaba zinapaswa kuwa na kilele kuu moja, hakuna uchafu wa adapta na hakuna vipimo vya primer.

Tafadhali tufikie ikiwa sampuli zako hazifikii mahitaji ya vifaa vya kuanzia.

Wasiliana nasi

Utiririshaji wa huduma

Udhibiti wa ubora wa maktaba

Mpangilio

Udhibiti wa ubora wa data

Uwasilishaji wa Mradi

Zamani: Mpangilio wa DNA/RNA -Pacbio

Ifuatayo: Utaratibu wa DNA/RNA - Nanopore Sequencer

Ripoti ya QC ya Maktaba

Ripoti juu ya ubora wa maktaba hutolewa kabla ya mpangilio, kukagua kiasi cha maktaba, na kugawanyika.

Kuweka Ripoti ya QC

Jedwali 1. Takwimu juu ya data ya mpangilio.

Mfano wa kitambulisho	Bmkid	RAW inasoma	Takwimu mbichi (BP)	Safi inasoma (%)	Q20 (%)	Q30 (%)	GC (%)
C_01	BMK_01	22,870,120	6,861,036,000	96.48	99.14	94.85	36.67
C_02	BMK_02	14,717,867	4,415,360,100	96.00	98.95	93.89	37.08