Mkutano wa bakteria wa bakteria wa de novo
Tunatoa huduma kamili ya mkutano wa bakteria wa bakteria, tunahakikisha mapungufu 0. Hii inawezekana kwa kujumuisha teknolojia za mpangilio wa muda mrefu, kama vile Nanopore na Pacbio kwa mkutano na mpangilio wa kusoma kwa muda mfupi na Illumina kwa uthibitisho wa mkutano na urekebishaji wa makosa ya usomaji wa ONT. Huduma yetu hutoa utiririshaji kamili wa bioinformatic kutoka kwa mkutano, maelezo ya kazi, na uchambuzi wa hali ya juu wa bioinformatic, kutimiza malengo maalum ya utafiti. Huduma hii inawezesha maendeleo ya genomes sahihi ya kumbukumbu kwa masomo anuwai ya maumbile na genomic. Kwa kuongeza, ni msingi wa matumizi kama vile utaftaji wa shida, uhandisi wa maumbile, na maendeleo ya teknolojia ya microbial, kuhakikisha data ya genomic ya kuaminika na isiyo na pengo muhimu kwa kukuza ufahamu wa kisayansi na uvumbuzi wa kibaolojia.
Huduma za huduma
● Na chaguzi mbili zinazowezekana kuchagua kutoka kulingana na kiwango unachotaka cha ukamilifu wa genome.
● Chaguo la genome ya rasimu: Utaratibu wa kusoma kwa muda mfupi na Illumina Novaseq PE150.
● Kamilisha genome 0 ya pengo.
● Utaratibu wa kusoma kwa muda mrefu juu ya Nanopore Promethion 48 au Pacbio Revio kwa Bunge la Genome.
● Utaratibu wa kusoma kwa muda mfupi juu ya Illumina Novaseq kwa uthibitisho wa genome na urekebishaji wa makosa (nanopore) au kutoa genome ya rasimu.
Faida za huduma
●Zero-pengo genome imehakikishwa: Hii ni kwa sababu ya ujumuishaji wa mpangilio wa Illumina na mpangilio wa kusoma kwa muda mrefu (Nanopore au Pacbio).
●Utiririshaji kamili wa bioinformatics:Hii ni pamoja na mkutano wa genome na utabiri wa vitu vingi vya genomic, maelezo ya jeni ya kazi, na taswira za genome kama vile njama ya circOS.
●Utaalam mkubwa: Pamoja na genomes zaidi ya 20,000 zilizokusanyika, BMKgene huleta zaidi ya muongo mmoja wa uzoefu, timu ya uchambuzi wenye ujuzi, yaliyomo kamili, na msaada bora wa mauzo.
●Msaada wa baada ya mauzo:Kujitolea kwetu kunaenea zaidi ya kukamilika kwa mradi na kipindi cha huduma ya baada ya miezi 3. Wakati huu, tunatoa ufuatiliaji wa mradi, msaada wa utatuzi, na vikao vya Q&A kushughulikia maswali yoyote yanayohusiana na matokeo.
●Mikakati mingi ya mpangilio inapatikana:Kwa malengo tofauti ya utafiti na mahitaji ya ukamilifu wa genome.
Uainishaji wa huduma
| Huduma | Mkakati wa mpangilio |
| Rasimu ya genome | Illumina PE150 100x |
| 0 pengo genome | Nanopore 100x + Illumina PE150 100x Or PACBIO HIFI 30X + Illumina PE150 100x (Hiari) |
Mahitaji ya mfano:
| Mkusanyiko (ng/µl) | Jumla ya kiasi (µg) | Kiasi (µl) | OD260/280 | OD260/230 | |
| Pacbio | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
| Nanopore | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| Illumina | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
· Bakteria: ≥3.5x1010 seli
Mtiririko wa kazi ya huduma
Uwasilishaji wa mfano
Ujenzi wa maktaba
Mpangilio
Uchambuzi wa data
Huduma za baada ya kuuza
Ni pamoja na uchambuzi ufuatao:
● Kufuatilia udhibiti wa ubora wa data
● Mkutano wa genome
● Uchambuzi wa sehemu ya genome: Utabiri wa CD na vitu vingi vya genomic
● Maelezo ya kazi na hifadhidata nyingi za jumla (Nenda, KEGG, nk) na hifadhidata za hali ya juu (kadi, VFDB, nk)
● Visualization ya genome
Tunatoa genome katika muundo wa FASTA unaopatikana kwa urahisi na faili ya maelezo ya genome (GFF).
Maelezo ya Gene - Nenda
Gene Anotation - Cazy wanga
Visualization ya genome - CircOS Plot
Chunguza maendeleo yaliyowezeshwa na huduma za mkutano wa bakteria wa Bmkgene kupitia mkusanyiko wa machapisho.
Dai, W. et al. .Jarida la Kimataifa la Sayansi ya Masi, 24 (19), p. 14669. Doi: 10.3390/ijms241914669/s1.
Kang, Q. et al. .Zoology muhimu, 16 (6), Uk. 798-809. Doi: 10.1111/1749-4877.12510.
Wang, TT et al. .Jarida la Baiolojia, 260, Uk. 38–41. Doi: 10.1016/j.jbiotec.2017.09.001.
Wang, X. et al. .Frontiers katika Microbiology, 12, p. 754931. Doi: 10.3389/fmicb.2021.754931/bibtex.
