Exclusive Agency for Korea

BMKCloud ingia

Bidhaa

16S/18S/Amplicon Sequenting-NGS yake

16S/18S/picha yake ya mpangilio wa Amplicon-NGS

Utaratibu wa Amplicon na Teknolojia ya Illumina, inayolenga mahsusi 16S, 18S, na alama zake za maumbile, ni njia yenye nguvu ya kufunua phylogeny, ushuru, na wingi wa spishi ndani ya jamii ndogo. Njia hii inajumuisha kufuata mikoa inayoweza kufikiwa ya alama za maumbile. Iliyotangazwa hapo awali kama alama ya vidole vya Masi naWoeses et alMnamo 1977, mbinu hii imebadilisha utaftaji wa microbiome kwa kuwezesha uchambuzi wa bure wa kutengwa. Kupitia mpangilio wa 16S (bakteria), 18S (kuvu), na spacer ya ndani iliyoandikwa (ITS, kuvu), watafiti wanaweza kutambua sio spishi nyingi tu bali pia ni nadra na isiyojulikana. Iliyopitishwa sana kama zana muhimu, mpangilio wa amplicon umekuwa muhimu katika utambuzi wa nyimbo za microbial tofauti katika mazingira anuwai, pamoja na mdomo wa mwanadamu, matumbo, kinyesi, na zaidi.

Wasiliana nasi

Maelezo ya huduma

Bioinformatics

Matokeo ya Demo

Machapisho yaliyoangaziwa

Huduma za huduma

● Jukwaa la mpangilio: Illumina Novaseq.

● Uboreshaji wa mikoa fupi ya 16s, 18s na yake, kati ya malengo mengine ya ukuzaji.

● Chaguzi rahisi za amplicon.

● Uzoefu wa mradi uliopita na malengo mengi ya ukuzaji.

Faida za huduma

●Kutengwa-bure:Utambulisho wa haraka wa muundo wa microbial katika sampuli za mazingira.

●Azimio kubwa: Katika vifaa vya chini sana katika sampuli za mazingira.

●Inatumika sana: Masomo ya jamii ya microbial tofauti.

●Uchambuzi kamili wa bioinformatic: Kifurushi cha hivi karibuni cha QIIME2 (ufahamu wa kiwango cha ikolojia ya microbial) na uchambuzi tofauti katika suala la hifadhidata, maelezo, OTU/ASV.

●Utaalam mkubwa: Pamoja na miradi ya mpangilio wa amplicon elfu 150 iliyofanywa kila mwaka, BMKgene inaleta zaidi ya muongo mmoja wa uzoefu, timu ya uchambuzi wenye ujuzi, yaliyomo kamili, na msaada bora wa mauzo.

Uainishaji wa huduma

Maktaba	Mkakati wa mpangilio	Takwimu zilizopendekezwa
Amplicon	Illumina PE250	Vitambulisho 50/100/300k (soma jozi)

Mahitaji ya huduma

Mkusanyiko (ng/µl)	Jumla ya kiasi (ng)	Kiasi (µl)
≥1	≥200	≥20

● Udongo/sludge: 1-2g
● Maudhui ya matumbo-wanyama: 0.5-2g
● Yaliyomo ndani ya matumbo: 0.1-0.25g
● Uso wa mmea (sediment yenye utajiri): 0.1-0.5g
● Mchuzi wa Fermentation Utajiri wa mchanga): 0.1-0.5g
● Feeces (wanyama wakubwa): 0.5-2g
● Feeces (panya): 3-5grains
● Pulmonary alveolar lavage giligili: karatasi ya vichungi
● Swab ya uke: 5-6 swabs
● ngozi/sehemu ya siri/mshono/tishu laini ya mdomo/swab ya pharyngeal/swab ya rectal: 2-3 swabs
● Vijidudu vya uso: Karatasi ya vichungi
● Waterbody/hewa/biofilm: Karatasi ya vichungi
● Endophytes: 1-2g
● Jalada la meno: 0.5-1g

Mtiririko wa kazi ya huduma

Uwasilishaji wa mfano

Ujenzi wa maktaba

Mpangilio

Uchambuzi wa data

Huduma za baada ya kuuza

Zamani: Bakteria na kuvu kabisa genome

Ifuatayo: 16S/18S/mpangilio wake wa Amplicon-Pacbio

Ni pamoja na uchambuzi ufuatao:

Udhibiti wa ubora wa data mbichi
OTU Clustering /De-Noise (ASV)
Maelezo ya OTU
Uchambuzi wa Tofauti za Alpha: Faharisi nyingi, pamoja na Shannon, Simpson na Ace.
Uchambuzi wa Tofauti za Beta
Uchambuzi wa kikundi
Uchambuzi wa uunganisho: Kati ya sababu za mazingira na muundo wa nje na utofauti
16S Utabiri wa jeni wa kazi

Historia ya usambazaji wa taxonomic

Ramani ya joto ya taxonomic

Uchambuzi wa Tofauti za Alpha: Curve ya Rarefaction

Uchambuzi wa Tofauti za Beta: NMDS

Uchambuzi wa Intergroup: Ugunduzi wa Biomarker wa Lefse

Chunguza maendeleo yaliyowezeshwa na huduma za mpangilio wa BMKGENE's Amplicon na Illumina kupitia mkusanyiko wa machapisho.

Dong, C. et al. .

Li, Y. et al. . Doi: 10.1186/s40168-023-01497-y

Yang, J., Fu, Y. na Liu, H. (2022) 'Microbiomes ya vumbi la hewa iliyokusanywa wakati wa jaribio la msaada wa maisha ya bioregenerative "Lunar Palace 365"', Microbiomes ya Mazingira, 17 (1), pp. 1-20. Doi: 10.1186/s40793-022-00399-0/takwimu/8.

Yin, S. et al. . 127678. Doi: 10.1016/j.biortech.2022.127678.