Exclusive Agency for Korea

BMKCloud ingia

Bidhaa

10x genomics visium spatial transcriptome

Transcripttomics ya anga ni teknolojia ya kupunguza makali ambayo inaruhusu watafiti kuchunguza mifumo ya kujieleza ya jeni ndani ya tishu wakati wa kuhifadhi muktadha wao wa anga. Jukwaa moja lenye nguvu katika kikoa hiki ni 10x genomics visium pamoja na mpangilio wa Illumina. Kanuni ya 10x Visium iko kwenye chip maalum na eneo lililotengwa la kukamata ambapo sehemu za tishu huwekwa. Sehemu hii ya kukamata ina matangazo ya barcoded, kila moja inalingana na eneo la kipekee la anga ndani ya tishu. Molekuli za RNA zilizokamatwa kutoka kwa tishu basi huandikwa na vitambulisho vya kipekee vya Masi (UMIS) wakati wa mchakato wa maandishi. Matangazo haya ya barcoded na UMIS huwezesha ramani sahihi za anga na usahihi wa usemi wa jeni kwa azimio la seli moja. Mchanganyiko wa sampuli za barcoded na UMIS inahakikisha usahihi na maalum ya data inayotokana. Kwa kutumia teknolojia hii ya transcripttomics ya anga, watafiti wanaweza kupata uelewa zaidi wa shirika la seli na mwingiliano tata wa Masi unaotokea ndani ya tishu, kutoa ufahamu muhimu katika mifumo ya msingi ya michakato ya kibaolojia katika nyanja nyingi, pamoja na oncology, neuroscience, biolojia ya maendeleo, immunology , na masomo ya mimea.

Jukwaa: 10x Genomics Visium na Illumina Novaseq

Wasiliana nasi

Maelezo ya huduma

Bioinformatics

Matokeo ya Demo

Machapisho yaliyoangaziwa

Mpango wa kiufundi

Vipengee

● Azimio: 100 µm

● kipenyo cha doa: 55 µm

● Idadi ya matangazo: 4992

● eneo la kukamata: 6.5 x 6.5 mm

● Kila mahali pa barcoded imejaa primers zilizo na sehemu 4:

- Poly (DT) mkia wa priming ya mRNA na awali ya cDNA

- Kitambulisho cha kipekee cha Masi (UMI) kusahihisha upendeleo wa kukuza

- Barcode ya anga

- Mlolongo wa kufunga wa sehemu ya kusoma 1 ya mpangilio

● H&E Madoa ya sehemu

Faida

●Huduma ya kusimamisha moja: inajumuisha uzoefu wote na hatua za msingi wa ustadi, pamoja na sehemu ya cryo, madoa, utaftaji wa tishu, barcoding ya anga, utayarishaji wa maktaba, mpangilio na bioinformatics.

● Timu ya ufundi yenye ustadi mkubwa: Pamoja na uzoefu katika aina zaidi ya 250 za tishu na spishi 100+ pamoja na binadamu, panya, mamalia, samaki na mimea.

●Sasisho la wakati halisi kwenye mradi mzima: na udhibiti kamili wa maendeleo ya majaribio.

●Kiwango kamili cha bioinformatics:Kifurushi ni pamoja na uchambuzi 29 na takwimu 100 za ubora wa juu.

●Uchambuzi wa data uliobinafsishwa na taswira: Inapatikana kwa maombi tofauti ya utafiti.

●Uchambuzi wa pamoja wa hiari na mlolongo wa seli moja mRNA

Maelezo

Mahitaji ya mfano

Maktaba

Mkakati wa mpangilio

Takwimu zilizopendekezwa

Udhibiti wa ubora

Sampuli za Cryo-zilizoingizwa za Oct

(Kipenyo bora: takriban. 6x6x6 mm³)

Vitalu 2 kwa sampuli

Maktaba ya 10x Visium cDNA

Illumina PE150

50k PE inasoma kwa kila doa

(60gb)

Rin> 7

Kwa maelezo zaidi juu ya mwongozo wa maandalizi ya mfano na utiririshaji wa huduma, tafadhali jisikie huru kuzungumza na aMtaalam wa BMKGENE

Utiririshaji wa huduma

Katika awamu ya utayarishaji wa mfano, jaribio la uchimbaji wa RNA ya kwanza linafanywa ili kuhakikisha kuwa RNA ya hali ya juu inaweza kupatikana. Katika hatua ya uboreshaji wa tishu sehemu hizo zimebadilishwa na kuonyeshwa na hali ya upenyezaji wa kutolewa kwa mRNA kutoka kwa tishu huboreshwa. Itifaki iliyoboreshwa basi inatumika wakati wa ujenzi wa maktaba, ikifuatiwa na mpangilio na uchambuzi wa data.

Utiririshaji kamili wa huduma unajumuisha sasisho za wakati halisi na uthibitisho wa mteja ili kudumisha kitanzi cha majibu ya msikivu, kuhakikisha utekelezaji wa mradi laini.