Liten RNA

Små RNA är korta icke-kodande RNA med en genomsnittlig längd på 18-30 nt, inklusive miRNA, siRNA och PIRNA, som spelar viktiga roller i regleringsprocesser. Bmkcloud SRNA -rörledningen ger både standard och anpassad analys för miRNA -identifiering. Efter läst trimning och kvalitetskontroll anpassas läsningarna mot flera databaser för att klassificera SRNA och välja miRNA och mappas till referensgenomet. MiRNA identifieras baserat på kända miRNA -databaser, vilket ger information om sekundärstruktur, miRNA -familj och målgener. Differentialuttrycksanalys identifierar differentiellt uttryckta miRNA och motsvarande målgener är funktionellt kommenterade för att hitta berikade kategorier.