-
BMKMANU S3000_Spatialt transkriptom
Spatial transcriptomics står i spetsen för vetenskaplig innovation, vilket ger forskare möjlighet att fördjupa sig i komplicerade genuttrycksmönster i vävnader samtidigt som deras rumsliga kontext bevaras. Bland olika plattformar har BMKGene utvecklat BMKManu S3000 Spatial Transcriptome Chip, med en förbättrad upplösning på 3,5 µm, som når det subcellulära intervallet och möjliggör flernivåupplösningsinställningar. S3000-chippet, med cirka 4 miljoner fläckar, använder mikrobrunnar skiktade med pärlor laddade med rumsligt streckkodade infångningssonder. Ett cDNA-bibliotek, berikat med rumsliga streckkoder, förbereds från S3000-chippet och sekvenseras därefter på Illumina NovaSeq-plattformen. Kombinationen av rumsligt streckkodade prover och UMI:er säkerställer noggrannheten och specificiteten hos de genererade data. BMKManu S3000-chippet är extremt mångsidigt och erbjuder upplösningsinställningar i flera nivåer som kan finjusteras till olika vävnader och önskade detaljnivåer. Denna anpassningsförmåga positionerar chippet som ett enastående val för olika rumsliga transkriptomiska studier, vilket säkerställer exakt rumslig klustring med minimalt brus. Användningen av cellsegmenteringsteknologi med BMKManu S3000 möjliggör avgränsning av transkriptionsdata till cellgränserna, vilket resulterar i en analys som har direkt biologisk betydelse. Dessutom resulterar den förbättrade upplösningen av S3000 i ett högre antal gener och UMI som detekteras per cell, vilket möjliggör en mycket mer exakt analys av de rumsliga transkriptionsmönstren och klustring av celler.
-
DNBSEQ förgjorda bibliotek
DNBSEQ, utvecklad av MGI, är en innovativ NGS-teknik som har lyckats minska ytterligare ned sekvenseringskostnaderna och öka genomströmningen. Beredning av DNBSEQ-bibliotek involverar DNA-fragmentering, beredning av ssDNA och rullande cirkelamplifiering för att erhålla DNA-nanobollarna (DNB). Dessa laddas sedan på en fast yta och sekvenseras därefter genom kombinatorisk Probe-Anchor Synthesis (cPAS). DNBSEQ-teknologin kombinerar fördelarna med att ha en låg förstärkningsfelfrekvens med att använda högdensitetsfelmönster med nanobollar, vilket resulterar i sekvensering med högre genomströmning och noggrannhet.
Vår förtillverkade bibliotekssekvenseringstjänst gör det möjligt för kunder att förbereda Illumina-sekvenseringsbibliotek från olika källor (mRNA, helgenom, amplikon, 10x-bibliotek, bland annat), som konverteras till MGI-bibliotek i våra laboratorier för att sekvenseras i DNBSEQ-T7, vilket möjliggör höga datamängder till lägre kostnader.
-
Hi-C-baserad kromatininteraktion
Hi-C är en metod designad för att fånga genomisk konfiguration genom att kombinera sonderande närhetsbaserade interaktioner och sekvensering med hög genomströmning. Metoden bygger på kromatintvärbindning med formaldehyd, följt av nedbrytning och återligering på ett sätt att endast fragment som är kovalent sammanlänkade kommer att bilda ligeringsprodukter. Genom att sekvensera dessa ligeringsprodukter är det möjligt att studera 3D-organisationen av genomet. Hi-C gör det möjligt att studera fördelningen av de delar av genomet som är lätt packade (A-fack, euchromatin) och mer sannolikt är transkriptionellt aktiva, och de regioner som är mer tätt packade (B-fack, Heterochromatin). Hi-C kan också användas för att lokalisera topologiskt associerade domäner (TADs), regioner av genomet som har vikta strukturer och som sannolikt har liknande uttrycksmönster, och för att identifiera kromatinslingor, DNA-regioner som är förankrade tillsammans av proteiner och som är ofta berikad med reglerande element. BMKGenes Hi-C-sekvenseringstjänst ger forskare möjlighet att utforska de rumsliga dimensionerna av genomik, vilket öppnar nya vägar för att förstå genomreglering och dess konsekvenser för hälsa och sjukdom.
-
TGuide Smart Magnetic Plant RNA Kit
TGuide Smart Magnetic Plant RNA Kit
Rena högkvalitativt totalt RNA från växtvävnader
-
TGuide Smart Blood/Cell/Tissue RNA Kit
TGuide Smart Blood/Cell/Tissue RNA Kit
Den förfyllda reagenssatsen för patron/platta för rening av högutbyte, hög renhet, högkvalitativt, inhibitorfritt totalt RNA från djurvävnad/cell/färskt helblod
-
TGuide Smart Magnetic Plant DNA Kit
TGuide Smart Magnetic Plant DNA Kit
Rena högkvalitativt genomiskt DNA från olika växtvävnader
-
TGuide Smart Soil / Pall DNA Kit
TGuide Smart Soil / Pall DNA Kit
Renar inhibitorfritt DNA av hög renhet och kvalitet från jord- och avföringsprover
-
TGuide Smart DNA Purification Kit
Återvinner högkvalitativt DNA från PCR-produkt eller agarosgeler.
-
TGuide Smart Blood Genomic DNA Kit
TGuide Smart Blood Genomic DNA Kit
Den förfyllda patron/platta reagenssatsen för genomisk DNA-rening från blod och buffy coat
-
TGuide Smart Magnetic Tissue DNA Kit
Den förfyllda patron/platta reagenssatsen för genomisk DNA-extraktion från djurvävnader
-
TGuide Smart Universal DNA Kit
Den förfyllda reagenssatsen för patron/platta för rening av genomiskt DNA från blod, torkad blodfläck, bakterier, celler, saliv, munspinnar, djurvävnader, etc.
-
TGuide S16 nukleinsyraextraktor
TGuide S16 nukleinsyraextraktor
Enkelt att använda bänkinstrument, 1-8 eller 16 prover samtidigt
Katalognummer / förpackning
Katt. inga
ID
Antal förberedelser
OSE-S16-AM
1 set
-
PacBio 2+3 fullängds mRNA-lösning
Medan NGS-baserad mRNA-sekvensering är ett mångsidigt verktyg för att kvantifiera genuttryck, begränsar dess beroende av korta läsningar dess effektivitet i komplexa transkriptomiska analyser. Å andra sidan använder PacBio-sekvensering (Iso-Seq) långläst teknologi, vilket möjliggör sekvensering av fullängds mRNA-transkript. Detta tillvägagångssätt underlättar en omfattande utforskning av alternativ splitsning, genfusioner och polyadenylering, även om det inte är det primära valet för kvantifiering av genuttryck. Kombinationen 2+3 överbryggar gapet mellan Illumina och PacBio genom att förlita sig på PacBio HiFi-läsningar för att identifiera den kompletta uppsättningen av transkriptisoformer och NGS-sekvensering för att kvantifiera de identiska isoformerna.
Plattformar: PacBio Sequel II/ PacBio Revio och Illumina NovaSeq;
