Produkt

Med Pacific Biosciences (PACBIO) isoform sekvenseringsdata som input kan denna app identifiera transkriptsekvenser i full längd (utan montering). Genom att kartlägga sekvenser i full längd mot referensgenom kan transkript optimeras med kända gener, transkript, kodningsregioner etc. I detta fall kan mer exakt identifiering av mRNA-strukturer, såsom alternativ skarvning, etc. Gemensam analys med NGS -transkriptomsekvenseringsdata möjliggör mer omfattande kommentarer och mer exakt kvantifiering i uttryck på transkriptnivå, vilket till stor del gynnar nedströms differentiell uttryck och funktionsanalys.