Genom

Kromosomskalan och analys av biomassa grödor Lutarioriparius genom
Nanopore sekvensering | Illumina | Hi-c | RNA-sekvensering | Fylogeni
I denna studie gav Biomarker Technologies teknisk support vid nanopore-sekvensering, de novo genommontering, Hi-C-assisterad församling etc.
Abstrakt
Missnöje, en rhizomatös flerårig växt, har stor potential för bioenergiproduktion för sin höga biomassa och stresstolerans. Vi rapporterar en kromosomskalan för attMiscanthus lutarioripariusgenom genom att kombinera Oxford Nanopore-sekvensering och HI-C-teknik. 2,07-GB-enheten täcker 96,64% av genomet, med contig N50 av 1,71 MB. Centromer- och telomeresekvenserna monteras för alla 19 kromosomer respektive kromosom 10. Allotetraploid ursprung för M. lutarioriparius bekräftas med användning av centromera satellitupprepningar. Den tetraploida genomstrukturen och flera kromosomala omarrangemang i förhållande till sorghum visas tydligt. Tandem duplicerade gener avM. lutarioriperiusär funktionella berikade inte bara i termer relaterade till stressrespons, utan cellväggbiosyntes. Genfamiljer relaterade till sjukdomsresistens, cellväggbiosyntes och metalljontransport utvidgas och utvecklas kraftigt. Utvidgningen av dessa familjer kan vara en viktig genomisk grund för att förbättra anmärkningsvärda egenskaper hosM. Lutarioriparius.
Nyckelstatistik för genommontering


Figur. Översikt över M. lutariparius genommontering
Nyheter och höjdpunkter Syftar till att dela de senaste framgångsrika fallen med biomarkörsteknologier, fånga nya vetenskapliga prestationer samt framstående tekniker som tillämpades under studien.
Posttid: Jan-05-2022