Exclusive Agency for Korea

条形 Banner-03

Produkt

Mänsklig hela exome -sekvensering

Mänsklig hel exome-sekvensering (HWE) erkänns allmänt som en kostnadseffektiv och kraftfull sekvenseringsmetod för att peka in sjukdomsframkallande mutationer. Trots att de endast utgör cirka 1,7% av hela genomet spelar exonerna en avgörande roll genom att direkt återspegla profilen för totala proteinfunktioner. I det mänskliga genomet är över 85% av mutationerna relaterade till sjukdomar manifest inom proteinkodningsregionerna. BMKGene erbjuder en omfattande och flexibel mänsklig hela exome -sekvenseringstjänst med två olika exon -fångststrategier tillgängliga för att uppfylla olika forskningsmål.


Serviceuppgifter

Demoresultat

Servicefunktioner

● Två exome -paneler tillgängliga baserade på målberikning med sonder: Sure Select Human All Exon V6 (Agilent) och Xgen Exome Hybridization Panel V2 (IDT).

● Sekvensering på Illumina Novaseq.

● Bioinformatisk rörledning riktad mot sjukdomsanalys eller tumöranalys.

Servicefördelar

Mål från proteinkodningsregionen: Genom att fånga och sekvensera proteinkodningsregioner används HWES för att avslöja varianter relaterade till proteinstruktur.

Kostnadseffektivt:HWE: er ger cirka 85% av de mänskliga sjukdomsassocierade mutationerna från 1% av det mänskliga genomet.

Hög noggrannhet: Med högt sekvenseringsdjup underlättar HWES upptäckten av både vanliga varianter och sällsynta varianter med frekvenser lägre än 1%.

Rigorös kvalitetskontroll: Vi implementerar fem kärnkontrollpunkter över alla steg, från prov- och biblioteksförberedelser till sekvensering och bioinformatik. Denna noggranna övervakning säkerställer leverans av resultat av hög kvalitet.

Omfattande bioinformatikanalys: Vår rörledning går utöver att identifiera variationer till referensgenomet, eftersom det innehåller avancerad analys utformad för att specifikt ta itu med forskningsfrågor relaterade till genetiska aspekter av sjukdomar eller tumöranalys.

Support efter försäljning:Vårt åtagande sträcker sig utöver projektets slutförande med en 3-månaders serviceperiod efter försäljning. Under denna tid erbjuder vi projektuppföljning, felsökningsassistans och Q & A-sessioner för att hantera eventuella frågor relaterade till resultaten.

Provspecifikationer

Exon fångststrategi

Sekvenseringsstrategi

Rekommenderad datautgång

Sure Select Human All Exon V6 (Agilent)

eller xgen exome hybridiseringspanel V2 (IDT)

 

Illumina Novaseq PE150

5 -10 GB

För Mendelian -störningar/sällsynta sjukdomar:> 50x

För tumörprover: ≥ 100x

Provkrav

Provtyp

 

 Belopp(Qubit®)

 

Koncentration 

Volym

 

 

 Renhet (NanoDrop ™)

 

Genomisk DNA

 

≥ 50 ng
≥ 6 ng/μl
≥ 15 μl
 
OD260/280 = 1,8-2,0
 
Ingen nedbrytning, ingen förorening

 

Bioinformatik

Wes_bi arbetsflow_disease-01

Bioinformatisk analys av HWES-sjukdomsprover inkluderar:

● Sekvenseringsdata QC

● Referensgenomjustering

● Identifiering av SNP: er och indelar

● Funktionell kommentar av SNP: er och indeck

Wes_bi arbetsflow_tumor-01

Bioinformatisk analys av tumörprover inkluderar:

● Sekvenseringsdata QC

● Referensgenomjustering

● Identifiering av SNP: er, indelar och somatiska variationer

● Identifiering av bakterievarianter

● Analys av mutationssignaturer

● Identifiering av drivgener baserade på förstärkningsmutationer

● Mutation Annotation på nivån av läkemedelskänslighet

● Heterogenitetsanalys - Beräkning av renhet och ploidy

Servicearbetsflöde

provleverans

Provleverans

Pilotexperiment

DNA -extraktion

Biblioteksförberedelse

Bibliotekskonstruktion

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalys

Dataanalys

数据上传 -01

Dataleverans

Efter försäljningstjänster

Efterförsäljningstjänster


  • Tidigare:
  • Nästa:

  • Data QC - Statistik över exome -fångst

     

    WPS_DOC_22

     

    Variantidentifiering - Indels

    图片 36

    Avancerad analys: Identifiering och distribution av skadliga SNP: er/Indels - Cirkosplott

     

    图片 37

    Tumöranalys: Identifiering och distribution av somatiska mutationer - Circos plot

     

    图片 38

     

    Tumöranalys: Klonala linjer

     

    图片 39

     

    få en offert

    Skriv ditt meddelande här och skicka det till oss

    Skicka ditt meddelande till oss: