Evolutionär genetik

Evolutionära genetiska studier syftar till att förstå den evolutionära banan för populationer med hjälp av polymorfisminformation i genomiska sekvenser. BMKCloud Evolutionary Genetics-pipeline är utformad för att analysera WGS- eller Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF)-data från stora populationer. Efter kvalitetskontroll av rådata anpassas läsningar till referensgenomet och varianter anropas. Pipelinen inkluderar fylogenetisk trädkonstruktion, principal komponentanalys (PCA), populationsstrukturanalys, länkojämvikt (LD), selektiv svepanalys och kandidatgenanalys.