Exclusive Agency for Korea

条形 Banner-03

Produkt

DNA/RNA -sekvensering - Nanopore Sequencer

ONT-sekvensering är en enda molekyl i realtid elektrisk signal sekvenseringsteknologi baserad på nanoporer, sekvenseringsprincipen för varje plattform är densamma. Double-stranded DNA/RNA will bind to nanoporous protein embedded in the biofilm and unwinding under the lead of motor protein, under the action of voltage difference from both sides of the biofilm, DNA/RNA strands pass through the nanopore channel protein at a certain hastighet. På grund av skillnaderna i de kemiska egenskaperna hos de olika baserna på DNA/RNA -strängen, när en enda bas eller DNA -molekyl passerar genom nanopore -kanalen, kommer det att orsaka förändring av olika elektriska signaler. Genom att detektera och motsvarande dessa signaler kan motsvarande bastyper beräknas och realtidsdetektering av sekvensen kan slutföras.


Serviceuppgifter

Demonstration

Serviceinformation Funktioner

Plattform

Biblioteksstorlek

Teoretiskt datautbyte (per cell)

Enkelbasnoggrannhet

Ansökningar

Nanopore

8KB, 10KB, 20KB, Ultralong, cDNA-PCR

70-90 GB/cell

85-92%

SV-samtal, de novo, fullängdsekvensering, Iso-seq, genanteckning, detektion av DNA-metylering

Servicefördelar

● Över 5 års erfarenhet på PacBio sekvenseringsplattform med tusentals stängda projekt med olika arter.
● Bmkgene är en officiell partner för Oxford Nanopore, med dubbel plattform RNA/DNA -certifiering.
● Det finns mainstream -modeller av sequencers med fullständig utrustning och tillräcklig sekvenseringsgenomströmning.
● Baserat på Nanopore -plattformen har mer än 10 djur- och växtdevo -undersökningar publicerats i internationellt kända tidskrifter.

Provkrav


Provtyp

Belopp

Koncentration (Qubit ®)

Volym

Renhet

Andra

Genomisk DNA

Beror på datakrav

 ≥20ng/μl

≥15 ul

OD260/280 = 1,7-2,2;

OD260/230≥1,5 ;

Clear Peak vid 260 nm , inga föroreningar

Koncentration måste mätas med qubit och qubit/nanopore ≤ 2

Total RNA

≥1,2 ug

≥100 μg/μl

≥15 ul

OD260/280 = 1,7-2,5;

OD260/230 = 0,5-2,5 ; Inga föroreningar

RIN -värde ≥7,5

 

Serviceflöde

provberedning

Provberedning

Biblioteksförberedelse

Bibliotekskonstruktion

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalys

Dataanalys

Prov QC

Projektleverans


  • Tidigare:
  • Nästa:

  • Datakvalitetsbedömning av DNA -prov

    Tabell 1. Statistik om ren data.

    Bmkid

    rawsqnum

    rentseqnum

    städning

    rensning

    rensning

    rengöring

    rentmaxel

    rentmeanqual

    DNA_BMK01

    1,218,239

    26.37

    1,121,736

    25,90

    28,014

    15 764

    23,090

    143,181

    9

    Datakvalitetsbedömning av RNA -prov

    Tabell 1. Statistik om ren data.

    Filnamn

    Klientid

    Readnum

    Basenum

    N50

    Efterlevnad

    Maxlängd

    Momentqscore

    RNA_BMK001

    C2

    8 947 708

    4,047,230,083

    398

    452

    129 227

    Q12

    Bild 1. Läs längdfördelningen

    A3

    Bild 2. Kvalitetsscore -fördelning av rena data

    A4

    Bild 3. Längd och kvalitetsscore -fördelning av rena data

    A5

    få en offert

    Skriv ditt meddelande här och skicka det till oss

    Skicka ditt meddelande till oss: