● Med två möjliga alternativ att välja mellan beroende på önskad grad av genomens fullständighet.
● Utkast till genomalternativ: Kortläst sekvensering med Illumina Novaseq PE150.
● Slutför 0 Gap genom.
● Långläst sekvensering på Nanopore Prometion 48 eller PacBio Revio för genommontering.
● Kortläst sekvensering på Illumina Novaseq för genomvalidering och felkorrigering (nanopore) eller för att generera ett utkast genom.
●Noll-gap genom garanterat: Detta beror på integrationen av Illumina -sekvensering med lång läsning av sekvensering (nanopore eller pacbio).
●Komplett Bioinformatics Workflow:Detta inkluderar genommontering och förutsägelse av flera genomiska element, funktionell gennotation och genomvisualisering av genom såsom circos plot.
●Omfattande expertis: Med över 20 000 mikrobiella genomer som är sammansatta, tar BMKGene över ett decennium av erfarenhet, ett mycket skickligt analysteam, omfattande innehåll och utmärkt stöd efter försäljning.
●Support efter försäljning:Vårt åtagande sträcker sig utöver projektets slutförande med en 3-månaders serviceperiod efter försäljning. Under denna tid erbjuder vi projektuppföljning, felsökningsassistans och Q & A-sessioner för att hantera eventuella frågor relaterade till resultaten.
●Flera sekvenseringsstrategier tillgängliga:För olika forskningsmål och krav i genomens fullständighet.
Service | Sekvenseringsstrategi |
Utkast till genom | Illumina PE150 100X |
0 Gap genom | Nanopore 100x + Illumina PE150 100x Or PacBio Hifi 30x + Illumina PE150 100X (valfritt) |
Koncentration (ng/ul) | Totalt belopp (μg) | Volym (ul) | OD260/280 | OD260/230 | |
Pacbio | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1,0 |
Nanopore | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
Illumina | ≥1 | ≥0,06 | ≥20 | - | - |
· Bakterier: ≥3,5x1010 celler
Inkluderar följande analys:
● Sekvensering av datakvalitetskontroll
● Genommontering
● Genomkomponentanalys: Förutsägelse av CD -skivor och flera genomiska element
● Funktionell kommentar med flera allmänna databaser (GO, KEGG osv.) Och avancerade databaser (kort, VFDB, etc)
● Genomvisualisering
Vi tillhandahåller genomet i ett lättillgängligt FASTA -format och genomnoteringsfilen (GFF).
Gennotation - gå
Gen Annotation - Cazy kolhydrater
Genomvisualisering - Circos plot
Utforska de framsteg som underlättas av Bmkgene's Bacterial Genome Assembly Services genom en kuraterad samling publikationer.
Dai, W. et al. (2023) 'Upptäckt av Bacteroides Uniformis F18-22 som en säker och ny probiotisk bakterie för behandling av ulcerös kolit från den friska humana kolon',International Journal of Molecular Sciences, 24 (19), sid. 14669. DOI: 10.3390/IJMS241914669/S1.
Kang, Q. et al. (2021) 'Multidrug-resistent Proteus Mirabilis Isolates som bär blaoxa-1 och Blandm-1 från djurlivet i Kina: ökande folkhälsorisk',Integrativ zoologi, 16 (6), s. 798–809. doi: 10.1111/1749-4877.12510.
Wang, Tt et al. (2017) 'Komplett genomsekvens av endofyt Bacillus flexus KLBMP 4941 avslöjar sin marknadsföringsmekanism och genetisk grund för salttolerans',Journal of Biotechnology, 260, s. 38–41. doi: 10.1016/j.jbiotec.2017.09.001.
Wang, X. et al. (2021) 'Multipel-replikonresistensplasmider av Klebsiella förmedlar omfattande spridning av antimikrobiella gener',Gränser i mikrobiologi, 12, s. 754931. DOI: 10.3389/fmicb.2021.754931/bibtex.