Exclusive Agency for Korea

条形 Banner-03

Produkt

De novo bakteriemontering

图片 49

 

 

Vi tillhandahåller en komplett bakteriemonteringstjänst som garanterar 0 luckor. Detta är möjligt genom att integrera långläst sekvenseringsteknologier, såsom nanopore och pacbio för montering och kortläst sekvensering med Illumina för montering och felkorrigering av ONT-läsningar. Vår tjänst tillhandahåller det kompletta bioinformatiska arbetsflödet från montering, funktionell kommentar och avancerad bioinformatisk analys, vilket uppfyller specifika forskningsmål. Denna tjänst möjliggör utveckling av exakta referensgenom för olika genetiska och genomiska studier. Dessutom utgör det grunden för applikationer som stamoptimering, genteknik och mikrobiell teknikutveckling, vilket säkerställer tillförlitliga och gapfria genomiska data som är avgörande för att främja vetenskaplig insikt och bioteknologisk innovation.


Serviceuppgifter

Bioinformatik

Demoresultat

Presenterade publikationer

Servicefunktioner

● Med två möjliga alternativ att välja mellan beroende på önskad grad av genomens fullständighet.

● Utkast till genomalternativ: Kortläst sekvensering med Illumina Novaseq PE150.

● Slutför 0 Gap genom.

● Långläst sekvensering på Nanopore Prometion 48 eller PacBio Revio för genommontering.

● Kortläst sekvensering på Illumina Novaseq för genomvalidering och felkorrigering (nanopore) eller för att generera ett utkast genom.

Servicefördelar

Noll-gap genom garanterat: Detta beror på integrationen av Illumina -sekvensering med lång läsning av sekvensering (nanopore eller pacbio).

Komplett Bioinformatics Workflow:Detta inkluderar genommontering och förutsägelse av flera genomiska element, funktionell gennotation och genomvisualisering av genom såsom circos plot.

Omfattande expertis: Med över 20 000 mikrobiella genomer som är sammansatta, tar BMKGene över ett decennium av erfarenhet, ett mycket skickligt analysteam, omfattande innehåll och utmärkt stöd efter försäljning.

Support efter försäljning:Vårt åtagande sträcker sig utöver projektets slutförande med en 3-månaders serviceperiod efter försäljning. Under denna tid erbjuder vi projektuppföljning, felsökningsassistans och Q & A-sessioner för att hantera eventuella frågor relaterade till resultaten.

Flera sekvenseringsstrategier tillgängliga:För olika forskningsmål och krav i genomens fullständighet.

 

Tjänstespecifikationer

Service

Sekvenseringsstrategi

Utkast till genom

Illumina PE150 100X

0 Gap genom

Nanopore 100x + Illumina PE150 100x

Or

PacBio Hifi 30x + Illumina PE150 100X (valfritt)

Exempelkrav:

 

Koncentration (ng/ul)

Totalt belopp (μg)

Volym (ul)

OD260/280

OD260/230

Pacbio

≥20

≥1.2

≥20

1.7-2.2

≥1,0

Nanopore

≥40

≥2

≥20

1.7-2.2

1.0-3.0

Illumina

≥1

≥0,06

≥20

-

-

· Bakterier: ≥3,5x1010 celler

Servicearbetsflöde

provleverans

Provleverans

Biblioteksförberedelse

Bibliotekskonstruktion

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalys

Dataanalys

Efter försäljningstjänster

Efterförsäljningstjänster


  • Tidigare:
  • Nästa:

  • 23.11.7-01

    Inkluderar följande analys:

    ● Sekvensering av datakvalitetskontroll

    ● Genommontering

    ● Genomkomponentanalys: Förutsägelse av CD -skivor och flera genomiska element

    ● Funktionell kommentar med flera allmänna databaser (GO, KEGG osv.) Och avancerade databaser (kort, VFDB, etc)

    ● Genomvisualisering

    Vi tillhandahåller genomet i ett lättillgängligt FASTA -format och genomnoteringsfilen (GFF).

    Gennotation - gå

    图片 50Gen Annotation - Cazy kolhydrater

    图片 51

     

    Genomvisualisering - Circos plot

     

    图片 52 

     

    Utforska de framsteg som underlättas av Bmkgene's Bacterial Genome Assembly Services genom en kuraterad samling publikationer.

     

    Dai, W. et al. (2023) 'Upptäckt av Bacteroides Uniformis F18-22 som en säker och ny probiotisk bakterie för behandling av ulcerös kolit från den friska humana kolon',International Journal of Molecular Sciences, 24 (19), sid. 14669. DOI: 10.3390/IJMS241914669/S1.

    Kang, Q. et al. (2021) 'Multidrug-resistent Proteus Mirabilis Isolates som bär blaoxa-1 och Blandm-1 från djurlivet i Kina: ökande folkhälsorisk',Integrativ zoologi, 16 (6), s. 798–809. doi: 10.1111/1749-4877.12510.

    Wang, Tt et al. (2017) 'Komplett genomsekvens av endofyt Bacillus flexus KLBMP 4941 avslöjar sin marknadsföringsmekanism och genetisk grund för salttolerans',Journal of Biotechnology, 260, s. 38–41. doi: 10.1016/j.jbiotec.2017.09.001.

    Wang, X. et al. (2021) 'Multipel-replikonresistensplasmider av Klebsiella förmedlar omfattande spridning av antimikrobiella gener',Gränser i mikrobiologi, 12, s. 754931. DOI: 10.3389/fmicb.2021.754931/bibtex.

    få en offert

    Skriv ditt meddelande här och skicka det till oss

    Skicka ditt meddelande till oss: