Urutan génom bisulfit sakabeh (WGBS)
Whole Genome Bisulfite Sequencing (WGBS) nangtung salaku metodologi standar emas pikeun éksplorasi jero métilasi DNA, khususna posisi kalima dina sitosin (5-mC), régulator pivotal éksprési gén sareng kagiatan sélular. Prinsip dasar WGBS ngalibatkeun perlakuan bisulfit, inducing konversi sitosin unmethylated kana uracil (C ka U), bari ninggalkeun sitosin methylated unchanged. Téhnik ieu nawiskeun résolusi basis tunggal, ngamungkinkeun para panalungtik pikeun nalungtik sacara komprehensif métilome sareng mendakan pola métilasi abnormal anu aya hubunganana sareng sagala rupa kaayaan, khususna kanker. Ku ngagunakeun WGBS, para ilmuwan tiasa nampi wawasan anu teu aya tandinganana kana bentang métilasi génom-lega, nyayogikeun pamahaman anu bernuansa mékanisme épigénétik anu ngadasarkeun prosés biologis anu rupa-rupa sareng panyakit.
Fitur Service
● Merlukeun génom rujukan.
● DNA Lambda ditambahkeun pikeun ngawas efisiensi konversi bisulfit.
● Sequencing on Illumina NovaSeq.
Kaunggulan Service
●Standar Emas pikeun Panalungtikan Métilasi DNA: Téknologi pangolahan konversi methylation dewasa ieu gaduh akurasi anu luhur sareng réproduksibilitas anu saé.
●Liputan Lega sareng Resolusi Dasar Tunggal:deteksi situs methylation dina tingkat génom-lega.
●Platform lengkep:nyadiakeun hiji-eureun layanan unggulan ti processing sampel, konstruksi perpustakaan, sequencing kana analisis bioinformatics.
●Kaahlian éksténsif: kalawan proyék sequencing WGBS hasil réngsé sakuliah rupa-rupa spésiés, BMKGENE brings leuwih dasawarsa pangalaman, tim analisis kacida terampil, eusi komprehensif, sarta rojongan pos-jualan alus teuing.
●Kamungkinan Gabung sareng Analisis Transkriptomics: ngamungkinkeun pikeun analisis terpadu WGBS kalawan data omics séjén kayaning RNA-seq.
Spésifikasi sampel
| Perpustakaan | Stratégi Sequencing | Disarankeun kaluaran data | Kontrol kualitas |
| Bisulfit dirawat | Illumina PE150 | 30x jero | Q30 ≥ 85% Konversi bisulfit > 99% |
Sarat Sampel
| Konsentrasi (ng/µL) | Jumlah total (µg) | sarat tambahan | |
| DNA génomik | ≥ 5 | ≥ 400 ng | Degradasi atanapi kontaminasi kawates |
Aliran Gawé Palayanan
pangiriman sampel
ékstraksi DNA
Pangwangunan perpustakaan
Sequencing
Analisis data
Pangiriman data
Ngawengku analisis di handap ieu:
● kontrol kualitas sequencing atah;
● Mapping pikeun rujukan génom;
● Deteksi 5mC methylated basa;
● Analisis distribusi métilasi sareng anotasi;
● Analisis Wewengkon Differentially Methylated (DMRs);
● annotation fungsional gén pakait jeung DMRs.
Deteksi métilasi 5mC: jinis situs métilasi
Peta métilasi. 5mC methylation sebaran génom-lega
Anotasi wewengkon kacida métilasi
Wewengkon Bermétilisasi Béda: gén anu aya hubunganana
Wewengkon Bermétilisasi Béda: anotasi gen anu aya hubunganana (Gene Ontology)
Jelajahi kamajuan panalungtikan anu difasilitasi ku BMKGene sakabéh génom bisulfit jasa urutan ngaliwatan koleksi curated publikasi.
Fan, Y. et al. (2020) 'Analisis profil métilasi DNA salami ngembangkeun otot rangka domba nganggo urutan bisulfit sadayana-génome',BMC Génomics, 21(1), kaca 1–15. doi: 10.1186 / S12864-020-6751-5.
Zhao, X. et al. (2022) 'Novel gangguan métilasi asam deoksiribonukleat dina pagawé anu kakeunaan vinil klorida',Toksikologi sareng Kaséhatan Industri, 38(7), kaca 377–388. doi: 10.1177/07482337221098600
Zuo, J. et al. (2020) 'Hubungan antara métilasi génom, tingkat RNA non-coding, mRNA sareng métabolit dina asak buah tomat',The Plant Journal, 103(3), kaca 980–994. doi: 10.1111/TPJ.14778.
