● Selesencing di Novaseq sareng pei.
● Persiapan perpustakaan nganggo barkoding ganda, ngamungkinkeun kolonasi langkung ti 1000 conto.
● Téknik ieu tiasa dianggo atanapi tanpa genome rujukan, kalayan pipa bioinfulter anu béda kanggo unggal pasuah:
Kalayan grup Genome: snp sareng penemuan indel
Tanpa rujuk Genome: conto clustering sareng penemuan snp
● DinaDina silikoPahyangan pre-desain sababaraha énzim jarangan énzim nyabak ditingali pikeun mendakan anu ngahasilkeun distribusi saragam tina Slaf tag tés.
● salami pras-ékspérimén, tilu grup énzim diuji dina 3 conto pikeun ngahasilkeun 9 sudu anu sami tiasa milih bertentangan lawan anu optimal pikeun proyékoaksi.
{Pamanggihan spandian genetik luhur: Ngariksa sistem barkoda ganda tinggi ngan ngamungkinkeun pikeun nyebarkeun ther-anting badag anu ageung, sareng efisiensi spésifikasi lokal, pikeun ngarobih nomer tag rupa-rupa.
{ Gumantungna rendah dina genome: Éta tiasa dilarapkeun spésiés sareng atanapi tanpa genome rujukan.
{Desain skéma fleksibel: Nunggal énzim, goril-duanana ngandung asam multuksi énzim, sareng sagala rupa polulik tiasa dipilih pikeun resep kana hiji tujuan hasil anu sanés. NaDina silikoPra-desain dilaksanakeun pikeun mastikeun dentél énzim anu optimal.
{ Efisiensi tinggi dina dicampur énzimatis: Konduksi anDina silikoPra-desain sareng pre-prépositas préka réstimal langkung anyar sareng distribusi tag anu alit dina kromosom (1 Slaf tag).
{Kaahlian éksténsif: Tim kami ngan mendakan kanyataan pangalaman ka unggal proyék, sareng catetan lagu ti nutup langkung leuwih 5000 proyék SEQ-SEQ-Saman Saman, sareng serangga, sareng organisme akuated.
{ Budatan bioinflow diajarkeun: BMKgene ngembangkeun jalan bioinendtur intiinendlated pikeun lolaf-Sayq pikeun mastikeun kabeta sareng akurasi tina kaluaran final.
Jenis analisa | Skala populasi anu disarankeun | Strategi seaching | |
Jerona Tag Seedencing | Nomer tag | ||
Peta genetik | 2 Kolot sareng> 150 turunan | Kolot: 20x WGS Offsping: 10x | Ukuran genome: <400 MB: WGS disarankeun <1gb: 100k tag 1-2gb :: Tag 200k > 2GB: 300k tag Tag 500k tag |
Studi pakait-relome-lega (GWAS) | ≥200 conto | 10x | |
Evolusi genetik | ≥30 conto, sareng> 10 conto tina unggal subgroup | 10x |
Konsentrasi ≥ 5 ng / μl
Jumlah jumlah ≥ 80 ng
Nanodrop Od260 / 280 = 1,6-2.5
Agarose gél: henteu atanapi definasi terbatas atanapi kontaminasi
Wadahna: 2 ml tabung
(Pikeun kalolobaan conto, kami nyarankeun henteu pikeun ngawétkeun ku étanol)
Sampel labél: conto kedah jelas dilabélan sareng idéntik pikeun ngirim conto inpormasi inpormasi.
Kiriman: És-és: conto kedah dibungkus dina kantong anu mimiti sareng dikubur dina garing.
Pemetaan pikeun rujukan Genome
Tanpa genome rujukan: kluster
Sebaran CHAAF TACS dina kromosom:
Sebaran SNP dina kromosom:
Sataun | Jurnal | IF | Judulna | Sambungan |
2022 | Komunikasi alam | 17.694 | Dasar genomis Giga-krigosom sareng giga-genome of teony tangkal Paonia ostti | Slaf-gwas |
Taun 2015 | Phyteology anyar | 7,433 | Wilayar kota domestik jangkar sobel | Slaf-gwas |
2022 | Jurnal Panaliti Adén | 12.822 | Introgén buatan genome anu lega tina gumpunan jebnadense kana g. hirsutum nembongkeun worki fouri pikeun perbaikan anu sakaligus kualitas kapasitas kapasitas sareng ngahasilkeun santét | Genetika slaft £ évolusi |
2019 | Kuburan molekular | 10.81 | Analisis Genomatik sareng Deb Novo ngungkabkeun asal usul Sangu salaku game évolusionér | Genetika slaft £ évolusi |
2019 | Genetika alam | 31.616 | Urutan genome sareng sarititas genetik tina karpét umum, ceckrinus cardifio | Peta slaf |
Taun 2014 | Genetika alam | 25.455 | Genome tina kacang busur nyayogikeun wawasan kana karyotypes lilas, polyploid Évolusi sareng domestication pamotongan. | Peta slaf |
2022 | Tabuh jurno biotechologi | 9.803 | Idéntifikasi St1 ngungkabkeun pilihan anu ngalibetkeun Hitchhiking of Corphology sareng eusi minyak salami domestication kedelah | Pangwangunan Slafer |
2022 | Jurnal Komértrana Internasional | 6.208 | Pangaruh sareng DNA spider pikeun Mylis Mymus Mymus 2ns (2D) Ningkatkeun chromosom | Pangwangunan Slafer |
Sataun | Jurnal | IF | Judulna | Sambungan |
2023 | Paket di Almér | 6.735 | Petikan QTL sareng analisa transkripom eusi gula nalika tipeu buah pirrifolia pyrfolia | Peta genetik |
2022 | Tabuh jurno biotechologi | 8.154 | Idéntifikasi St1 ngungkabkeun pilihan anu ngalibetkeun Hitchhiking of Cara Morphologic sareng eusi minyak salami domestication sounder
| SNP nelepon |
2022 | Paket di Almér | 6.623 | Toppienssi bakar anu lega leutik mah cemurotypes dina lingkungan halus.
| Gdas |