Ngurangan Representasi Bisulfite Sequencing (RRBS)
Ngurangan Répréséntasi Bisulfite Sequencing (RRBS) geus mecenghul salaku alternatif ongkos-éféktif jeung efisien keur sakabeh Génom Bisulfite Sequencing (WGBS) dina panalungtikan DNA methylation. Bari WGBS nyadiakeun wawasan komprehensif ku examining sakabéh génom dina resolusi basa tunggal, ongkos tinggi na bisa jadi faktor ngawatesan. RRBS sacara strategis ngirangan tantangan ieu ku cara nganalisa sacara selektif sabagian wawakil génom. Métodologi ieu ngandelkeun pengayaan daérah anu beunghar pulo CpG ku belahan MspI dituturkeun ku pilihan ukuran fragmen 200-500/600 bps. Akibatna, ngan wewengkon proksimal ka pulo CpG nu diurutkeun, sedengkeun nu mibanda pulo CpG jauh teu kaasup ti analisis. Prosés ieu, digabungkeun jeung sequencing bisulfite, ngamungkinkeun pikeun deteksi resolusi luhur methylation DNA, sarta pendekatan sequencing, PE150, museurkeun husus dina tungtung inserts tinimbang tengah, ngaronjatkeun efisiensi profil methylation. RRBS mangrupikeun alat anu teu ternilai anu ngamungkinkeun panalungtikan métilasi DNA biaya-éféktif sareng ningkatkeun pangaweruh mékanisme epigenetik.
Fitur Service
● Merlukeun génom rujukan.
● DNA Lambda dipaké pikeun ngawas efisiensi konversi bisulfit.
● efisiensi nyerna MspI ogé diawaskeun.
● nyerna énzim ganda pikeun sampel tutuwuhan.
● Sequencing on Illumina NovaSeq.
Kaunggulan Service
●Cost-éféktif jeung Éfisién Alternatif pikeun WGBS: ngamungkinkeun analisa dilaksanakeun dina biaya anu langkung handap sareng syarat sampel anu langkung handap.
●Platform lengkep:nyadiakeun hiji-eureun layanan unggulan ti ngolah sampel, konstruksi perpustakaan, sarta sequencing kana analisis bioinformatics.
●Kaahlian éksténsif: kalawan proyék sequencing RRBS hasil réngsé sakuliah rupa-rupa spésiés, BMKGENE brings leuwih dasawarsa pangalaman, tim analisis kacida terampil, eusi komprehensif, sarta rojongan pos-jualan alus teuing.
Spésifikasi Service
| Perpustakaan | Stratégi Sequencing | Disarankeun kaluaran data | Kontrol kualitas |
| MspI dicerna jeung Bisulfite diperlakukeun perpustakaan | Illumina PE150 | 8 Gb | Q30 ≥ 85% Konversi bisulfit > 99% Efisiensi motong MspI> 95% |
Sarat Sampel
| Konsentrasi (ng/µL) | Jumlah total (µg) |
| |
| DNA génomik | ≥ 30 | ≥ 1 | Degradasi atanapi kontaminasi kawates |
Aliran Gawé Palayanan
pangiriman sampel
Pangwangunan perpustakaan
Sequencing
Analisis data
jasa saatos-diobral
Ngawengku analisis di handap ieu:
● kontrol kualitas sequencing atah;
● Mapping pikeun rujukan génom;
● Deteksi 5mC methylated basa jeung idéntifikasi motif;
● Analisis sebaran methylation jeung ngabandingkeun sampel;
● Analisis Wewengkon Differentially Methylated (DMRs);
● annotation fungsional gén pakait jeung DMRs.
Kontrol kualitas: efisiensi nyerna (dina pemetaan génom)
Kontrol kualitas: konversi bisulfit (dina ékstraksi inpormasi métilasi)
Peta métilasi: 5mC métilasi sebaran génom-lega
Perbandingan sampel: Analisis Komponén Principal
Analisis Differentially Methylated Region (DMRs): peta panas
Jelajahi kamajuan panalungtikan anu difasilitasi ku BMKGene sakabéh génom bisulfit jasa urutan ngaliwatan koleksi curated publikasi.
Li, Z. et al. (2022) 'Reprogramming High-kasatiaan kana sél kawas Leydig ku aktivasina CRISPR jeung faktor paracrine',PNAS Nexus, 1(4). doi: 10.1093 / PNASNEXUS / PGAC179.
Tian, H. et al. (2023) 'Analisis métilasi DNA lega génom komposisi awak dina kembar monozigot Cina',Éropa Journal of Panalungtikan klinis, 53(11), kc. e14055. doi: 10.1111 / ECI.14055.
Wu, Y. et al. (2022) 'DNA methylation and waist-to-hip ratio: an epigenome-wide association study in Chinese monozygotic twins',Journal of Endocrinological Investigation, 45(12), kaca 2365–2376. Doi: 10.1007 / S40618-022-01878-4.
