Urutan RNA Prokariot
Fitur
● processing sampel RNA aub rRNA depletion dituturkeun ku persiapan perpustakaan RNA arah.
● Analisis bioinformatic dumasar kana alignment kana génom rujukan
● Analisis ngawengku éksprési gén jeung DEGs tapi ogé struktur transkrip jeung analisis sRNA
Kaunggulan Service
●Kontrol Kualitas anu ketat: urang nerapkeun titik kontrol inti dina sagala tahapan, ti sampel jeung persiapan perpustakaan nepi ka sequencing na bioinformatics. Ngawaskeun taliti ieu mastikeun pangiriman hasil kualitas luhur sacara konsisten.
●Data Sequencing Strand-spésifik: alatan persiapan perpustakaan RNA keur arah, sangkan idéntifikasi transkrip anti rasa.
●Analisis Lengkep Disesuaikeun sareng Transkriptom Prokariot: pipa bioinformatic ngawengku teu ukur analisis ekspresi gén tapi ogé analisis struktur transkrip, kaasup idéntifikasi of operons, UTRs na promoters. Éta ogé kalebet analisa sRNA, nyaéta anotasi sareng prediksi struktur sekundér sareng target.
●Rojongan Post-Penjualan: komitmen urang ngalegaan saluareun parantosan proyék kalawan 3-bulan periode jasa sanggeus-diobral. Salila ieu, kami nawiskeun nurutan proyék, bantuan ngungkulan, sareng sesi Q&A pikeun ngajawab patarosan naon waé anu aya hubunganana sareng hasil.
Syarat Sampel sareng Pangiriman
| Perpustakaan | Stratégi sequencing | Data disarankeun | Kontrol kualitas |
| rRNA depleted perpustakaan arah | Illumina PE150 | 1-2 Gb | Q30≥85% |
Syarat Sampel:
| Conc.(ng/μl) | Jumlah (μg) | Kasucian | Integritas |
| ≥ 50 | ≥ 1 | OD260/280 = 1.8-2.0 OD260/230 = 1.0-2.5 Kawates atanapi henteu aya kontaminasi protéin atanapi DNA anu dipidangkeun dina gél. | RIN≥6.5 |
Disarankeun Pangiriman Sampel
Wadahna: 2 ml centrifuge tube (Timah foil teu dianjurkeun)
Sampel panyiri: Grup + ulangan misalna A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Pangiriman:
1. Garing-és: Sampel kudu dipak dina kantong jeung dikubur di garing-és.
2. tabung RNAstable: sampel RNA bisa garing dina tube stabilisasi RNA (misalna RNAstable®) jeung shipped dina suhu kamar.
Aliran Gawé Palayanan
pangiriman sampel
Pangwangunan perpustakaan
Sequencing
Analisis data
jasa saatos-diobral
Analisis Bioinformatic Workflow
Ngawengku analisis handap:
● kadali kualitas data atah
● Alignment kana génom rujukan
● Penilaian Kualitas Perpustakaan: fragméntasi RNA randomness, ukuran sisipan jeung sequencing jenuh
● annotation fungsional gén coding diprediksi
● Analisis Babasan: korelasi sareng Analisis Komponen Pokok (PCA)
● Éksprési Gén Diferensial (DEG)
● annotation Fungsional jeung pengayaan DEGs
● Analisis sRNA: prediksi, annotation, target, jeung prediksi struktur sekundér
● Analisis Struktur Transkrip: operon, posisi awal jeung tungtung, Wewengkon Untranslated (UTS), promotor, jeung analisis SNP/InDel
Sequencing jenuh
Anotasi fungsional gén pengkodean
Korélasi antara sampel
Analisis Differential Expressed Gén (DEGs).
Analisis pengayaan fungsional
anotasi sRNA
Jelajahi kamajuan anu difasilitasi ku BMKGene's Nanopore's full-length mRNA sequencing services in this featured publication.
Guan, CP et al. (2018) 'Parobihan Transkriptom Global tina Staphylococcus epidermidis Pembentuk Biofilm Ngabales Total Alkaloid Sophorea alopecuroides',Polandia Journal of Mikrobiologi, 67(2), kc. 223. doi: 10.21307 / PJM-2018-024.
