-
BMKMANU S3000_Spatial Transcriptome
Transcriptomics spasial nangtung di forefront inovasi ilmiah, empowering peneliti pikeun delve kana pola éksprési gén intricate dina jaringan bari preserving konteks spasial maranéhanana. Ditengah rupa-rupa platform, BMKGene geus ngembangkeun BMKManu S3000 Spatial Transcriptome Chip, boasting resolusi ditingkatkeun tina 3.5µm, ngahontal rentang subsélular, sarta sangkan setelan resolusi multi-level. Chip S3000, nampilkeun sakitar 4 juta bintik, nganggo microwells anu dilapis ku manik-manik anu dieusian ku panyilidikan panangkepan barcode sacara spasial. A perpustakaan cDNA, enriched kalawan barkod spasial, disiapkeun tina chip S3000 sarta salajengna diurutkeun dina platform Illumina NovaSeq. Kombinasi sampel spatially barcoded jeung UMIs ensures akurasi sarta spésifisitas data dihasilkeun. Chip BMKManu S3000 pisan serbaguna, nawiskeun setélan résolusi multi-tingkat anu tiasa disaluyukeun saé kana jaringan anu béda sareng tingkat detil anu dipikahoyong. adaptability Ieu posisi chip salaku pilihan beredar pikeun rupa-rupa studi transcriptomics spasial, mastikeun clustering spasial tepat kalawan noise minimal. Pamakéan téknologi ségméntasi sél sareng BMKManu S3000 ngamungkinkeun delimitasi data transkripsi kana wates sél, hasilna analisa anu ngagaduhan harti biologis langsung. Salajengna, résolusi S3000 anu ningkat nyababkeun jumlah gén sareng UMI anu langkung ageung dideteksi per sél, ngamungkinkeun analisa anu langkung akurat ngeunaan pola transkripsi spasial sareng clustering sél.
-
Sequencing RNA inti tunggal
Ngembangkeun téknik néwak sél tunggal sareng téknik konstruksi perpustakaan khusus, ditambah ku sekuensing throughput tinggi, parantos ngarobih studi éksprési gén dina tingkat sél. Terobosan ieu ngamungkinkeun analisa anu langkung jero sareng langkung komprehensif ngeunaan populasi sél kompléks, ngatasi watesan anu aya hubunganana sareng ekspresi gen rata-rata dina sadaya sél sareng ngajaga heterogénitas anu leres dina populasi ieu. Bari sequencing RNA sél tunggal (scRNA-seq) boga kaunggulan undeniable, éta encounters tantangan dina jaringan tangtu dimana kreasi gantung sél tunggal kabukti hésé tur merlukeun sampel seger. Di BMKGene, urang ngatasi halangan ieu ku nawiskeun sekuen RNA inti tunggal (snRNA-seq) nganggo téknologi 10X Genomics Chromium canggih. Pendekatan ieu ngalegaan spéktrum sampel anu cocog pikeun analisis transkriptom dina tingkat sél tunggal.
Isolasi inti dilaksanakeun ngaliwatan chip 10X Genomics Chromium inovatif, nampilkeun sistem mikrofluidik dalapan saluran sareng pameuntasan ganda. Dina sistem ieu, manik gél anu ngandung barcode, primer, énzim, sareng inti tunggal dibungkus dina tetes minyak ukuran nanoliter, ngabentuk Gel Bead-in-Emulsion (GEM). Saatos formasi GEM, lisis sél sareng sékrési barkod lumangsung dina unggal GEM. Saterusna, molekul mRNA ngalaman transkripsi sabalikna kana cDNAs, incorporating 10X barkod jeung Unique Molecular Identifiers (UMIs). cDNAs ieu lajeng subjected kana konstruksi perpustakaan sequencing baku, facilitating hiji éksplorasi mantap tur komprehensif ngeunaan profil ekspresi gén dina tingkat sél tunggal.
Platform: 10 × Genomics Chromium sareng Platform Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Transkriptomi spasial nyaéta téknologi canggih anu ngamungkinkeun panalungtik pikeun nalungtik pola éksprési gén dina jaringan bari ngajaga kontéks spasialna. Hiji platform kuat dina domain ieu 10x Genomics Visium gandeng jeung Illumina sequencing. Prinsip 10X Visium perenahna dina chip husus kalawan aréa newak ditunjuk dimana bagian jaringan disimpen. Wewengkon newak ieu ngandung bintik barcoded, masing-masing pakait sareng lokasi spasial unik dina jaringan. Molekul RNA anu kawengku tina jaringan teras dilabélan ku identifier molekular unik (UMI) salami prosés transkripsi sabalikna. Titik barcode sareng UMI ieu ngamungkinkeun pemetaan spasial anu tepat sareng kuantifikasi ekspresi gen dina resolusi sél tunggal. Kombinasi sampel spatially barcoded jeung UMIs ensures akurasi sarta spésifisitas data dihasilkeun. Ku ngagunakeun téknologi Transcriptomik Spatial ieu, panalungtik bisa meunangkeun pamahaman anu leuwih jero ngeunaan organisasi spasial sél jeung interaksi molekular kompléks nu lumangsung dina jaringan, nawarkeun wawasan invaluable kana mékanisme kaayaan prosés biologis dina sababaraha widang, kaasup onkologi, neurosains, biologi developmental, imunologi. , jeung studi botani.
Platform: 10X Genomics Visium sareng Illumina NovaSeq
