-
Génomics komparatif
Génomi komparatif ngalibatkeun pamariksaan jeung ngabandingkeun sakabéh runtuyan génom jeung struktur diantara spésiés béda. Widang ieu narékahan pikeun ngungkabkeun évolusi spésiés, ngodekeun pungsi gén, sareng ngécéskeun mékanisme pangaturan genetik ku cara ngidentipikasi struktur sareng unsur urutan anu dilestarikan atanapi divergen dina sagala rupa organisme. Hiji studi génomics komparatif komprehensif ngawengku analisa kayaning kulawarga gen, ngembangkeun évolusionér, sakabeh-genom duplikasi kajadian, sarta dampak tekanan selektif.
-
Genetika évolusionér
Populasi sareng platform analisa genetik évolusionér diadegkeun dumasar kana pangalaman masif anu akumulasi dina tim R&D BMK mangtaun-taun. Éta mangrupikeun alat anu ramah pangguna khususna pikeun panaliti anu henteu jurusan bioinformatika. Platform ieu ngamungkinkeun analisa dasar anu aya hubunganana sareng genetik évolusionér kalebet konstruksi tangkal filogenetik, analisa disequilibrium linkage, penilaian keragaman genetik, analisis sapuan selektif, analisis kekerabatan, PCA, analisis struktur populasi, jsb.
-
Majelis Génom Dumasar Hi-C
Hi-C nyaéta métode anu dirarancang pikeun néwak konfigurasi kromosom ku cara ngahijikeun interaksi dumasar-deukeut probing jeung urutan throughput tinggi. Inténsitas interaksi ieu dipercaya aya hubunganana négatip sareng jarak fisik dina kromosom. Ku alatan éta, data Hi-C dipaké pikeun pituduh clustering, susunan, jeung orientasi tina runtuyan dirakit dina draf génom sarta anchoring maranéhanana kana sababaraha kromosom. Téknologi ieu nguatkeun rakitan génom tingkat kromosom dina henteuna peta genetik dumasar populasi. Unggal génom tunggal peryogi Hi-C.
-
Tutuwuhan / Sato De Novo Génom Sequencing
De Novosequencing nujul kana pangwangunan sakabéh génom spésiés ngagunakeun téhnologi sequencing dina henteuna génom rujukan. Perkenalan sareng adopsi nyebar tina urutan generasi katilu, anu nampilkeun bacaan anu langkung panjang, parantos ningkat sacara signifikan rakitan génom ku ningkatkeun tumpang tindihna antara bacaan. Ningkatkeun ieu hususna penting nalika nanganan génom anu nangtang, sapertos anu nunjukkeun hétérozigositas anu luhur, rasio anu luhur pikeun régional repetitive, polyploids, sareng daérah anu unsur repetitive, eusi GC abnormal, atanapi pajeulitna anu luhur anu biasana kirang dirakit nganggo sekuen anu dibaca pondok. nyalira.
Solusi hiji-eureun kami nyayogikeun jasa urutan terintegrasi sareng analisa bioinformatik anu nganteurkeun génom dirakit de novo kualitas luhur. Survei génom awal sareng Illumina nyayogikeun perkiraan ukuran sareng pajeulitna génom, sareng inpormasi ieu dianggo pikeun nungtun léngkah salajengna tina sekuen anu dibaca panjang sareng PacBio HiFi, dituturkeun kude novoassembly of contigs. Pamakéan salajengna tina rakitan HiC ngamungkinkeun anchoring tina contigs kana génom, meunangkeun rakitan tingkat kromosom. Tungtungna, génom ieu annotated ku prediksi gén jeung ku sequencing gén dikedalkeun, resorting ka transcriptomes kalawan pondok tur panjang dibaca.
-
Manusa Sakabeh Exome Sequencing
Manusa Whole exome sequencing (hWES) sacara lega diaku salaku pendekatan sekuen anu murah sareng kuat pikeun nunjukkeun mutasi anu nyababkeun panyakit. Sanajan ngan ukur 1.7% tina sakabéh génom, ékson maénkeun peran anu penting ku cara langsung ngagambarkeun profil fungsi protéin total. Utamana, dina génom manusa, langkung ti 85% mutasi anu aya hubunganana sareng panyakit muncul dina daérah pengkodean protéin. BMKGENE nawiskeun jasa urutan exome manusa anu komprehensif sareng fleksibel sareng dua strategi nangkep exon anu béda anu sayogi pikeun nyumponan sababaraha tujuan panalungtikan.
-
Spésifik-Locus Amplified Fragmén Sequencing (SLAF-Seq)
Genotyping-throughput tinggi, utamana dina populasi skala badag, mangrupa hambalan dasar dina studi pakaitna genetik jeung nyadiakeun dasar genetik pikeun kapanggihna gén fungsional, analisis évolusionér, jsb Gantina jero sakabeh genom ulang sequencing,Ngurangan Répréséntasi Génom Sequencing (RRGS)sering dianggo dina studi ieu pikeun ngaleutikan biaya urutan per sampel bari ngajaga efisiensi lumrah dina kapanggihna spidol genetik. RRGS ngahontal ieu ku cara nyerna DNA jeung énzim pangwatesan sarta fokus dina rentang ukuran fragmen husus, sahingga sequencing ukur fraksi génom. Di antara rupa-rupa metodologi RRGS, Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF) mangrupikeun pendekatan anu disesuaikan sareng kualitas luhur. Metoda ieu, dikembangkeun sacara mandiri ku BMKGene, ngaoptimalkeun set énzim pangwatesan pikeun unggal proyék. Ieu mastikeun ngahasilkeun sajumlah ageung tag SLAF (daérah 400-500 bps tina génom anu diurutkeun) anu disebarkeun sacara merata di sakuliah génom bari sacara efektif ngahindarkeun daérah anu repetitive, ku kituna ngajamin panemuan pananda genetik anu pangsaéna.
-
Illumina perpustakaan pra-dijieun
Téknologi pangurutan Illumina, dumasar kana Sequencing by Synthesis (SBS), mangrupikeun inovasi NGS anu dianut sacara global, tanggung jawab pikeun ngahasilkeun langkung ti 90% data pangurutan dunya. Prinsip SBS ngalibatkeun pencitraan fluoresensi dilabélan terminator malikkeun sakumaha unggal dNTP ditambahkeun, sarta salajengna dibeulah pikeun ngidinan incorporation tina basa salajengna. Kalawan sakabeh opat dNTPs terminator-kabeungkeut malik hadir dina unggal siklus sequencing, kompetisi alam ngaminimalkeun bias incorporation. Téknologi serbaguna ieu ngadukung perpustakaan tunggal dibaca sareng dipasangkeun-tungtung, nyayogikeun sajumlah aplikasi génomik. Kamampuan throughput tinggi Illumina sequencing sareng posisi presisi salaku batu pondasi dina panalungtikan génomics, nguatkeun élmuwan pikeun ngabongkar intricacies génom kalayan detil sareng efisiensi anu teu cocog.
Ladenan pangurutan perpustakaan anu tos didamel kami ngamungkinkeun para nasabah nyiapkeun perpustakaan urutan tina sababaraha sumber (mRNA, genom genom, amplicon, perpustakaan 10x, sareng anu sanésna). Salajengna, perpustakaan ieu tiasa dikirim ka pusat sekuensing kami pikeun kontrol kualitas sareng urutan dina platform Illumina.
