-
Pakakas
BMKCloud mangrupakeun platform bioinformatic ngarah nyadiakeun solusi hiji-eureun pikeun program génomik, nu loba dipercaya ku peneliti di sagala rupa arena kaasup médis, tatanén, lingkungan, jsb BMKCloud komitmen nyadiakeun layanan terpadu, dipercaya jeung efisien kaasup platform analisis bioinformatic jeung parabot. , sumberdaya komputasi, database publik, kursus online bioinformtic, jsb BMKCloud boga rupa-rupa parabot bioinformatic mindeng dipaké kaasup annotation gén, évolusionér. parabot genetik, ncRNA, kontrol kualitas data, assembly, alignment, ékstraksi data, mutations, statistik, inohong generator, analisis runtuyan, jsb.
-
Majelis Génom Baktéri de novo
Urang nyadiakeun layanan assembly génom baktéri lengkep, ngajamin 0 sela. Ieu mungkin ku integrasi téknologi sequencing lila-baca, kayaning Nanopore na PacBio pikeun assembly na pondok-baca sequencing kalawan Illumina pikeun validasi assembly sarta koreksi kasalahan ONT berbunyi. Ladenan kami nyayogikeun alur kerja bioinformatik lengkep tina perakitan, anotasi fungsional, sareng analisis bioinformatik canggih, minuhan tujuan panalungtikan khusus. Ladenan ieu ngamungkinkeun ngembangkeun génom rujukan anu tepat pikeun sagala rupa studi genetik sareng génomik. Salaku tambahan, éta janten dasar pikeun aplikasi sapertos optimasi galur, rékayasa genetik, sareng pamekaran téknologi mikroba, mastikeun data génomik anu dipercaya sareng bébas gap penting pikeun ngamajukeun wawasan ilmiah sareng inovasi biotéhnologi.
-
RNA leutik
RNA leutik mangrupikeun jinis RNA non-coding pondok kalayan panjang rata-rata 18-30 nt, kalebet miRNA, siRNA sareng piRNA. RNA leutik ieu geus sacara masif dilaporkeun aub dina sagala rupa prosés biologis kayaning degradasi mRNA, inhibisi tarjamahan, formasi heterochromatin, jsb Analisis sequencing SmallRNA geus loba dilarapkeun dina studi ngeunaan ngembangkeun sato / tutuwuhan, kasakit, virus, jsb RNA leutik. platform analisis sequencing diwangun ku analisis baku sarta pertambangan data canggih. Dina dasar data RNA-seq, analisa standar tiasa ngahontal idéntifikasi sareng prediksi miRNA, prediksi gén target miRNA, anotasi sareng analisis ekspresi. Analisis canggih ngamungkinkeun milarian sareng ékstraksi miRNA khusus, generasi diagram Venn, miRNA sareng gedong jaringan gén target.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS mangrupikeun platform analisis urutan ulang génom sadayana, anu dikembangkeun dumasar kana pangalaman anu beunghar dina Biomarker Technologies. Platform anu gampang dianggo ieu ngamungkinkeun pangiriman gancang alur kerja analisis terpadu ku ngan saukur netepkeun sababaraha parameter dasar, anu cocog pikeun data sequencing DNA anu dihasilkeun tina platform Illumina sareng platform sequencing BGI. Platform ieu disebarkeun dina server komputasi kinerja luhur, anu nguatkeun analisis data anu efisien pisan dina waktos anu terbatas. Pertambangan data pribadi sayogi dumasar kana analisis standar, kalebet kueri gen mutated, desain primer PCR, jsb.
-
mRNA (Rujukan)
Transcriptome nyaéta tumbu antara informasi genetik génomik jeung proteome fungsi biologis. Regulasi tingkat transkripsi mangrupikeun mode pangaturan organisme anu paling penting sareng paling diulik. Sequencing Transcriptome tiasa ngaruntuykeun transkriptom iraha waé dina waktos atanapi dina kaayaan naon waé, kalayan résolusi anu akurat kana hiji nukléotida. Éta sacara dinamis tiasa ngagambarkeun tingkat transkripsi gen, sakaligus ngaidentipikasi sareng ngitung transkrip anu jarang sareng normal, sareng nyayogikeun inpormasi struktural. sampel transkrip husus.
Ayeuna, téknologi sequencing transcriptome parantos seueur dianggo dina agronomi, ubar sareng widang panalungtikan anu sanés, kalebet régulasi pangembangan sasatoan sareng pepelakan, adaptasi lingkungan, interaksi imun, lokalisasi gen, évolusi genetik spésiés sareng tumor sareng deteksi panyakit genetik.
-
Metagenomics (NGS)
Platform analisis ieu dirancang pikeun analisis data metagénomik shotgun dina dasar pangalaman taun. Ieu ngawengku workflow terpadu ngandung rupa-rupa analisa metagenomics ilahar diperlukeun kaasup ngolah data, studi tingkat spésiés, studi tingkat fungsi gén, metagenome binning, jsb Sajaba ti éta, parabot pertambangan data ngaropéa sadia kana workflow analisis baku, kaasup query gén jeung spésiés. , setelan parameter, ngahasilkeun inohong pribadi, jsb.
-
LncRNA
RNA non-coding anu panjang (lncRNA) mangrupikeun jinis transkrip anu panjangna langkung ti 200 nt, anu henteu tiasa kode protéin. Bukti akumulatif nunjukkeun yén sabagéan ageung lncRNAs kamungkinan pisan tiasa fungsional. Téknologi pangurutan throughput tinggi sareng alat analisa bioinformatik nguatkeun urang pikeun nembongkeun urutan lncRNA sareng inpormasi posisi langkung éfisién sareng ngakibatkeun urang mendakan lncRNA kalayan fungsi pangaturan anu penting. BMKCloud reueus nyadiakeun platform analisis urutan lncRNA konsumén urang pikeun ngahontal analisis lncRNA gancang, dipercaya jeung fléksibel.
-
GWAS
Studi asosiasi genom-lebar (GWAS) tujuanana pikeun ngaidentipikasi varian genetik (genotip) anu aya hubunganana sareng sipat khusus (fenotip). Panalitian GWA nalungtik spidol genetik ngalangkungan genom sajumlah ageung individu sareng ngaramal asosiasi genotip-fenotip ku analisa statistik dina tingkat populasi. Resequencing sakabeh génom berpotensi manggihan sakabeh varian genetik. Gandeng jeung data phenotypic, GWAS bisa diolah pikeun ngaidentipikasi phenotype patali SNPs, QTLs jeung gén calon, nu niatna nyadangkeun beternak sato / tutuwuhan modern. SLAF mangrupakeun strategi sequencing génom disederhanakeun timer dimekarkeun, nu manggihan spidol disebarkeun génom-lega, SNP. SNPs ieu, salaku spidol genetik molekular, bisa diolah pikeun studi pakaitna jeung Tret sasaran. Ieu mangrupakeun strategi ongkos-éféktif dina identifying Tret kompléks pakait variasi genetik.
-
Nanopore Full-panjangna transcriptomics
Isoform alternatif anu kompleks sareng variabel dina organisme mangrupikeun mékanisme genetik anu penting pikeun ngatur ekspresi gen sareng karagaman protéin. Idéntifikasi anu akurat ngeunaan struktur transkrip mangrupikeun dasar pikeun ulikan anu jero ngeunaan pola pangaturan éksprési gén. Platform sequencing Nanopore parantos suksés ngalaksanakeun kajian transkriptomi ka tingkat isoform. Platform analisis ieu dirancang pikeun nganalisis data RNA-Seq anu dihasilkeun dina platform Nanopore dina dasar génom rujukan, anu ngahontal analisa kualitatif sareng kuantitatif dina tingkat gen sareng tingkat transkrip.
-
sir-RNA
Circular RNA(circular) nyaéta tipe RNA non-coding, nu anyar kapanggih maénkeun peran penting dina jaringan pangaturan aub dina ngembangkeun, résistansi lingkungan, jsb. Béda ti molekul RNA linier, misalna mRNA, lncRNA, 3' jeung 5'. tungtung circRNA ngagabung babarengan pikeun ngabentuk struktur sirkular, nu nyalametkeun aranjeunna tina nyerna exonuclease sarta leuwih stabil ti lolobana RNA linier. CircRNA geus kapanggih boga fungsi rupa-rupa dina ngatur éksprési gén. CircRNA tiasa janten ceRNA, anu ngabeungkeut miRNA sacara kompetitif, katelah spons miRNA. Platform analisis urutan CircRNA nguatkeun struktur circRNA sareng analisis ekspresi, prediksi target sareng analisa gabungan sareng jinis molekul RNA anu sanés.
-
BSA
Platform Analisis Segregant Bulked diwangun ku analisa standar hiji-léngkah sareng analisa canggih sareng setélan parameter anu disaluyukeun. BSA mangrupikeun téknik anu dianggo pikeun gancang ngaidentipikasi fénotip spidol genetik anu aya hubunganana. Alur kerja utama BSA ngandung: 1. milih dua kelompok individu anu gaduh phenotypes anu kontras pisan; 2. pooling DNA, RNA atawa SLAF-seq (Dimekarkeun ku Biomarker) sadaya individu pikeun ngabentuk dua bulk DNA; 3. ngaidentipikasi sekuen diferensial ngalawan génom rujukan atawa di antara, 4. ngaramal calon numbu wewengkon ku ED jeung SNP-indéks algoritma; 5. Analisis fungsional jeung pengayaan dina gén di wewengkon calon, jsb Pertambangan leuwih maju dina data kaasup screening spidol genetik jeung desain primér ogé aya.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Platform Amplicon (16S / 18S / ITS) dikembangkeun kalayan pangalaman mangtaun-taun dina analisis proyék keragaman mikroba, anu ngandung analisa dasar standarisasi sareng analisa pribadi: analisis dasar nyertakeun eusi analisis arus utama panalungtikan mikroba ayeuna, eusi analisa beunghar sareng komprehensif, jeung hasil analisis dipidangkeun dina wangun laporan proyék; Eusi analisis pribadi rupa-rupa. Sampel tiasa dipilih sareng parameter tiasa diatur sacara fleksibel dumasar kana laporan analisis dasar sareng tujuan panalungtikan, pikeun ngawujudkeun syarat pribadi. sistem operasi Windows, basajan tur gancang.
-
Genetika évolusionér
Évolusionér Genetika nyaéta layanan sequencing komprehensif dirancang pikeun nawarkeun interpretasi insightful ngeunaan évolusi dina grup badag individu, dumasar kana variasi genetik, kaasup SNPs, InDels, SVs, sarta CNVs. Ladenan ieu nyertakeun sadaya analisa penting anu dipikabutuh pikeun ngécéskeun parobahan évolusionér sareng karakteristik genetik populasi, kalebet penilaian struktur populasi, karagaman genetik, sareng hubungan filogenetik. Leuwih ti éta, éta delves kana studi ngeunaan aliran gén, sangkan estimasi ukuran populasi éféktif jeung waktu divergénsi. Studi genetik évolusionér ngahasilkeun wawasan anu berharga kana asal-usul sareng adaptasi spésiés.
Di BMKGENE, kami nawiskeun dua cara pikeun ngalaksanakeun studi genetika évolusionér dina populasi ageung: ngagunakeun urutan génom sadayana (WGS) atanapi milih metode pangurutan génom répréstasi anu diréduksi, Spesifik-Locus Amplified Fragment (SLAF) anu dikembangkeun di bumi. Bari WGS cocog génom leutik, SLAF muncul salaku alternatif ongkos-éféktif pikeun diajar populasi badag kalawan génom panjang, éféktif ngaminimalkeun waragad sequencing.
