-
Metagénomic Sequencing -NGS
Metagenom nyaéta kumpulan tina total bahan genetik tina komunitas campuran organisme, sapertos metagenom lingkungan sareng manusa. Éta ngandung génom mikroorganisme anu tiasa dibudidayakeun sareng henteu tiasa dibudidayakeun. Shotgun metagénomic sequencing kalawan NGS ngamungkinkeun ulikan bentang génomik intricate ieu study dina sampel lingkungan ku nyadiakeun leuwih ti profil taksonomi, masihan ogé wawasan granular kana diversity spésiés, dinamika kaayaanana, jeung struktur populasi kompléks. Saluareun studi taksonomi, metagenomics shotgun ogé nawiskeun sudut pandang génomics fungsional, ngamungkinkeun eksplorasi gén disandikeun sareng peran putativena dina prosés ékologis. Tungtungna, ngadegna jaringan korelasi antara elemen genetik jeung faktor lingkungan nyumbang ka pamahaman holistik tina interplay intricate antara komunitas mikroba jeung kasang tukang ékologis maranéhanana. Dina kacindekan, sequencing metagénomic nangtung salaku alat pivotal pikeun unraveling intricacies génomik rupa-rupa komunitas mikroba, illuminating hubungan multifaceted antara genetik jeung ékologi dina ekosistem kompléks ieu.
Platform: Illumina NovaSeq sareng DNBSEQ-T7
-
Metagénomic Sequencing-TGS
Metagenom nyaéta kumpulan bahan genetik tina komunitas campuran organisme, sapertos metagénom lingkungan sareng manusa. Éta ngandung génom mikroorganisme anu tiasa dibudidayakeun sareng henteu tiasa dibudidayakeun. Sequencing metagénomic ngamungkinkeun ulikan bentang génomik intricate ieu study dina sampel ékologis ku nyadiakeun leuwih ti profil taksonomi. Éta ogé nawiskeun sudut pandang génomics fungsional ku ngajalajah gén anu disandikeun sareng peran putativena dina prosés lingkungan. Bari pendekatan shotgun tradisional jeung Illumina sequencing geus loba dipaké dina studi metagénomic, mecenghulna Nanopore na PacBio lila-baca sequencing geus robah widang. Téknologi Nanopore sareng PacBio ningkatkeun analisis bioinformatik hilir, khususna rakitan metagénome, mastikeun rakitan langkung kontinyu. Laporan nunjukkeun yén metagenomics basis Nanopore sareng PacBio parantos hasil ngahasilkeun génom baktéri lengkep sareng ditutup tina mikrobiom kompléks (Moss, EL, et al., Nature Biotech, 2020). Ngahijikeun bacaan Nanopore sareng bacaan Illumina nyayogikeun pendekatan strategis pikeun koréksi kasalahan, ngirangan akurasi rendah alami Nanopore. Kombinasi sinergis ieu ngamangpaatkeun kakuatan unggal platform sequencing, nawiskeun solusi anu kuat pikeun ngatasi watesan poténsial sareng ningkatkeun katepatan sareng réliabilitas analisa metagénomik.
Platform: Nanopore PromethION 48, Illumia sareng PacBio Revio
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Gén 16S jeung 18S rRNA, babarengan jeung wewengkon Internal Transcribed Spacer (ITS), jadi spidol sidik sidik molekuler pivotal alatan kombinasi maranéhanana wewengkon kacida konservasi jeung hyper-variabel, nyieun eta alat invaluable pikeun characterizing organisme prokariot jeung eukariot. Amplifikasi sareng urutan daérah ieu nawiskeun pendekatan bébas isolasi pikeun nalungtik komposisi mikroba sareng karagaman dina sagala rupa ékosistem. Bari sequencing Illumina ilaharna nargétkeun wewengkon hypervariable pondok kawas V3-V4 of 16S na ITS1, éta geus nunjukkeun yén annotation taksonomi unggul bisa dihontal ku sequencing panjang pinuh ku 16S, 18S, sarta ITS. Pendekatan komprehensif ieu ngahasilkeun persentase anu langkung luhur tina urutan anu diklasifikasikeun sacara akurat, ngahontal tingkat résolusi anu dugi ka idéntifikasi spésiés. Platform pangurutan Single-Molecule Real-Time (SMRT) PacBio nangtung ku cara nyayogikeun bacaan panjang (HiFi) anu akurat pisan anu nutupan amplikon panjang pinuh, nandingan akurasi pangurutan Illumina. Kamampuhan ieu ngamungkinkeun para panalungtik pikeun ngahontal kaunggulan anu teu aya tanding - pandangan panorama bentang genetik. Cakupan anu diperpanjang sacara signifikan ningkatkeun résolusi dina anotasi spésiés, khususna dina komunitas baktéri atanapi jamur, ngamungkinkeun pamahaman anu langkung jero ngeunaan seluk-beluk populasi mikroba.
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-NGS
Sequencing Amplicon sareng téknologi Illumina, khusus nargétkeun spidol genetik 16S, 18S, sareng ITS, mangrupikeun metode anu kuat pikeun ngabongkar filogéni, taksonomi, sareng kaayaanana spésiés dina komunitas mikroba. Pendekatan ieu ngalibatkeun sequencing wewengkon hypervariable of housekeeping spidol genetik. Asalna diwanohkeun salaku sidik molekular kuWoeses et aldina 1977, téhnik ieu geus revolutionized profil microbiome ku sangkan nganalisa isolasi-gratis. Ngaliwatan runtuyan 16S (baktéri), 18S (jamur), jeung Internal Transkripsi Spacer (ITS, fungi), panalungtik bisa ngaidentipikasi teu ngan spésiés loba pisan tapi ogé langka tur unidentified. Diadopsi sacara lega salaku alat pivotal, sekuen amplicon parantos janten instrumental pikeun ngabédakeun komposisi mikroba diferensial dina rupa-rupa lingkungan, kalebet sungut manusa, peujit, bangku, sareng saluareun.
-
Baktéri sarta jamur sakabeh Génom Re-Sequencing
Proyék pangurutan ulang sakabeh génom baktéri sareng jamur penting pikeun ngamajukeun génom mikroba ku cara ngarengsekeun sareng ngabandingkeun génom mikroba. Ieu ngagampangkeun rékayasa fermentasi, optimasi prosés industri, sareng eksplorasi jalur métabolisme sekundér. Salajengna, sekuen ulang jamur sareng baktéri penting pisan pikeun ngartos adaptasi lingkungan, ngaoptimalkeun galur, sareng ngungkabkeun dinamika évolusi genetik, kalayan implikasi anu lega dina ubar, tatanén, sareng élmu lingkungan.
-
Urutan RNA Prokariot
Urutan RNA nguatkeun profil komprehensif sadaya transkrip RNA dina sél dina kaayaan spésifik. Téknologi canggih ieu janten alat anu kuat, ngabuka profil éksprési gen anu rumit, struktur gen, sareng mékanisme molekular anu aya hubunganana sareng prosés biologis anu rupa-rupa. Diadopsi sacara lega dina panalungtikan dasar, diagnostik klinis, sareng pamekaran ubar, sekuen RNA nawiskeun wawasan ngeunaan intricacies dinamika sélulér sareng régulasi genetik. Pangolahan sampel RNA prokariot kami disaluyukeun pikeun transkriptom prokariot, ngalibetkeun deplesi rRNA sareng persiapan perpustakaan arah.
Platform: Illumina NovaSeq
-
Sequencing Metatranscriptome
Ngamangpaatkeun téknologi pangurutan Illumina, jasa pangurutan metatranscriptome BMKGENE ngungkabkeun éksprési gen dinamis tina rupa-rupa mikroba, ngawengku eukariot nepi ka prokariot jeung virus, dina lingkungan alam saperti taneuh, cai, laut, tai, jeung peujit. Ladenan komprehensif kami nguatkeun panalungtik pikeun neuleuman profil ekspresi gen lengkep komunitas mikroba kompleks. Saluareun analisa taksonomi, jasa urutan metatranscriptome kami ngagampangkeun éksplorasi kana pengayaan fungsional, nyéépkeun gén anu dibédakeun sareng peranna. Teangan kabeungharan wawasan biologis nalika anjeun nganapigasi bentang kompleks éksprési gen, karagaman taksonomi, sareng dinamika fungsional dina relung lingkungan anu rupa-rupa ieu.
-
Majelis Génom Jamur De novo
BMKGENE nawarkeun solusi serbaguna pikeun génom jamur, catering ka rupa-rupa kaperluan panalungtikan sarta completeness génom dipikahoyong. Ngamangpaatkeun runtuyan Illumina pondok-baca nyalira ngamungkinkeun generasi draf génom. Maca pondok sareng sekuen anu dibaca panjang nganggo Nanopore atanapi Pacbio digabungkeun pikeun génom jamur anu langkung saé kalayan kontig anu langkung panjang. Sumawona, ngahijikeun urutan Hi-C langkung ningkatkeun kamampuan, ngamungkinkeun pikeun ngahontal génom tingkat kromosom lengkep.
-
Majelis Génom Baktéri de novo
Urang nyadiakeun layanan assembly génom baktéri lengkep, ngajamin 0 sela. Ieu mungkin ku integrasi téknologi sequencing lila-baca, kayaning Nanopore na PacBio pikeun assembly na pondok-baca sequencing kalawan Illumina pikeun validasi assembly sarta koreksi kasalahan ONT berbunyi. Ladenan kami nyayogikeun alur kerja bioinformatik lengkep tina perakitan, anotasi fungsional, sareng analisis bioinformatik canggih, minuhan tujuan panalungtikan khusus. Ladenan ieu ngamungkinkeun ngembangkeun génom rujukan anu tepat pikeun sagala rupa studi genetik sareng génomik. Salaku tambahan, éta janten dasar pikeun aplikasi sapertos optimasi galur, rékayasa genetik, sareng pamekaran téknologi mikroba, mastikeun data génomik anu dipercaya sareng bébas gap penting pikeun ngamajukeun wawasan ilmiah sareng inovasi biotéhnologi.
