Transkriptom panjang Pacbio

PacBio Full-Length Transcriptome Sequencing, Isoseq, ngamungkinkeun idéntifikasi akurat tina isoforms transkrip, masihan terang kana poliadénilasi alternatif sareng splicing, sareng ngarah kana analisis ekspresi gen anu langkung akurat. Jalur pipa Transcriptome Full-Length BMKCloud PacBio dirancang pikeun nganalisis perpustakaan cDNA anu diurutkeun dina modeu Circular Consensus Sequencing (CCS) sareng ngidentipikasi urutan Full-Length Non-Chimeric (FLNC), anu teras dikelompokkeun kana transkrip anu henteu kaleuleuwihan. Analisis BUSCO saterusna assesses completeness tina assembly transcriptome. Tina transkriptom anu dirakit, sababaraha analisa dilakukeun: splicing alternatif, ulangan sekuen sederhana (SSR), prediksi lncRNA sareng gen target anu cocog, prediksi gén novél, analisis kulawarga gen, analisis faktor transkripsi, sareng anotasi fungsional transkrip.