Sorotan
Dina webinar dua jam ieu, urang ngahargaan pisan pikeun ngondang genep ahli dina arena génomics pamotongan. Panyatur kami bakal masihan interpretasi anu jero dina dua studi génomik Rye, anu nembé diterbitkeun dinaGenetika Alam:
1. Rakitan génom skala kromosom nyadiakeun wawasan biologi rye, évolusi, jeung poténsi agronomic
2. A assembly génom kualitas luhur highlights Rye ciri génomik jeung gén agronomically penting
Ogé, kami bungah gaduh Élmuwan R&D Senior Biomarker Technologies pikeun ngabagi pangalamanana dina assembly génom de novo.
Agenda
09:00 Cét
Ucapan Sambutan
Zheng Hong-kun
Pangadeg & CEO Biomarker Technologies
Deng Xing-wang
Présidén, Sakola Élmu Pertanian Lanjutan Universitas Peking
09:15
Ningkatkeun rye, triticale sareng perbaikan gandum ku cara ngagunakeun sekuen génom rujukan kualitas luhur
Dina webinar ieu, Prof. Wang masihan kami apdet sakabéh ngeunaan status kiwari panalungtikan génomik triticeae sarta nunjukkeun kasuksésan sarta break-throughs tina dua karya beredar dina studi génom Rye, nu nembé diterbitkeun dina Nature Genetics sarta ngawanohkeun sakabeh panalungtikan. kelompok mingpin jeung nyumbang kana karya.
09:25
Génomics sereal @ IPK Gatersleben
Jukut sereal ti suku Triticeae geus jadi sumber kadaharan utama di wewengkon sedeng, nu geus lila dianggap salaku hotspot dina perbaikan pamotongan jeung beternak. Diantara sakabeh spésiés budidaya, suku ieu kasohor fitur génomik pisan kompléks maranéhna kaasup ukuran génom badag, eusi tinggi TEs, polyploidy, jsb Dina sési ieu, Prof Nils Stein masihan urang hiji bubuka sakabéh on IPK Gatersleben jeung status buckwheat kiwari. panalungtikan génomik @ IPK Gatersleben.
09:35
Rakitan génom skala kromosom nyadiakeun wawasan biologi rye, évolusi, sarta poténsi agronomic
Dr. M Timothy Rabanus-Wallace, Leibniz Institute of Plant Genetics and Plant Plan Research(IPK)Rye (Secale cereale L.) mangrupikeun pepelakan sereal anu tahan iklim anu luar biasa, dianggo sacara éksténsif pikeun ngahasilkeun variétas gandum anu ditingkatkeun ku hibridisasi introgrésif, sareng gaduh sadayana répertoar gén anu diperyogikeun pikeun ngaktifkeun beternak hibrida. Rye mangrupakeun allogamous sarta ngan nembe doméstikasi, nu masihan rye dibudidayakan aksés ka kolam renang gén liar rupa-rupa sarta exploitable. Pikeun ningkatkeun deui poténsi agronomic rye, kami ngahasilkeun rakitan annotated skala kromosom tina génom rye 7.9 Mbp, sareng sacara éksténsif disahkeun kualitasna nganggo set sumber genetik molekular. Kami nunjukkeun aplikasi sumberdaya ieu kalayan sajumlah panyilidikan. Urang nampilkeun papanggihan ngeunaan isolasi genetik teu lengkep Rye dibudidayakan ti baraya liar, mékanisme évolusi struktur génom, résistansi patogén, kasabaran suhu low, sistem kontrol kasuburan pikeun beternak hibrida, sarta kauntungan ngahasilkeun introgressions Rye-gandum.
10:05
Rakitan génom kualitas luhur nyorot ciri génomik rye sareng gen agronomis anu penting
Rye mangrupakeun kadaharan berharga jeung pamotongan forage, hiji sumberdaya genetik penting pikeun gandum jeung triticale pamutahiran, sarta bahan indispensable pikeun studi génomics komparatif efisien dina jukut. Di dieu, urang ngaruntuykeun génom rye Weining, rupa-rupa rye Cina elit. Contigs anu dirakit (7.74 Gb) ngitung 98.47% tina perkiraan ukuran génom (7.86 Gb), kalayan 93.67% tina contigs (7.25 Gb) ditugaskeun ka tujuh kromosom. Unsur repetitive ngawangun 90,31% tina génom dirakit. Dibandingkeun jeung Génom Triticeae saméméhna sequenced, Daniela, Sumaya na Sumana retrotransposons némbongkeun ékspansi kuat dina Rye. Analisis salajengna tina rakitan Weining masihan terang anyar ngeunaan duplikasi gen-lega génom sareng dampakna kana gén biosintésis pati, organisasi fisik lokus prolamin kompleks, fitur éksprési gén anu aya dina tret judul awal, sareng daérah kromosom anu aya hubunganana doméstikasi sareng lokus dina rye. Runtuyan génom ieu janji pikeun ngagancangkeun génomics sarta studi beternak rye sarta pepelakan sereal patali.
10:35
Tantangan, solusi sareng masa depan pikeun genom de Novo assembly
Génom kualitas luhur mangrupa dasar ulikan génomik. Sanajan kamajuan gancang dina urutan jeung algoritma geus empowered a leuwih basajan tur leuwih efisien assembly génom, sarat dina akurasi assembly sarta completeness ogé rising jeung deepening tujuan panalungtikan. Dina obrolan ieu kuring bakal ngabahas téknologi populér ayeuna dina assembly génom kalawan sababaraha kasus suksés tur nyandak glimpse tina ngembangkeun hareup.
waktos pos: Jan-08-2022