Evolusi genome
Ku putusan
Asalna évolusionér sareng Sejarah Domestication offfish (Karepatus Auratus)
Pacboo | Lengkerina | Peta gen gooman Hai-C Genome Ekemis | Meta genetik | GWAS | Rna-seq
Sorotan
11ddfish Aen diropéa janten vérsi anu cocog anu kualitas luhur, macét 95.75% tina Insigs janten 50 Usur ambiosomes (scafold s50 = 31.81 MB). Dua subgenomes anu diangkat.
Wewengkon 2. Rumpaka anu selektif nyapu nalika domestication diidentipikasi ti Dokterquencing data 201 individu, henteu pédah langkung ti 390 genu anu dipikaresep ku hubungan domestasi anu dipikaresep
3.gas dina dorsal dorsal dina lauk lauk domesticated ngungkabkeun 378 grease calon anu berpotensi. Wartawan Kiryin-protein
Kasang tukang
Kapenangfa (Karmus Auratus) mangrupikeun salah sahiji lauk pertanian anu paling penting, anu direubis tina karpét kolum di Cina kuno. Aranjeunna mairan ku Charles Darwin salaku "lulus dina babarangan warna ampir henteu jelas, kami pendak sareng modifikasi anu paling luar biasa tina struktur anu paling luar biasa". Fitur-fitur anu rupa pisan sareng sajarah panjang tina domestina sareng beternak ngadamel emas modél genetik anu nyalira pikeun fisologi lauk sareng évolusiin sareng evolusionf.
Prestasi
Genome Goldish
JAnalisis oint Pacbio sareng Lave data Pasina-tungtung-tungtung ngahasilkeun 1.657% G RENCAPLLE (CONIF N5 = 474 KB). Peta optikan Cionuo dibentuk sareng ngabenerkeun rapat kana 1,73 GB dina ukuran (diperkirakeun ukuran genome: 1.8 GB). Sadar As-U salajengna dugi ka phafolan ti 2 taun 606 kb dugi ka 31.84 MB sareng ngahontal 95% (1.75 G berorientasi sareng berorientasi sareng berorientasi sareng berorientasi sareng berorientasi sareng berorientasi sareng berorientasi sareng berorientasi sareng berorientasi sareng berorientasi sareng berorientasi sareng berorientasi sareng berorientasi sareng berorientasi sareng berorientasi sareng berorientasi sareng berorientasi sareng berorientasi sareng berorientasi sareng berorientasi sareng berorientasi sareng berorientasi. Genome diwangun ku 56,251 gen sareng 10,098 transkrip non-coding. Sumawona, 28yar-aréa daérah segromication diprediksi tina 50 kromatosom.
Grig.1 Lauk Gold
TWo beres set subgenomes dikenalkeun dina kritium 50 panas anu nyababkeun ti kagiatan hibridisasi kuno. Aturan kromosom sareng proporsi anu langkung luhur dibaca antara maskap lauk sareng Barbinee ditetepkeun salaku subginome a (Chra01 ~ A25), ie régulasi, sareng anu daérah).
Rumpakan domestication sareng tukang selektif
ATotal 16 Tingkat Ski Street Follia sareng 185 Partawan pakéan cai emas perumahan paké sareng jero pikasieuneun rata-rata kurang leuwih langkung 12,3 Terabasess. Ékonomi fylogenik sareng analisa PCA dikonfirmasi sarua antara emas umum umum anu diantarakeun lauk kuda, anu parantos dibagi jadi dua keturis.
LD Ealisa analisa di luhur opat subpopulasi ngadukung dina kaayaan botollencup genetik populasi dina domestikasi sareng layar anu kuat dina lauk laut. Ngaronjatkeun bahan bakar genetik (π) tina paley kolor kanggo masku umum langkung turun tina lauk panas sareng endog endog dituduhkeun akumulasi genetik waktu. 50 Wewengkon gikomik anu ngagulung anu nutupan 25.2 MB sareng 946 gas diidentifikasi tina data perwakilan (33 lauk mas sareng 16 anu cup). Ngalengkepan Analisis ka 201 individu, 393 Gen Wewengkon anu ditumpukeun. Gen ieu kapanggih tina kaleresan rendah, anu sigana disumbangkeun kana fénotypes anu aya hubunganana sareng sipat dominan utama dina lauk mas.
Grig.3 analisa anu aya hubungan anu pikaresepeun
Gwas dina lauk mas domestik
DFinal orsal mangrupikeun fitur konci anu ngabédakeun lauk mas lauk tina lauk mas. Gwas dorsal Foringkes 46 Wen Gula sareng 87 Lulfair endog disebarkeun 377 grafék minangka ti 13 kromosom anu dititénan. Analisis fungsional dina garis calon ieuor lampu produk-prosés biologis kaasup "Sinyal Chocrapor sélular", "Angkatan sistem brletressat", jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsb., Jsel
Fig.4 Gwas dorsal dorongan dina maskfish domesticated
In Gwas sipat-ciri-ciri anu aya hubunganana A gene ngalaksanakeun kiningkasanoat ninatine-protéin kinasi anu dicirikeun dina salah sahiji calon calon.
Fig.5 Gwas tina Skitét anu aya hubunganana
Rujukan
Chen d et al. Asalna sareng Sejarah Evolusiusionin Lagri (Karmassan Auratus). PNA (2020)
Wartos Tujuanana dina ngabagi kasus panganyarna sareng téknologi biomarker, mer tumugi prestasi éléktrék anyar ogé téknik pré penting diterapkeun dina ulikan.
Waktu Post: Jan-04-2022