Basis Nanopore Full-panjangna Transcriptome Sequencing
Sequencing nanopore ngabedakeun diri ti platform sequencing séjén, dina yén nukléotida dibaca langsung tanpa sintésis DNA sarta ngahasilkeun bacaan panjang dina puluhan kilobase. Ieu empowers maca-kaluar langsung tina transkrip full-panjangna jeung tackling tantangan dina studi transcriptomic.
√ Low runtuyan-spésifik bias
√ Pembacaan lengkep cDNA pikeun studi struktur gén
√ Kurang data anu diperyogikeun pikeun nutupan jumlah transkrip anu sami
√ Idéntifikasi sababaraha isoforms per gén
√ Kuantifikasi éksprési dina tingkat isoform
Pipa Bioinformatika has
Kasus Suksés Panganyarna sareng Biomarker Technologies
1. Analisis komparatif tina transkriptom panjang pinuh nembongkeun dinamika perkembangan batang Gnetum luofuense
Jurnal: Frontiers dina Genetika
Diterbitkeun: Mar 2021
Konci: Minion | splicing alternatif | APA | lncRNA | Transkrip anu dikedalkeun sacara béda
Baca Full-téks
2. Gerakan unidirectional RNA leutik ti pucuk ka akar dina heterografts interspésifik
Jurnal: Tutuwuhan Alam
Diterbitkeun: Januari 2021
Konci: Nanopore | Illumina | deteksi mRNA mobile pinuh-panjang
3. Analisis transkriptom panjang pinuh akar asparagus ngungkabkeun mékanisme molekular kasabaran uyah anu disababkeun ku jamur mycorrhizal arbuscular
Jurnal: Lingkungan sareng Botani Ékspérimén
Diterbitkeun: Januari 2021
Konci: Minion | Transkrip anu dikedalkeun sacara béda | Faktor transkripsi | Splicing alternatif
4. Parobahan Karakteristik Fisiologis sareng Transkriptom Panjang Mawar (Rosa chinensis) Akar sareng Daun pikeun Tanggapan Stress Halodo.
Jurnal: Tutuwuhan sareng Fisiologi Sél
Diterbitkeun: Oktober 2020
Konci: PromethION | Transkrip anu dikedalkeun sacara béda | prediksi fungsional | Isoforms disambung | TF jeung lncRNA
5. Analisis sareng ngabandingkeun komprehensif PacBio sareng sekuen RNA basis nanopore tina transkriptom Arabidopsis
Jurnal: Métode tutuwuhan
Diterbitkeun: April 2020
Konci: GridION | PromethION | PacBio Sequel | Illumina NovaSeq | alignment génom | Idéntifikasi Transkrip | splicing alternatif | SSR | LncRNA | Isoform kuantifikasi
News jeung Highlights Tujuanana pikeun ngabagi kasus suksés panganyarna sareng Biomarker Technologies, nyandak prestasi ilmiah novel ogé téknik anu diterapkeun nalika diajar.
waktos pos: Jan-08-2022