mRNA-seq (NGS) - De novo

Sequencing mRNA ngamungkinkeun profil sadaya transkrip mRNA dina sél dina kaayaan spésifik tur mangrupakeun téhnologi loba dipaké dina sagala rupa wewengkon panalungtikan. Pipa BMKCloud De novo mRNA-seq dirancang pikeun nganalisis perpustakaan sequencing anu diperkaya poly-A nalika henteu aya génom rujukan. Pipa dimimitian ku kadali kualitas, dituturkeun kude novoassembly transcript sarta seleksi set unigene. Analisis struktur unigene prédiksi runtuyan coding (CDS) jeung ulang runtuyan basajan (SSR). Salajengna, analisis éksprési diferensial manggih gén anu dikedalkeun sacara béda (DEGs) diantara kaayaan anu diuji, dituturkeun ku anotasi fungsional sareng pengayaan DEG pikeun nimba wawasan biologis.