Metagenomics (NGS)

Metagenomics Shotgun sareng Illumina mangrupikeun alat anu populer pikeun ngulik mikrobiom ku cara ngaruntuykeun DNA langsung tina conto kompleks, ngamungkinkeun ngulik karagaman taksonomi sareng fungsional. Pipa BMKCloud metagénomic (NGS) dimimitian ku kadali kualitas sareng rakitan metagénome, dimana gén diprediksi sareng dikelompokeun kana set data anu henteu kaleuleuwihan anu dijelaskeun pikeun fungsi sareng taksonomi nganggo sababaraha pangkalan data. Inpormasi ieu dianggo pikeun nganalisis karagaman taksonomi dina-sampel (karagaman alfa) sareng karagaman antar-sampel (karagaman béta). Analisis diferensial antara grup manggihan OTUs jeung fungsi biologis nu béda antara dua grup ngagunakeun duanana tés parametrik jeung non-paramétrik, bari analisis korelasi pakaitna béda ieu faktor lingkungan.