Analisis Asosiasi Génom-lega
Alur gawé
Kaunggulan Service
●Kaahlian éksténsif sareng rékaman publikasi: kalawan akumulasi pangalaman dina GWAS, BMKGene geus réngsé ratusan proyék spésiés dina populasi panalungtikan GWAS, ditulungan peneliti pikeun nyebarkeun leuwih ti 100 artikel, sarta faktor dampak kumulatif ngahontal 500.
● analisis bioinformatics komprehensif: workflow ngawengku analisis pakaitna SNP-tret, delivering susunan gén calon na annotation fungsi saluyu maranéhna.
●Tim bioinformatika anu terampil sareng siklus analisis pondok: kalawan pangalaman hébat dina analisis génomics canggih, tim BMKGene urang delivers analisis komprehensif kalawan waktu turnaround gancang.
●Dukungan Pasca Penjualan:Komitmen urang ngalegaan saluareun parantosan proyék kalayan periode jasa saatos-jualan 3-bulan. Salila ieu, kami nawiskeun nurutan proyék, bantuan ngungkulan, sareng sesi Q&A pikeun ngajawab patarosan naon waé anu aya hubunganana sareng hasil.
spésifikasi Service jeung sarat
| Jenis sequencing | Skala populasi anu disarankeun | Strategi sequencing | Syarat nukléotida |
| Sequencing génom sakabeh | 200 sampel | 10x | Konsentrasi: ≥ 1 ng/µL Jumlah total≥ 30ng Kawates atanapi henteu degradasi atanapi kontaminasi |
| Spésifik-Locus Amplified Fragment (SLAF) | Jero tag: 10x Jumlah tag: <400 Mb: WGS disarankeun <1Gb: 100K tag 1Gb > 2Gb: 300K tags Max 500k tag | Konsentrasi ≥ 5 ng/µL Jumlah total ≥ 80 ng Nanodrop OD260/280=1.6-2.5 Gél Agarose: henteu aya atanapi dugi ka degradasi atanapi kontaminasi
|
Pamilihan Bahan
Variétas béda, subspésiés, landraces / genebanks / kulawarga campuran / sumberdaya liar
Variétas béda, subspésiés, landraces
kulawarga satengah sib / kulawarga full-sib / sumberdaya liar
Aliran Gawé Palayanan
Desain ékspérimén
pangiriman sampel
ékstraksi RNA
Pangwangunan perpustakaan
Sequencing
Analisis data
jasa saatos-diobral
Ngawengku analisis di handap ieu:
- Analisis asosiasi génom-lega: LM, LMM, EMMAX, modél FASTLMM
- Anotasi fungsional gén calon
Analisis asosiasi SNP-trait - plot Manhattan
Analisis asosiasi SNP-tret - plot QQ
Jelajahi kamajuan anu difasilitasi ku jasa de GWAS BMKGene ngalangkungan koleksi publikasi anu dikurasi:
Lv, L. et al. (2023) 'Wawasan kana dasar genetik kasabaran amonia dina kerang agul Sinonovacula constricta ku ulikan asosiasi génom-lega',Budidaya, 569, kc. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
Li, X. et al. (2022) 'Analisis multi-omics tina 398 aksési gedang foxtail ngungkabkeun daérah génomik anu aya hubunganana sareng doméstikasi, sipat métabolit, sareng épék anti-radang',Tutuwuhan Molekul, 15(8), kaca 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. (2022) 'Pemetaan Asosiasi Genom-Wide ngeunaan Phenotypes Bieu pisan Hulless di Lingkungan Halodo',Frontiers dina Élmu Tutuwuhan, 13, kc. 924892. doi: 10.3389 / FPLS.2022.924892 / BIBTEX.
Zhao, X. et al. (2021) 'GmST1, anu ngodekeun sulfotransferase, masihan résistansi kana galur virus mosaik kedelé G2 sareng G3',Tutuwuhan, Sél & Lingkungan, 44(8), kaca 2777–2792. doi: 10.1111/PCE.14066.
