Analisis mRNA eukariot (berbasis rujukan sareng pilihan de novo sayogi)
Pipa ieu ngagunakeun data NGS RNA-Seq salaku input sarta ngahasilkeun hasil tina sababaraha analisis hilir kaasup tapi henteu diwatesan ku: sequencing assessment kualitas data,de novoanotasi situs transkripsi, analisis splicing variabel, analisis ekspresi diferensial, anotasi fungsi jeung analisis pengayaan.
Analisis RNA non-coding panjang
Long non-coding RNAs (lncRNA) nyaéta transkrip non-coding anu panjangna leuwih panjang batan 200 nt sarta dipikanyaho maénkeun peran dina organisasi jeung régulasi kromatin. Téknologi pangurutan throughput tinggi sareng bioinformatic parantos nguatkeun pamahaman urutan lncRNA sareng inpormasi posisi pikeun ngaidentipikasi lncRNA kalayan fungsi pangaturan anu penting. Pipa ieu nyadiakeun analisis lncRNA salian analisa disebutkeun dina pipa Analisis mRNA Eukariot.
16S / 18S / ITS amplicon sequencing
Pipa analisis karagaman mikroba Amplicon Sequencing dikembangkeun dumasar kana pangalaman mangtaun-taun dina analisis proyék keragaman mikroba. Pipa ngandung analisa dasar standar, anu nyertakeun eusi analisa arus utama panalungtikan mikroba ayeuna sareng analisa pribadi. Laporan analisa beunghar sareng komprehensif, kalayan pilihan pikeun ngalakukeun analisa pribadi anu béda. Salaku tambahan, conto sareng grup tiasa dirobih dina laleur pikeun kustomisasi sareng kontrol tambahan.
Analisis Metagenomics Shotgun
Jalur pipa Analisis Metagénomik Shotgun ngagunakeun data NGS tina bahan génomik campuran anu sasari tina sampel lingkungan. Analisa anu kalebet nyayogikeun inpormasi lengkep ngeunaan karagaman sareng kaayaanana spésiés, struktur populasi, hubungan filogenetik, gén fungsional, sareng jaringan korelasi sareng faktor lingkungan.
Analisis Varian NGS-WGS
Analisis Varian NGS-WGS mangrupikeun jalur pipa deteksi varian terpadu anu ngalaksanakeun kadali kualitas data, alignment urutan, anotasi, sareng analisa mutasi gen. Pipa ieu nuturkeun prakték pangsaéna GATK pikeun deteksi SNP sareng InDel sareng nganggo Manta pikeun nelepon varian struktural.
Studi Asosiasi Genom Wide (GWAS)
Pipa GWAS mangrupikeun analisa hilir anu nyandak file VCF anu didamel sateuacana sareng data fenotipe anu cocog pikeun cohort individu salaku input. Ngagunakeun metodologi statistik husus, GWAS boga tujuan pikeun manggihan variasi nukléotida génom-lega correlated kalawan béda phenotypic. Éta maénkeun peran anu penting dina ngajalajah gén fungsional anu aya hubunganana sareng panyakit manusa anu kompleks sareng sipat rumit dina pepelakan sareng sasatoan.
Analisis Segregation Bulk (BSA)
Analisis BSA ngalibatkeun pooling individu kalawan Tret phenotypic ekstrim ti populasi segregating. Ku ngabandingkeun lokus diferensial antara sampel pooled, pendekatan ieu gancang ngaidentipikasi spidol molekular numbu raket pakait sareng gén target. Loba dipaké dina pemetaan genetik tutuwuhan jeung sasatoan, éta alat berharga pikeun spidol-ditulungan beternak.
Analisis genetik évolusionér
Alur kerja Analisis Évolusionér Évolusi ngamangpaatkeun pangalaman éksténsif BMKGENE dina proyék évolusi genetik sareng kalebet konstruksi tangkal filogenetik, analisis disequilibrium linkage, penilaian keragaman genetik, idéntifikasi sapuan selektif, analisis kekerabatan, analisis komponén poko, sareng karakterisasi struktur populasi.
