Illumina perpustakaan pra-dijieun
Fitur
●Platform:Illumina NovaSeq 6000 sareng NovaSeq X Plus
●Modeu urutan:PE150 jeung PE250
●kadali kualitas perpustakaan saméméh sequencing
●Sequencing data QC sareng pangiriman:pangiriman laporan QC jeung data atah dina format fastq sanggeus demultiplexing na nyaring Q30 berbunyi
Kaunggulan Service
●Versatility jasa Sequencing:palanggan bisa milih urutan ku jalur, sél aliran, atawa ku jumlah data diperlukeun (sequencing jalur parsial).
●Pangalaman éksténsif dina platform urutan Illumina:kalawan rébuan proyék katutup kalayan sagala rupa spésiés.
●Pangiriman laporan sequencing QC:kalawan metrics kualitas, akurasi data jeung kinerja sakabéh proyék sequencing.
●Prosés sequencing dewasa:kalayan waktos péngkolan pondok.
●Kontrol Kualitas anu ketat: urang nerapkeun syarat QC ketat pikeun ngajamin pangiriman hasil kualitas luhur konsistén.
Platform Sampel
| Platform | Sél Aliran | Modeu sequencing | Unit | Diperkirakeun kaluaran |
| NovaSeq X | 10B (8 jalur) | PE150 | Hiji Jalur Sabagean Jalur | 375Gb / Jalur |
| 25B (8 jalur) | PE150 | Hiji Jalur Sabagean Jalur | 1000 Gb/Jalur | |
| NovaSeq 6000 | Sél Aliran SP (2 jalur) | PE250 | Sél Aliran Hiji Jalur Sabagean Jalur | 325-400 M dibaca / Jalur |
| S4 Aliran sél (4 jalur) | PE150 | Sél Aliran Hiji Jalur Sabagean Jalur | ~800 Gb / Jalur |
Sarat Sampel
| Jumlah Data (X) | Konsentrasi (qPCR/nM) | Jilid | |
| Parsial Lane Sequencing
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 25 μl | |
| Susunan Jalur | Per Jalur | ≥ 1,5 nM / Kolam perpustakaan | ≥ 25 μl / Kolam Perpustakaan |
Salian konsentrasi sareng jumlah total, pola puncak anu cocog ogé diperyogikeun.
Catetan: Runtuyan jalur perpustakaan diversity low merlukeun PhiX spike-in pikeun mastikeun panggero basa mantap.
Kami ngarékoméndasikeun ngirimkeun perpustakaan anu tos dihijikeun salaku conto. Upami anjeun peryogi BMKGENE pikeun ngalakukeun pooling perpustakaan, mangga tingal
sarat perpustakaan pikeun sequencing jalur parsial.
Ukuran Perpustakaan (peta Puncak)
Puncak utama kedah aya dina 300-450 bp.
Perpustakaan kedah gaduh puncak utama tunggal, teu aya kontaminasi adaptor sareng teu aya dimer primer.
Punten hubungi kami upami conto anjeun henteu nyumponan sarat bahan awal.
Alur Palayanan
Kontrol kualitas perpustakaan
Sequencing
Kontrol kualitas data
Pangiriman proyék
Laporan QC Perpustakaan
A laporan ngeunaan kualitas perpustakaan disadiakeun saméméh sequencing, assessing jumlah perpustakaan, sarta fragméntasi.
Sequencing laporan QC
Tabél 1. Statistik dina ngaruntuykeun data.
| ID sampel | BMKID | Atah maca | Data Atah (bp) | Bacaan beresih (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Gambar 1. Distribusi kualitas sapanjang maca dina unggal sampel
Gambar 2. Sebaran eusi dasar
Gambar 3. Distribusi eusi bacaan dina ngaruntuykeun data
