● Kalawan dua pilihan mungkin pikeun milih ti gumantung kana gelar dipikahoyong tina completeness génom.
● Pilihan Genome Draf: Sequencing pondok-baca jeung Illumina NovaSeq PE150.
● Lengkep 0 gap génom.
● Long-baca sequencing on Nanopore PromethION 48 atanapi PacBio Revio pikeun assembly génom.
● Short-baca sequencing on Illumina NovaSeq pikeun validasi génom jeung koreksi kasalahan (Nanopore) atawa keur ngahasilkeun draf génom.
●Zero-Gap Génom Dijamin: Ieu alatan integrasi Illumina sequencing kalawan lila dibaca sequencing (Nanopore atanapi PacBio).
●Alur Kerja Bioinformatika Lengkep:Ieu kalebet rakitan génom sareng prediksi sababaraha unsur génomik, anotasi gen fungsional, sareng visualisasi génom sapertos plot Circos.
●Kaahlian éksténsif: Kalawan leuwih 20.000 génom mikroba dirakit, BMKGENE brings leuwih dasawarsa pangalaman, tim analisis kacida terampil, eusi komprehensif, sarta rojongan pos-jualan alus teuing.
●Dukungan Pasca Penjualan:Komitmen urang ngalegaan saluareun parantosan proyék kalayan periode jasa saatos-jualan 3-bulan. Salila ieu, kami nawiskeun nurutan proyék, bantuan ngungkulan, sareng sesi Q&A pikeun ngajawab patarosan naon waé anu aya hubunganana sareng hasil.
●Sababaraha Strategi Sequencing Sadia:Pikeun tujuan panalungtikan anu béda-béda sareng sarat lengkepna génom.
Palayanan | Stratégi Sequencing |
Draf Génom | Illumina PE150 100x |
0 Génom Gap | Nanopore 100x + Illumina PE150 100x Or Pacbio HiFi 30x + Illumina PE150 100x (opsional) |
Konsentrasi (ng/µL) | Jumlah total (µg) | Volume (µL) | OD260/280 | OD260/230 | |
PacBio | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
Nanoporé | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
Illumina | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
· Baktéri: ≥3.5x1010 sél
Ngawengku analisis handap:
● Sequencing Data Quality Control
● Majelis Génom
● Analisis komponén génom: prediksi CDS jeung sababaraha elemen génomik
● Anotasi fungsional sareng sababaraha pangkalan data umum (GO, KEGG, jsb) sareng pangkalan data canggih (CARD, VFDB, jsb)
● Génom Visualisasi
Kami nyayogikeun génom dina format fasta anu gampang diakses sareng file anotasi génom (gff).
Anotasi gén - GO
Anotasi gen - karbohidrat CAZY
Génom visualisasi - Circos plot
Jelajahi kamajuan anu difasilitasi ku jasa perakitan génom baktéri BMKGene ngalangkungan koleksi publikasi anu dikurilingan.
Dai, W. et al. (2023) 'Papanggihan Bacteroides uniformis F18-22 salaku Baktéri Probiotik Aman sareng Novel pikeun Pangobatan Colitis Ulcerative tina Kolon Manusa Sehat',Jurnal Internasional Élmu Molekul, 24(19), kc. 14669. doi: 10.3390 / IJMS241914669 / S1.
Kang, Q. dkk. (2021) 'Proteus mirabilis tahan multidrug ngasingkeun mawa blaOXA-1 sareng blaNDM-1 ti satwa di Cina: ningkatkeun résiko kaséhatan masarakat',Zoologi Integratif, 16(6), kaca 798–809. doi: 10.1111 / 1749-4877.12510.
Wang, TT et al. (2017) 'Sekuen génom lengkep endophyte Bacillus flexus KLBMP 4941 ngungkabkeun mékanisme promosi pertumbuhan pepelakan sareng dasar genetik pikeun kasabaran uyah',Jurnal Biotéhnologi, 260, kaca 38–41. doi: 10.1016/J.JBIOTEC.2017.09.001.
Wang, X. et al. (2021) 'Plasmid Résistansi Multiple-Replicon of Klebsiella Mediate Disseminasi Éksténsif Gén Antimikrobial',Frontiers dina Mikrobiologi, 12, kc. 754931. doi: 10.3389 / FMICB.2021.754931 / BIBTEX.