● platform seedencing: Revio Pacbio
● Modeu Seedencing: CCS (HIFI maca)
● Kakuatan daérah udagan dituturkeun ku Tandem Callicale sareng Hifi persiapan perpustakaan SMRT
{Resolusi tukonomi anu langkung luhur: tHan pondok anu pondok-ampliquon,Ngaronjatkeun harga Chicufifikasi Otu anu langkung luhur di tingkat spésiés.
{Kadatangan Dasar Terbaut: Pacbio CCS COPS (HIFI maca).
{Bébas-gratis: Idéntitas komposisi anu gancang dina conto lingkungan.
{Laras: Studi komunitas micrtrial.
{Analisis bioinformatik komprehensif: Pakét Qiji2 panganyarna (wasios kuantitatif kana ékologi mikoboba) kalayan nganalisa dina kaayaan gumantung tina hal pangkalan data, utotasi, Ootv.
{Kaahlian éksténsif: Kalayan rébuan proyék berturut-kira-kira taunan ditanggung taun, bmkgene ngiringan dasawarsa pangalaman, hiji mantal terbatas, sareng dukungan pos anu langkung leres.
Perpustakaan | Strategi seaching | Data anu disarankeun |
ÉnékisanConika nu ampico. | Pacboo Revio | 10/30/50 k tag (ccs) |
Konsentrasi (ng / μl) | Jumlahna (μg) | Jilid (μl) |
Z5 | ≥0,3 | ≥20 |
Breazle sampel dina nitrogén cair pikeun 3-4 jam sareng nyimpen dina nitrogén ngandung atanapi -80 gelar ka tempat jangka panjang. Conto pengiriman sareng és garing diperyogikeun.
Ngawengku Analisis Di handap ieu:
● kontrol kualitas data atah
● Kilus OTu / de-bisik (asv)
● Anotasi otot
Kéngingkeun analisa babarisan alfa: Muhun indéks, kalebet Shannon, Sypson.
● Analisis béta
● Analisis aliran
● Analisis korélasi: antara faktor lingkungan sareng komposisi sareng kabébasan
● 16s prediksi gen
Somadat prebistribusi tajur
Tangkal phylogénétik Sebosok Komunitas
Analisitas Alfa Alpha: Ace
Analisitas béta
Analisis intervoup: Anova
Jelajah kana kamajuan anu dibere jasa tina file ampis BMKGGEe sareng Pacbio ngaliwatan koléksi publikasi anu diubur.
Gao, x. sareng Wang, H. (2023) 'Nalisis ngabandingkeun harga baktéri ruminal sareng fungsional salami dua tingkat Aquin. 9 (9 ( 1), p. 16. DOI: 10.3390 / fermentasi9010016 / s1.
Li, S. et al. (2023) 'Cacet perkakas gelut mikroba di taneuh gurun nganggo hama ngagunakeun ka metagenomis dumasar kultelics sareng ngan ukur révolusi', NPJRIGES 20: 1) 1-14), PP. Doi: 10.1038 / S41522-023-00439-8 .8.
Mu, l. et al. (2022) 'The uyah asam lemak dina karakteristik férméntasi, sakedap bahan baktéri sareng stabilitas aerobik tina alas cleabare cai, 14) 14), PP. 140 ti kaldis 1487. Doi: 10.1002 / JSFA.11482.
Yang, J et al. (2023) 'interaksi antara biomarya straindiatif sareng gos mikroba mikronomiant tina ekstrak tina sirtrar tina Sonchus Bachyotus DC. Dina Oaccholone-anu dikaluarkeun stres oksida peujicinalis di sawawa DiGAGAGish ', antioksidan 2023, vol. 12, halaman 192, 12 (1), p. 192. Doi: 10.3390 / Antix12010192.