Смањени репрезентација Бисулфите Секвенцинг (РРБС)
Смањено репрезентација Бисулфите Секвенцирање (РРБС) појавила се као економична и ефикасна алтернатива целокупном геному Бисулфите Секвенцинг (ВГБС) у истраживању метилације ДНК. Иако ВГБС пружа свеобухватне увиде испитивањем целог генома по једносној основној резолуцији, његова висока цена може бити ограничавајући фактор. РРБС стратешки ублажава овај изазов селективно анализирајући репрезентативни део генома. Ова методологија се ослања на обогаћивање региона богате ЦПГ-ом од стране МСПИ-овог цепара, а затим избор величине од 200-500 / 600 БПС фрагмената. Сходно томе, једини региони који су проксимални за ЦПГ острва секвенцирају се, док су оне са далеким ЦПГ острвима искључене из анализе. Овај поступак, у комбинацији са секвенцирањем бисулфита, омогућава препознавање високог резолуције ДНК метилације, а секвенцирање приступа, ПЕ150, посебно се фокусира на крајеве уметака, а не на средини, повећавајући ефикасност профилирања метилације. РРБС је непроцењиво средство које омогућава економично истраживање ДНК метилације и напредује знање о епигенетним механизмима.
Карактеристике услуге
● Потребан је референтни геномом.
● Ламбда ДНК се користи за праћење ефикасности конверзије бисулфита.
● Такође је праћена ефикасност дигестија МСПИ.
● Двоструко варење за ензим за узорке биљака.
● Секвенцирање на Иллумина НоваСек.
Предности услуга
●Економична и ефикасна алтернатива ВГБС-у: Омогућавање анализе да се спроведе по нижим ценама и са нижим захтевима узорка.
●Комплетна платформа:Обезбедите одличну услугу једне заустављања од обраде узорка, изградње библиотеке и редослед на анализу биоинформатике.
●Опсежна стручност: Са РРБС секвенцирањем пројеката успешно завршених у разноврсном распону врста, БМКгене доноси преко деценије искуства, високо квалификоване тиме за анализу, свеобухватан садржај и одличну подршку након продаје.
Спецификације услуга
| Библиотека | Стратегија за секвенцирање | Препоручени излаз података | Контрола квалитета |
| МСПИ ДИГЕДЕСТ и БИСУЛФИТЕ ЛИЦЕ БИБЛИКА | Иллумина пе150 | 8 ГБ | К30 ≥ 85% Конверзија бисулфита> 99% МСПИ Ефикасност сечења> 95% |
Захтеви за узорке
| Концентрација (НГ / μЛ) | Укупни износ (μг) |
| |
| ГЕНОМИЧКА ДНК | 30 | ≥ 1 | Ограничена деградација или контаминација |
Сервисни радни проток
Достава узорака
Изградња библиотеке
Секвенцирање
Анализа података
Услуге након продаје
Укључује следећу анализу:
● контрола квалитета сировине;
● мапирање до референтног генома;
● Откривање 5МЦ метилираних основа и идентификације мотива;
● Анализа дистрибуције метилације и поређења узорка;
● Анализа различито метилираних региона (ДМРС);
● Функционална напомена гена повезаних са ДМРС-ом.
Контрола квалитета: Ефикасност варења (у мапирању генома)
Контрола квалитета: Конверзија бисулфита (у информисању метилације)
Мапа метилације: 5МЦ дистрибуција раширених метилације
Поређење узорка: Главна анализа компоненте
Различитају анализу метилираних региона (ДМРС): Топлота
Истражите напредовање истраживања олакшаних БМКгеновим целокупним геномом Бисулфите Сервицес Сервицес кроз курирану збирку публикација.
ЛИ, З. и др. (2022) 'Репрограмирање високог верности у ћелије сличне леидиг-у од стране ЦрисПР активације и паракрин фактора',ПНАС НЕКСУС, 1 (4). Дои: 10.1093 / ПНАСНЕКСУС / ПГАЦ179.
Тиан, Х. ет ал. (2023) 'Анализа метилације ширине генома ширине димензије телесног састава у кинеским монозиготским близанцима',Европски часопис за клиничку истрагу, 53 (11), стр. Е14055. Дои: 10.1111 / ЕЦИ.14055.
Ву, И. ет ал. (2022) 'ДНК метилацију и омјер струка до кука: Студија удруживања широм епигеноме у кинеским монозиготским близанцима',Часопис ендокринолошке истраге, 45 (12), стр. 2365-2376. Дои: 10.1007 / С40618-022-01878-4.
