Прокариотично РНА секвенцирање
Карактеристике
● Обрада узорака РНА је укључивала исцрпљивање РРНА, а затим припрема усмерених РНА библиотека.
● Биоинформатична анализа на основу поравнања референтног генома
● Анализа укључује експресију гена и деаге, али и структуру транскрипта и СРНА анализу
Предности услуга
●Строго контрола квалитета: Имолишемо основне контролне тачке у свим фазама, од узорка и припреме библиотеке у секвенцирање и биоинформатику. Ово пажљиво надгледање осигурава испоруку константних резултата високог квалитета.
●Подаци о секвенцирању на прамену: Због припреме библиотеке РНА који је усмерен, омогућавајући идентификацију транскрипата против осећаја.
●Комплетна анализа прилагођена прокариотским транскрипту: Биоинформатични нафтовод укључује не само анализу експресије гена, већ и анализу структуре транскрипта, укључујући идентификацију опероне, УТРС и промотора. Такође укључује анализу СРНАС-а, наиме напомене и предвиђање секундарне структуре и циљева.
●Подршка за после продаје: Наша посвећеност се проширује изван завршетка пројекта са тромесечном роком након продаје. За то време нудимо праћење пројекта, помоћ у решавању помоћи и питања и питања и питања за решавање било којег упита везаних за резултате.
Узорак захтева и испорука
| Библиотека | Стратегија за секвенцирање | Препоручује се подаци | Контрола квалитета |
| РРНА је исцрпљена усмерена библиотека | Иллумина пе150 | 1-2 ГБ | К30≥85% |
Узорак захтева:
| Конц. (НГ / μЛ) | Износ (μг) | Чистоћа | Интегритет |
| ≥ 50 | ≥ 1 | ОД260 / 280 = 1.8-2.0 ОД260 / 230 = 1,0-2.5 Ограничена или без загађења протеина или ДНК приказана на гелу. | РИН≥6.5 |
Препоручена испорука узорка
Контејнер: 2 мл Центрифуга цев (Тин фолија се не препоручује)
Означавање узорка: Група + поновна реликација, нпр. А1, А2, А3; Б1, Б2, Б3.
Пошиљка:
1. суви лед: узорци морају бити упаковани у кесе и закопане у сувом леду.
2 РНАПДАБЛЕ ЦЕПОВЕ: РНА узорци се могу осушити у цијеви РНА стабилизације (нпр. Рнастабле®) и испоручује се на собној температури.
Сервисни радни проток
Достава узорака
Изградња библиотеке
Секвенцирање
Анализа података
Услуге након продаје
Биоинформатична анализа рада
Укључује следећу анализу:
● Контрола квалитета квалитета скупа података
● Поравнање референтног генома
● Процена квалитета библиотеке: РНА фрагментација насумичности, убаците величину и подешавање засићења
● Функционална напомена предвиђених гена за кодирање
● Анализа израза: Анализа корелације и главне компоненте (ПЦА)
● Диференцијални експресијски ген (дег)
● Функционална напомена и обогаћивање дег
● СРНА Анализа: Предвиђање, напомена, циља и средња структура Предвиђање
● Анализа структуре транскрипта: Оперови, покретање и завршне позиције, непрекинута регија (УТС), промотор и СНП / Индел анализа
Секвенцирање засићености
Функционална напомена кодирања гена
Корелација између узорака
Диференцијални изражени гени (Дегс) анализа
Функционална анализа обогаћивања
СРНА АННАТИОН
Истражите напредне напредне БМКгене'с Нанопоре цијелокупне услуге РРНА Секвенцирање у овој представљеној публикацији.
Гуан, ЦП и др. (2018) 'Глобалне транскриптене промене биофилм-формирања стафилокока епидермида који реагују на тоталне алкалоиде сопхореа алопецуроидес',Пољски часопис за микробиологију, 67 (2), стр. 223. Дои: 10.21307 / ПЈМ-2018-024.
