Хеатмап
Алат Хеатмап прихвата датотеку матричних података као улаз и омогућава корисницима да филтрирају, нормализују и групишу податке. Примарни случај употребе топлотних мапа је кластер анализа нивоа експресије гена између различитих узорака.
Гене Аннотатион
Алат Гене Аннотатион врши анотацију гена на основу поравнања секвенци улазних ФАСТА датотека у односу на различите базе података.
Основни алат за претрагу локалног поравнања (БЛАСТ)
Алат БЛАСТ је БМКЦлоуд интегрисана верзија НЦБИ БЛАСТ-а и може се користити за обављање истих функција користећи податке отпремљене на БМКЦлоуд налог.
ЦДС_УТР Предвиђање
Алат за предвиђање ЦДС_УТР је дизајниран да предвиди кодирајуће регионе (ЦДС) и некодирајуће регионе (УТР) у датим секвенцама транскрипта на основу БЛАСТ резултата у односу на познате базе података протеина и исхода предвиђања ОРФ.
Манхаттан Плот
Алат Манхаттан Плот омогућава приказ експеримената са великим узорком и обично се користи у студијама асоцијација на нивоу генома (ГВАС).
Цирцос Диаграм
Алат ЦИРЦОС Диаграм пружа ефикасну визуализацију како су геномске карактеристике распоређене по геному. Заједничке карактеристике укључују квантитативне локусе, СНП, ИнДелс, структурне и варијанте броја копија.
Обогаћивање генске онтологије (ГО).
Алат ГО Енрицхмент пружа функционалну анализу обогаћивања. Примарни софтвер у овом алату је пакет ТопГО-Биоцондуцтор, који укључује анализу диференцијалне експресије, анализу ГО обогаћивања и визуелизацију резултата.
Анализа мреже пондерисане коекспресије гена (ВГЦНА)
ВГЦНА је широко коришћен метод рударења података за откривање модула коекспресије гена. Применљив је на различите скупове података о експресији, укључујући податке о експресији гена за микромреже и НГС.
ИнтерПроСцан
Алат ИнтерПроСцан пружа анализу и класификацију секвенце протеина ИнтерПро.
ГО КЕГГ Енрицхмент
ГО КЕГГ алат за обогаћивање је дизајниран да генерише ГО хистограм обогаћивања, КЕГГ хистограм обогаћивања и КЕГГ пут обогаћивања на основу обезбеђеног скупа гена и одговарајуће напомене.